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生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的重組菌及其制備方法與應(yīng)用與流程

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生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的重組菌及其制備方法與應(yīng)用與流程
本發(fā)明涉及生物
技術(shù)領(lǐng)域
,具體涉及生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的重組菌及其制備方法與應(yīng)用。
背景技術(shù)
:L-2-氨基丁酸是抑制人體神經(jīng)信息傳遞的脂肪族氨基酸,具有降低血氨,加強(qiáng)葡萄糖磷酸酯酶的活性,促進(jìn)腦細(xì)胞代謝等功能,臨床可用于腦血管病后遺癥的治療和牙科的無(wú)痛去齲。此外,L-2-氨基丁酸還是一種重要的化工原料和醫(yī)藥中間體,已廣泛應(yīng)用于抗結(jié)核藥物鹽酸乙胺丁醇和抗癲癇藥物左乙拉西坦等的合成。L-2-氨基丁酸的生產(chǎn)方法主要分為化學(xué)法、酶法和微生物發(fā)酵法。化學(xué)法主要包括脫硫反應(yīng)法、正丁酸鹵代反應(yīng)法、丁酮酸還原法等。化學(xué)法研究起步較早,雖然工藝成熟,但化學(xué)合成法存在耗能高、環(huán)境污染大、生產(chǎn)成本高等缺點(diǎn),不利于工業(yè)化應(yīng)用;微生物發(fā)酵法指利用大腸桿菌等微生物直接發(fā)酵生產(chǎn)L-2-氨基丁酸。目前,國(guó)外對(duì)于微生物發(fā)酵法合成L-2-氨基丁酸的研究有一篇報(bào)道(ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesoftheUnitedStatesofAmerica,2010,107(14):6234-6239.),該報(bào)道在傳統(tǒng)誘變菌種大腸桿菌ATCC98082的基礎(chǔ)上通過(guò)突變篩選谷氨酸脫氫酶及過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶構(gòu)建了一株L-2-氨基丁酸的工程菌,但該工程菌L-2-氨基丁酸產(chǎn)量只有5.4g/L,與實(shí)現(xiàn)工業(yè)化應(yīng)用存在較大差距。中國(guó)專(zhuān)利201210015308.4在蘇氨酸高產(chǎn)菌株的基礎(chǔ)上,通過(guò)過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶與氨基酸脫氫酶合成L-2-氨基丁酸,但該方法發(fā)酵60h,L-2-氨基丁酸產(chǎn)量只有20g/L,仍無(wú)法適應(yīng)工業(yè)化生產(chǎn)需求;酶法制備L-2-氨基丁酸主要分為轉(zhuǎn)氨酶法、脫氫酶法、氨基?;阜?、氨基氧化酶法等。脫氫酶法是指2-酮丁酸在脫氫酶的催化作用下合成L-2-氨基丁酸。Galkin和Kulakova等利用大腸桿菌共表達(dá)L-亮氨酸脫氫酶和甲酸脫氫酶,其中L-亮氨酸脫氫酶能夠催化丁酮酸和NH3生產(chǎn)L-2-氨基丁酸,甲酸脫氫酶以甲酸銨為底物再生NADH,釋放出二氧化碳和NH3(AppliedandEnvironmentalMicrobiology,1997,63(12):4651-4656.),此法生產(chǎn)L-2-氨基丁酸濃度達(dá)到36g/L,轉(zhuǎn)化率大于80%。但該方法以2-酮丁酸為原料,大大提高了原料成本,導(dǎo)致生產(chǎn)成本較高,限制了該工藝的工業(yè)化應(yīng)用。中國(guó)專(zhuān)利201210066624.4和201010139227.6等報(bào)道了以L-蘇氨酸為原料,先由蘇氨酸脫氨酶轉(zhuǎn)化成2-酮丁酸,再由亮氨酸脫氫酶催化2-酮丁酸合成L-2-氨基丁酸,反應(yīng)中加入輔酶再生體系。由于專(zhuān)利中所用酶催化劑需要克隆表達(dá)后經(jīng)細(xì)胞破碎提取或直接購(gòu)買(mǎi),大大增加了生產(chǎn)成本,不利于推廣應(yīng)用。轉(zhuǎn)氨酶法是指2-酮丁酸在轉(zhuǎn)氨酶的催化作用下合成2-氨基丁酸(圖1)。1999年,F(xiàn)otheringham等利用大腸桿菌K12菌株過(guò)表達(dá)酪氨酸轉(zhuǎn)氨酶、蘇氨酸脫氨酶及乙酰乳酸合成酶,以L-蘇氨酸和L-天冬氨酸為底物通過(guò)轉(zhuǎn)氨反應(yīng)合成了L-2-氨基丁酸,同時(shí)通過(guò)乙酰乳酸合成酶消除副產(chǎn)物丙酮酸(Bioorganic&MedicinalChemistry,1999,7(10):2209-2213.)。但是該法生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的轉(zhuǎn)化率僅為54%,產(chǎn)量?jī)H為27.8g/L,且轉(zhuǎn)化過(guò)程中產(chǎn)生副產(chǎn)物NH3、L-丙氨酸和3-羥基-2-丁酮,由于L-2-氨基丁酸與副產(chǎn)物丙氨酸性質(zhì)相似,導(dǎo)致該法制備的2-氨基丁酸純化較為困難。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的是提供能夠提高L-2-氨基丁酸產(chǎn)量的重組菌及其制備方法,以及利用重組菌生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的方法。為此,本發(fā)明一方面提供一種生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的重組菌,所述重組菌為同時(shí)過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶和谷氨酸脫氫酶的菌株。