技術(shù)特征:1.一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述步驟(1)的具體為:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述步驟(3)的具體步驟為:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述步驟(3.1)的具體步驟為:
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述步驟(3.2)的具體步驟為:
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種納米孔測序快速讀出短片段的dna存儲方法,其特征在于,所述步驟(3.3)的具體步驟為:
技術(shù)總結(jié)本發(fā)明公開了一種納米孔測序快速讀出短片段的DNA存儲方法,該方法采用分組碼編碼信息序列,碼字片段稀疏化與已知的偽隨機(jī)序列疊加,組合等長編碼比特序列后映射為數(shù)據(jù)DNA序列,采用偽隨機(jī)序列伴隨短分組糾錯(cuò)碼構(gòu)造標(biāo)號DNA序列;針對納米孔測序,利用引物識別與標(biāo)號識別實(shí)現(xiàn)測序讀段快分簇,構(gòu)建隱馬爾可夫模型,前向?后向算法推斷最大符號概率,對簇內(nèi)的讀段執(zhí)行上層比特序列合并,糾正插入刪節(jié)錯(cuò)誤,得到一致性上層比特序列,并糾正簇內(nèi)下層比特序列;計(jì)算一致性序列的似然概率,執(zhí)行軟判決糾錯(cuò)譯碼,恢復(fù)原始數(shù)據(jù)。本發(fā)明能夠有效利用納米孔測序快速讀出短片段DNA,其優(yōu)勢在于使用一種基于概率的多序列合并方法,糾正納米孔測序的高插入刪節(jié)錯(cuò)誤。
技術(shù)研發(fā)人員:陳為剛,郭全,劉雙,秦蕊,韓昌彩
受保護(hù)的技術(shù)使用者:天津大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:技術(shù)公布日:2025/1/9