在上述技術(shù)方案中,所述蘇氨酸脫氨酶的氨基酸序列為SEQIDNo.2或SEQIDNo.5所示,所述轉(zhuǎn)氨酶的氨基酸序列為SEQIDNo.7、SEQIDNo.9、SEQIDNo.11或SEQIDNo.13所示,所述谷氨酸脫氫酶的氨基 酸序列為SEQIDNo.15所示;所述蘇氨酸脫氨酶的基因序列為SEQIDNo.1中10~1554位或SEQIDNo.3中10~999位所示,所述轉(zhuǎn)氨酶的基因序列為SEQIDNo.6中22~951位、SEQIDNo.8中15~1208位、SEQIDNo.10中9~1388位或SEQIDNo.12中9~1262位所示,所述谷氨酸脫氫酶的基因序列為SEQIDNo.14中177~1520位所示。在上述技術(shù)方案中,所述重組菌的出發(fā)菌為埃希氏菌屬的細(xì)菌,優(yōu)選為大腸桿菌(Escherichiacoli),更優(yōu)選為E.coliBL21(DE3)。本發(fā)明的另一方面,提供一種制備L-2-氨基丁酸重組菌的方法,包括如下步驟:同時(shí)過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶,得到所述重組菌。在上述技術(shù)方案中,所述過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶通過(guò)如下步驟實(shí)現(xiàn):增加出發(fā)菌中蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶基因的拷貝數(shù)。在上述技術(shù)方案中,所述方法進(jìn)一步包括將所述出發(fā)菌的谷氨酸脫氫酶基因的啟動(dòng)子替換為具有更強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性的元件,和/或?qū)⑺龀霭l(fā)菌的蘇氨酸脫氨酶基因的核糖體結(jié)合位點(diǎn)替換為具有更強(qiáng)翻譯活性的元件。所述更強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性的元件和更強(qiáng)翻譯活性的元件可為任何轉(zhuǎn)錄活性較高的元件和任何翻譯活性較高的元件,例如本發(fā)明中使用的RBS(SEQIDNo.4中33-39bp核苷酸序列)和強(qiáng)啟動(dòng)子T7(SEQIDNo.14中85-109bp核苷酸序列)。在上述技術(shù)方案中,通過(guò)攜帶所述蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶基因的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化所述出發(fā)菌來(lái)增加所述出發(fā)菌中蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶基因的拷貝數(shù);攜帶蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶基因的表達(dá)質(zhì)粒沒(méi)有限制,可以是任何能夠高效表達(dá)目的蛋白的質(zhì)粒;優(yōu)選地,所述質(zhì)粒為pET28a。在上述技術(shù)方案中,所述蘇氨酸脫氨酶的基因序列為SEQIDNo.1中10~1554位或SEQIDNo.3中10~999位所示,所述轉(zhuǎn)氨酶的基因序列為SEQIDNo.6中22~951位、SEQIDNo.8中15~1208位、SEQIDNo.10中9~1388位或SEQIDNo.12中9~1262位所示,所述谷氨酸脫氫酶的基因序列為SEQIDNo.14中177~1520位所示。其中,所述蘇氨酸脫氨酶選自但不限于大腸桿菌、芽胞桿菌,轉(zhuǎn)氨酶選自但不限于大腸桿菌、芽胞桿菌。谷氨酸脫氫酶選自但不限于,大腸桿菌。所述大腸桿菌蘇氨酸脫氨酶可以為合成型蘇氨酸脫氨酶IlvA或分解型蘇氨酸脫氨酶TdcB;所述芽胞桿菌蘇氨酸脫氨酶可以為枯草芽胞桿菌蘇氨酸脫氨酶IlvA。所述大腸桿菌轉(zhuǎn)氨酶可以為支鏈氨基酸氨基轉(zhuǎn)移酶IlvE、丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶AvtA、酪氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶TyrB、腐胺氨基轉(zhuǎn)移酶PatA。所述芽胞桿菌轉(zhuǎn)氨酶可以為支鏈氨基酸氨基轉(zhuǎn)移酶IlvK、轉(zhuǎn)氨酶PatA或磷酸絲氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶SerC。谷氨酸脫氫酶為大腸桿菌谷氨酸脫氫酶GdhA。在上述技術(shù)方案中,所述出發(fā)菌為選自埃希氏菌屬的細(xì)菌,優(yōu)選為大腸桿菌(Escherichiacoli),更優(yōu)選為E.coliBL21(DE3)。本發(fā)明的再一方面,提供一種利用上述任意一項(xiàng)所述的重組菌生產(chǎn)L-2-氨基丁酸的方法,包括如下步驟:A)培養(yǎng)重組菌,在所述重組菌的對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的中期,進(jìn)行異丙基硫代半乳糖苷誘導(dǎo),異丙基硫代半乳糖苷誘導(dǎo)濃度為0.01mmol/L~1mmol/L,繼續(xù)培養(yǎng)至菌體對(duì)數(shù)生長(zhǎng)后期或穩(wěn)定期前期對(duì)培養(yǎng)的菌體進(jìn)行離心,收集菌體;B)以緩沖液攪拌懸浮步驟A)中收集的重組菌,直接利用菌體細(xì)胞在底物蘇氨酸和氨基供體谷氨酸存在下進(jìn)行催化生產(chǎn)。所述底物蘇氨酸濃度為0.1~300g/L,谷氨酸為5~150g/L,催化條件為37℃、pH為6.0~7.5、DO為20%~60%。本發(fā)明的實(shí)驗(yàn)證明,與現(xiàn)有的L-2-氨基丁酸生產(chǎn)方法相比具有以下優(yōu)點(diǎn):(1)、本發(fā)明的重組菌通過(guò)過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶、谷氨酸脫氫酶,可以利用蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶、谷氨酸脫氫酶三酶催化體系生產(chǎn)L-2-氨基丁酸,實(shí)現(xiàn)了催化副產(chǎn)物α-酮戊二酸的循環(huán)利用,進(jìn)而提高了底物氨基供體的利用率,有效提高了L-2-氨基丁酸的產(chǎn)量和底物轉(zhuǎn)化率。(2)本發(fā)明全部采用過(guò)表達(dá)關(guān)鍵酶的全細(xì)胞進(jìn)行催化反應(yīng),避免了酶催化劑的提取等過(guò)程,簡(jiǎn)化了生產(chǎn)工藝。附圖說(shuō)明參考以下附圖,將有助于更好地理解本發(fā)明的方案及有益效果。圖1為轉(zhuǎn)氨酶法制備L-2-氨基丁酸的反應(yīng)原理圖。圖2為本發(fā)明制備L-2-氨基丁酸的反應(yīng)原理圖。圖3為本發(fā)明實(shí)施例提供的表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB的示意圖。圖4為本發(fā)明實(shí)施例提供的表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB-ilvE的示意圖。圖5為本發(fā)明實(shí)施例提供的SDS-PAGE蛋白檢測(cè)圖。圖6為本發(fā)明實(shí)施例提供的表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB-ilvE-gdhA的示意圖。具體實(shí)施方式為了便于理解,以下將通過(guò)具體的實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行詳細(xì)地描述。需要特別指出的是,這些描述僅僅是示例性的描述,并不構(gòu)成對(duì)本發(fā)明范圍的限制。依據(jù)本說(shuō)明書(shū)的論述,本發(fā)明的許多變化、改變對(duì)所屬領(lǐng)域技術(shù)人員來(lái)說(shuō)都是顯而易見(jiàn)的。另外,本發(fā)明引用了公開(kāi)文獻(xiàn),這些文獻(xiàn)是為了更清楚地描述本發(fā)明,它們的全文內(nèi)容均納入本文進(jìn)行參考,就好像它們的全文已經(jīng)在本文中重復(fù)敘述過(guò)一樣。下述實(shí)施例中所使用的實(shí)驗(yàn)方法如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等,如無(wú)特殊說(shuō)明,均可從商業(yè)途徑得到。下述實(shí)施例中如未特別指明,實(shí)施例中所用的技術(shù)手段為本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的常規(guī)手段和市售的常用儀器、試劑,可參見(jiàn)《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南(第3版)》(科學(xué)出版社)、《微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)(第4版)》(高等教育出版社)以及相應(yīng)儀器和試劑的廠商說(shuō)明書(shū)等參考。以下結(jié)合具體實(shí)施例,對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步說(shuō)明。應(yīng)理解,以下實(shí)施例僅用于說(shuō)明本發(fā)明而非用于限制本發(fā)明的范圍。實(shí)施例1、L-2-氨基丁酸初級(jí)工程菌ABA1和ABA2的構(gòu)建一、蘇氨酸脫氨酶表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶催化蘇氨酸脫氨生產(chǎn)2-酮丁酸,過(guò)表達(dá)蘇氨酸脫氨酶,促進(jìn)蘇氨酸向2-酮丁酸的轉(zhuǎn)化。根據(jù)Genbank中E.coliK12W3110的ilvA基因設(shè)計(jì)引物,以E.coliK12W3110基因組為模板,分別以WY1423、WY1424為引物,使用高保真聚合酶KAPAHiFiTMHotStar進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR按如下方式進(jìn)行:94℃變性30s(秒),54℃退火30s(秒),以及72℃延伸30s(秒)(30個(gè)循環(huán)),PCR擴(kuò)增得到1560bp的PCR產(chǎn)物(序列1),將PCR獲得的DNA片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離純化,回收片段經(jīng)NdeI和BamHI雙酶切后,與同樣雙酶切處理的表達(dá)載體pET28a(購(gòu)自Novagen公司)連接。連接產(chǎn)物采用化學(xué)轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α,在含卡那霉素(50μg/mL)的LB平板上篩選轉(zhuǎn)化子,轉(zhuǎn)化子傳代培養(yǎng)三代后,以WB923和WB924為引物,采用菌落PCR鑒定轉(zhuǎn)化子,得到1845bp為陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,對(duì)鑒定正確的轉(zhuǎn)化子提取質(zhì)粒,并對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行NdeI和BamHI雙酶切鑒定,得到1560bp酶切片段的為正確質(zhì)粒。將PCR和酶切鑒定正確的質(zhì)粒送去測(cè)序,結(jié)果該質(zhì)粒為將序列表中序列1所示的核苷酸插入載體pET28a中得到的重組質(zhì)粒,命名為pET28a-ilvA。ilvA為合成型蘇氨酸脫氨酶基因,其基因序列為序列表中序列1中10~1554位所示。以E.coliK12W3110基因組為模板,分別以WY1422、WY997為引物,擴(kuò)增得到1035bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.3),按照上述同樣的方法,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB(圖3)。tdcB為分解型蘇氨酸脫氨酶基因,其基因序列為序列表中序列3中10~999位所示。上述所用的引物序列如下:WY1423:GGAATTCCATATGGCTGACTCGCAACCCCT(NdeI)WY1424:CGGGATCCCTAACCCGCCAAAAAGAACC(BamHI)WB923:TAATACGACTCACTATAGGGWB924:TGCTAGTTATTGCTCAGCGGWY1422:GGAATTCCATATGCATATTACATACGATCTGCC(NdeI)WY997:CGCGGATCCAGTACTCATATCCTATCCTC(BamHI)二、支鏈氨基酸氨基轉(zhuǎn)移酶表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建支鏈氨基酸轉(zhuǎn)移酶催化2-酮丁酸轉(zhuǎn)氨生成L-2-氨基丁酸。在脫氨酶催化蘇氨酸生成2-酮丁酸的基礎(chǔ)上,過(guò)表達(dá)支鏈氨基酸轉(zhuǎn)移酶以催化2-酮丁酸生成L-2-氨基丁酸。以E.coliK12W3110基因組為模板,以WY998、WY1403為引物,擴(kuò)增得到979bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.6);按照實(shí)施例1中所述方法,構(gòu)建蘇氨酸轉(zhuǎn)氨酶表達(dá)質(zhì)粒pET28a-ilvE。ilvE基因編碼支鏈氨基酸氨基轉(zhuǎn)移酶,其基因序列為序列表中SEQIDNo.6中22~951位所示。WY998:CGCGGATCCAGAAGGAGATATACCATGACCACGAAGAAAGCTGA(BamHI)WY1403:ACGCGTCGACCGTGCCGTCCCATTTTTTGT(SalI)三、蘇氨酸脫氨酶及轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建將已構(gòu)建的質(zhì)粒pET28a-tdcB和pET28a-ilvE分別用SalI和BamHI雙酶切,回收酶切片段pET28a-tdcB與ilvE進(jìn)行連接。連接產(chǎn)物采用化學(xué)轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α,在含卡那霉素(50μg/mL)的LB平板上篩選轉(zhuǎn)化子,轉(zhuǎn)化子傳代培養(yǎng)三代后,以WY998和WB924為引物,采用菌落PCR鑒定轉(zhuǎn)化子,得到1084bp為陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,對(duì)鑒定正確的轉(zhuǎn)化子提取質(zhì)粒,并對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行SalI和BamHI雙酶切鑒定,得到979bp酶切片段的為正確質(zhì)粒。將PCR和酶切鑒定正確的質(zhì)粒送去測(cè)序,結(jié)果該質(zhì)粒為將序列表中SEQIDNo.6所示核苷酸插入載體pET28a-tdcB中得到的重組質(zhì)粒,命名為pET28a-tdcB-ilvE(圖4)。按照上述同樣的方法,利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-ilvA和pET28a-ilvE,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶與轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒pET28a-ilvA-ilvE。四、L-2-氨基丁酸初級(jí)工程菌的構(gòu)建將已構(gòu)建好的質(zhì)粒pET28a-tdcB-ilvE電轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中,將該菌株命名為ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)。利用SDS-PAGE檢測(cè)蛋白表達(dá)情況(圖5)。SDS-PAGE檢測(cè)結(jié)果顯示,構(gòu)建的表達(dá)質(zhì)粒中蘇氨酸脫氨酶與轉(zhuǎn)氨酶均已表達(dá)。按照上述同樣的方法,構(gòu)建L-2-氨基丁酸初級(jí)工程菌株ABA2(BL21/pET28a-ilvA-ilvE)。實(shí)施例2、L-2-氨基丁酸初級(jí)工程菌全細(xì)胞催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸利用L-2-氨基丁酸初級(jí)工程菌ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)、ABA2(BL21/pET28a-ilvA-ilvE)催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸。種子培養(yǎng)基具體如下:蛋白胨10g/L,酵母粉5g/L,NaCl10g/L;卡那霉素50mg/L。菌體生長(zhǎng)階段培養(yǎng)基具體如下:酵母粉,10.00g/L;K2HPO4·3H2O,0.90g/L;KH2PO4,1.14g/L;(NH4)2SO4,10.00g/L;MgSO4·7H2O,0.30g/L;微量元素(TMS)儲(chǔ)液,5.00mL/L。其中TMS儲(chǔ)液:FeSO4·7H2O,10.000g/L;CaCl2,1.350g/L;ZnSO4·7H2O,2.250g/L;MnSO4·4H2O,0.500g/L;CuSO4·5H2O,1.000g/L;(NH4)6Mo7O24·4H2O,0.106g/L;Na2B4O7·10H2O,0.230g/L;CoCl2·6H2O,0.480g/L;35%HCl,10.000mL/L。緩沖液:KH2PO4,1.36g/L;Na2HPO4,5.67g/L。菌體催化階段培養(yǎng)基具體如下:MgSO4·7H2O,0.50g/L;(NH4)2SO4,5.00g/L;KH2PO4,1.36g/L;Na2HPO4,5.67g/L;蘇氨酸,50.00g/L;谷氨酸,10.00g/L。(一)、種子液的獲得將工程菌ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)和ABA2(BL21/pET28a-ilvA-ilvE)接種到種子培養(yǎng)基中,種子液培養(yǎng)條件為培養(yǎng)溫度37℃,搖床轉(zhuǎn)速為220rpm,培養(yǎng)時(shí)間6h,得到種子液,OD600為4.0。(二)、菌體培養(yǎng)與收集將種子液按5%的接種量接種到含有終濃度50μg/mL卡那霉素的上述菌體生長(zhǎng)培養(yǎng)基中(1L搖瓶),進(jìn) 行菌體培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為37℃,搖床轉(zhuǎn)速為220rpm。發(fā)酵過(guò)程中通過(guò)補(bǔ)加700g/L的葡萄糖,控制發(fā)酵體系中葡萄糖的濃度為5~10g/L。通過(guò)補(bǔ)加濃氨水調(diào)控pH,維持在6.9左右。當(dāng)OD600=40時(shí),加入IPTG(終濃度為0.4mmol/L)誘導(dǎo)重組質(zhì)粒攜帶的基因表達(dá)。菌體培養(yǎng)8h,OD600約80,6000×g離心6min,收集菌體。(三)、搖瓶催化實(shí)驗(yàn)生產(chǎn)L-2-氨基丁酸將收集的菌體以緩沖液進(jìn)行重懸浮,并全部接種到含有終濃度50μg/mL卡那霉素的搖瓶菌體催化培養(yǎng)基中。進(jìn)行搖瓶催化實(shí)驗(yàn),搖床溫度為37℃,轉(zhuǎn)速為220rpm。發(fā)酵過(guò)程中通過(guò)補(bǔ)加700g/L的葡萄糖,控制發(fā)酵體系中葡萄糖的濃度為5~10g/L。通過(guò)補(bǔ)加濃氨水調(diào)控pH,維持在6.9左右。菌體催化持續(xù)約36h。收集菌體催化產(chǎn)物,12000×g離心2min,收集上清液。(四)、檢測(cè)L-2-氨基丁酸的含量在不同的發(fā)酵時(shí)間取發(fā)酵產(chǎn)物離心取上清液,使用高壓液相色譜法(HPLC)進(jìn)行檢測(cè)。具體方法如下(2,4-二硝基氟苯柱前衍生高效液相法):取10μL上述上清液于2mL離心管中,加入200μLNaHCO3水溶液(0.5mol/L,pH9.0)和100μL1%的2,4-二硝基氟苯-乙腈溶液(體積比),于60℃水浴中暗處恒溫加熱60min,然后冷卻至25℃,加入700μLKH2PO4水溶液(0.01mol/L,pH7.20±0.05,用NaOH水溶液調(diào)整pH),放置15min過(guò)濾后可進(jìn)樣,進(jìn)樣量為15μL。所用色譜柱為C18柱(ZORBAXEclipseXDB-C18,4.6×150mm,Agilent,USA);柱溫:40℃;紫外檢測(cè)波長(zhǎng):360nm;流動(dòng)相A為0.04mol/LKH2PO4水溶液(pH7.20±0.05,用40g/LKOH水溶液調(diào)整pH),流動(dòng)相B為55%乙腈水溶液(體積比),流動(dòng)相流速為1mL/min,洗脫過(guò)程如下表1所示:表1流動(dòng)相洗脫程序時(shí)間(min)流動(dòng)相A(%)流動(dòng)相B(%)086142881248614107030203070241090270100結(jié)果如下表2所示,搖瓶催化18h,工程菌ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為3.72g/L,ABA2(BL21/pET28a-ilvA-ilvE)的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為2.82g/L。表2菌株ABA1和ABA2的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量菌株L-2-氨基丁酸產(chǎn)量(g/L)ABA13.72±0.51ABA22.82±0.03由上表可以看出,蘇氨酸脫氨酶TdcB的催化效果優(yōu)于IlvA,過(guò)表達(dá)TdcB的菌株ABA1的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量較過(guò)表達(dá)IlvA的菌株提高了31.91%。實(shí)施例3、L-2-氨基丁酸工程菌ABA3、ABA4、ABA5的構(gòu)建一、多種轉(zhuǎn)氨酶表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建酪氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶TyrB催化芳香族氨基酸轉(zhuǎn)氨反應(yīng),腐胺氨基轉(zhuǎn)移酶PatA催化腐胺的轉(zhuǎn)氨反應(yīng),纈氨 酸丙酮酸氨基轉(zhuǎn)移酶AvtA催化纈氨酸和丙酮酸生成丙氨酸及3-甲基-2-酮丁酸,為比較三種轉(zhuǎn)氨酶催化2-酮丁酸生成2-氨基丁酸的催化能力的差別,分別構(gòu)建含三種轉(zhuǎn)氨酶的表達(dá)質(zhì)粒和菌株。以E.coliK12W3110基因組為模板,以WY1405、WY1406為引物,擴(kuò)增得到1256bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.8);以WY1408、WY1409為引物,擴(kuò)增得到1436bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.10);以WY1411、WY1412為引物,擴(kuò)增得到1314bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.12)。按照實(shí)施例1中所述方法,分別構(gòu)建蘇氨酸轉(zhuǎn)氨酶表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tyrB、pET28a-patA和pET28a-avtA。tyrB為酪氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶基因,基因序列為SEQIDNo.8中15-1208位所示,patA為腐胺氨基轉(zhuǎn)移酶基因,基因序列為SEQIDNo.10中9-1388位所示,avtA為纈氨酸丙酮酸氨基轉(zhuǎn)移酶基因,基因序列為SEQIDNo.12中9-1262位所示。按照實(shí)施例1中的方法,利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-tdcB和pET28a-tyrB,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶與轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB-tyrB。利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-tdcB和pET28a-patA,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶與轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB-patA。利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-tdcB和pET28a-avtA,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶與轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒pET28a-tdcB-avtA。WY1405:CATGCCATGGGACATCGCGTGTTTCAAAAAGT(NcoI)WY1406:ACGCGTCGACAATTTCACTGCAGGCTGGGT(SalI)WY1408:CATGCCATGGGATTGAACAGGTTACCTTCGAG(NcoI)WY1409:CCGCTCGAGAAAAGATCGGATGGCGACGT(XhoI)WY1411:CATGCCATGGGCATGACATTCTCCCTTTTTGG(NcoI)WY1412:ACGCGTCGACTGCAGAAATCATGTAGGCCT(SalI)二、轉(zhuǎn)氨酶相應(yīng)工程菌株的構(gòu)建按照實(shí)施例1中的方法,利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-tdcB-tyrB、pET28a-tdcB-patA、pET28a-tdcB-avtA分別構(gòu)建L-2-氨基丁酸工程菌株ABA3(BL21/pET28a-tdcB-tyrB),ABA4(BL21/pET28a-tdcB-patA),ABA5(BL21/pET28a-tdcB-avtA)。實(shí)施例4、工程菌ABA3、ABA4、ABA5催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸利用構(gòu)建的過(guò)表達(dá)不同轉(zhuǎn)氨酶的工程菌ABA3(BL21/pET28a-tdcB-tyrB)、ABA4(BL21/pET28a-tdcB-patA)、ABA5(BL21/pET28a-tdcB-avtA)進(jìn)行L-2-氨基丁酸的全細(xì)胞催化實(shí)驗(yàn)。種子培養(yǎng)及菌體生長(zhǎng)階段培養(yǎng)基如上述實(shí)施例2中所述。種子液的獲得、菌體培養(yǎng)及搖瓶催化方法如實(shí)施例2中所述。按照實(shí)施例2中所述的方法,檢測(cè)催化液中L-2-氨基丁酸的含量。催化液檢測(cè)結(jié)果如下:搖瓶催化18h,工程菌ABA1的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為3.72g/L,工程菌ABA3的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為2.60g/L,工程菌ABA4的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為0.66g/L,工程菌ABA5的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為0.87g/L。表3菌株ABA1、ABA3、ABA4和ABA5的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量菌株L-2-氨基丁酸產(chǎn)量(g/L)ABA13.72±0.51ABA32.60±0.03ABA40.66±0.01ABA50.87±0.08由上表3可以看出,轉(zhuǎn)氨酶TyrB、PatA及AvtA均可用于催化2-酮丁酸生成2-氨基丁酸,支鏈氨基酸氨基轉(zhuǎn)移酶IlvE的催化效果優(yōu)于TyrB、PatA及AvtA。實(shí)施例5、L-2-氨基丁酸工程菌ABA6的構(gòu)建為考察不同強(qiáng)度基因表達(dá)元件對(duì)L-2-氨基丁酸催化效果的影響,構(gòu)建攜帶優(yōu)化的核糖體結(jié)合位點(diǎn)(RBS)的蘇氨酸脫氨酶表達(dá)質(zhì)粒及其相應(yīng)的L-2-氨基丁酸工程菌。以E.coliK12W3110基因組為模板,分別以WY1433、WY997為引物,擴(kuò)增得到1072bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.4),其攜帶有大腸桿菌蘇氨酸脫氨酶自身RBS序列(SEQIDNo.4中33~39bp核苷酸),按照實(shí)施例1中的方法,構(gòu)建蘇氨酸脫氨酶表達(dá)質(zhì)粒pET28a-RBStdcB。利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-RBStdcB和pET28a-ilvE,構(gòu)建攜帶自身RBS序列的蘇氨酸脫氨酶和轉(zhuǎn)氨酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒pET28a-RBStdcB-ilvE。利用已構(gòu)建質(zhì)粒pET28a-RBStdcB-ilvE構(gòu)建L-2-氨基丁酸工程菌株ABA6(BL21/pET28a-RBStdcB-ilvE)。WY1433:TGCTCTAGACGGTTACCTACATATTTAAT(XbaI)實(shí)施例6、工程菌ABA6和ABA1催化產(chǎn)L-2-氨基丁酸按照實(shí)施例2中的方法,利用工程菌ABA6催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸。催化液HPLC檢測(cè)結(jié)果如下:搖瓶催化18h,工程菌ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為3.72g/L,工程菌ABA6(BL21/pET28a-RBStdcB-ilvE)的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為4.18g/L。表4菌株ABA1和ABA6的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量菌株L-2-氨基丁酸產(chǎn)量(g/L)ABA13.72±0.51ABA64.18±0.03結(jié)果顯示,通過(guò)優(yōu)化tdcB基因的RBS,L-2-氨基丁酸的產(chǎn)量提高12.37%。實(shí)施例7、L-2-氨基丁酸高級(jí)工程菌的構(gòu)建一、蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建谷氨酸脫氫酶催化α-酮戊二酸生成谷氨酸。在表達(dá)蘇氨酸脫氨酶及轉(zhuǎn)氨酶的基礎(chǔ)上,利用谷氨酸脫氫酶實(shí)現(xiàn)氨基供體谷氨酸的循環(huán)利用。以E.coliK12W3110基因組為模板,以WY1426、WY1420為引物,擴(kuò)增得到1398bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.14中所示175~1572bp核苷酸序列),按照實(shí)施例1中所述方法,構(gòu)建谷氨酸脫氫酶表達(dá)質(zhì)粒pET28a-gdhA。gdhA為谷氨酸脫氫酶基因,基因序列為SEQIDNo.14中177-1520位所示。根據(jù)已構(gòu)建的質(zhì)粒pET28a-gdhA的核苷酸序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增含T7啟動(dòng)子的gdhA片段。以pET28a-gdhA為模板,分別以WY1427、WY1420為引物,擴(kuò)增得到1572bp的PCR產(chǎn)物(SEQIDNo.14),為含T7啟動(dòng)子的gdhA片段,將PCR獲得的DNA片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離純化,回收片段經(jīng)SalI和XhoI雙酶切后,與同樣雙酶切處理的表達(dá)載體pET28a-tdcB-ilvE連接。連接產(chǎn)物采用化學(xué)轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α,在含卡那霉素(50μg/mL)的LB平板上篩選轉(zhuǎn)化子,轉(zhuǎn)化子傳代培養(yǎng)三代后,以WY1427和WB924為引物,采用菌落PCR鑒定轉(zhuǎn)化子,得到1656bp為陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,對(duì)鑒定正確的轉(zhuǎn)化子提取質(zhì)粒,并對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行SalI和XhoI雙酶切鑒定,得到1572bp酶切片段的質(zhì)粒為陽(yáng)性質(zhì)粒。將PCR和酶切鑒定正確的質(zhì)粒送去測(cè)序,結(jié)果該質(zhì)粒為將序列表中SEQIDNo.14所示核苷酸插入載體pET28a-tdcB-ilvE中得到的重組質(zhì)粒,命名為pET28a-tdcB-ilvE-gdhA(圖6)WY1426:CATGCCATGGATCAGACATATTCTCT(NcoI)WY1420:CCGCTCGAGCCCATTTGTAGGCCTGATAA(XhoI)WY1427:ACGCGTCGACCGCCAGCAACCGCACCTGTG(SalI)二、L-2-氨基丁酸高級(jí)工程菌ABA7的構(gòu)建將已構(gòu)建好的質(zhì)粒pET28a-tdcB-ilvE-gdhA電轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)中,將該菌株命名為ABA7(BL21/pET28a-tdcB-ilvE-gdhA)。利用SDS-PAGE檢測(cè)蛋白表達(dá)情況(圖5)。SDS-PAGE檢測(cè)結(jié)果顯示,構(gòu)建的串聯(lián)表達(dá)質(zhì)粒攜帶的蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶和谷氨酸脫氫酶均已表達(dá)。實(shí)施例8、高級(jí)工程菌ABA7催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸利用菌株ABA7(BL21/pET28a-tdcB-ilvE-gdhA)進(jìn)行發(fā)酵罐催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸實(shí)驗(yàn)。種子培養(yǎng)基具體如下:蛋白胨10g/L,酵母粉5g/L,NaCl10g/L;卡那霉素50mg/L。發(fā)酵罐菌體生長(zhǎng)階段培養(yǎng)基具體如下:酵母粉,10.00g/L;K2HPO4·3H2O,0.90g/L;KH2PO4,1.14g/L;(NH4)2SO4,10.00g/L;MgSO4·7H2O,0.30g/L;TMS儲(chǔ)液,5.00mL/L。其中TMS儲(chǔ)液:FeSO4·7H2O,10.000g/L;CaCl2,1.350g/L;ZnSO4·7H2O,2.250g/L;MnSO4·4H2O,0.500g/L;CuSO4·5H2O,1.000g/L;(NH4)6Mo7O24·4H2O,0.106g/L;Na2B4O7.10H2O,0.230g/L;CoCl2.6H2O,0.480g/L;35%HCl,10.000mL/L。緩沖液:KH2PO4,1.36g/L;Na2HPO4,5.67g/L。發(fā)酵罐菌體催化階段培養(yǎng)基具體如下:MgSO4·7H2O,0.50g/L;(NH4)2SO4,5.00g/L;KH2PO4,1.36g/L;Na2HPO4,5.67g/L;蘇氨酸,100.00g/L;谷氨酸,10.00g/L。(一)、種子液的獲得將工程菌ABA1(BL21/pET28a-tdcB-ilvE)和ABA7(BL21/pET28a-tdcB-ilvE-gdhA)接種到種子培養(yǎng)基中,種子液培養(yǎng)條件為培養(yǎng)溫度37℃,搖床轉(zhuǎn)速為220rpm,培養(yǎng)時(shí)間6h,得到種子液,OD600為4.0。(二)、發(fā)酵罐菌體培養(yǎng)與收集將種子液按照5%的接種量接種到含有終濃度50μg/mL卡那霉素的發(fā)酵罐菌體生長(zhǎng)培養(yǎng)基中。采用的發(fā)酵罐為7.5L發(fā)酵罐(BioFlo115,NBS):內(nèi)置定速可編程控泵,可以實(shí)現(xiàn)恒速補(bǔ)料。發(fā)酵過(guò)程中通過(guò)蠕動(dòng)泵補(bǔ)加700g/L的葡萄糖,控制發(fā)酵體系中葡糖糖的濃度為5~10g/L。通過(guò)加熱套和冷卻水控制發(fā)酵溫度維持在37℃;通入空氣提供溶氧,轉(zhuǎn)速與溶氧信號(hào)級(jí)聯(lián)控制溶氧維持在30%;補(bǔ)加濃氨水調(diào)控pH,維持在6.9左右。菌體培養(yǎng)持續(xù)約7h,OD600約80。當(dāng)OD600=40時(shí),加入IPTG(終濃度為0.4mmol/L)誘導(dǎo)重組質(zhì)粒攜帶的基因表達(dá)。收集發(fā)酵罐培養(yǎng)的菌體,6000×g離心8min,以緩沖液進(jìn)行重懸浮,6000×g離心8min收集菌體。(三)、發(fā)酵罐催化生產(chǎn)L-2-氨基丁酸將收集的菌體全部接種到含有終濃度50μg/mL卡那霉素的發(fā)酵罐菌體催化培養(yǎng)基中。采用的發(fā)酵罐為7.5L發(fā)酵罐(BioFlo115,NBS):內(nèi)置定速可編程控泵,可以實(shí)現(xiàn)恒速補(bǔ)料。發(fā)酵過(guò)程中通過(guò)蠕動(dòng)泵補(bǔ)加700g/L的葡萄糖,控制發(fā)酵體系中葡萄糖的濃度為5~10g/L。通過(guò)加熱套和冷卻水控制發(fā)酵溫度維持在37℃;通入空氣提供溶氧,轉(zhuǎn)速與溶氧信號(hào)級(jí)聯(lián)控制溶氧維持在30%;補(bǔ)加濃氨水調(diào)控pH,維持在6.9左右,菌體催化持續(xù)約48h。收集菌體催化產(chǎn)物,12000×g離心2min,收集上清液。采用實(shí)施例2中所述的方法進(jìn)行HPLC檢測(cè),結(jié)果如下表所示,工程菌ABA7的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為57.23g/L,生產(chǎn)強(qiáng)度為1.43g/L/h;對(duì)照菌ABA1的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量為18.53g/L;生產(chǎn)強(qiáng)度為0.62g/L/h。表5ABA1和ABA7的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量菌株L-2-氨基丁酸產(chǎn)量(g/L)催化時(shí)間(h)ABA118.53±4.5730ABA757.23±7.9040本實(shí)施例的結(jié)果顯示,蘇氨酸脫氨酶、轉(zhuǎn)氨酶及谷氨酸脫氫酶三酶共表達(dá)的工程菌ABA7較對(duì)照菌株ABA1的L-2-氨基丁酸產(chǎn)量提高了2.09倍。當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3 
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