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小細環(huán)病毒及其獲得方法和應(yīng)用與流程

文檔序號:12697017閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種小細環(huán)病毒,其特征在于,該病毒包含:編碼SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的小細環(huán)病毒,其特征在于,所述病毒具有SEQ ID NO.2所示的全長核苷酸序列。

3.一種重組載體,其特征在于,包含權(quán)利要求1所述小細環(huán)病毒的全部或部分核苷酸序列。

4.一種抗小細環(huán)病毒的抗體,其特征在于,該抗體與SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列或其部分片段特異性結(jié)合。

5.一種檢測小細環(huán)病毒的試劑盒,其特征在于,包含特異性針對SEQ ID NO.2所示全部或部分核苷酸序列設(shè)計的引物對。

6.一種檢測小細環(huán)病毒的試劑盒,其特征在于,包含權(quán)利要求4所述的抗體。

7.一種小細環(huán)病毒的獲得方法,其特征在于,包括以下步驟:

取牙周炎患者牙齦組織樣品,提取該樣品中的病毒基因組;

將所述病毒基因組反轉(zhuǎn)錄成病毒cDNA,再用隨機引物進行PCR擴增,擴增后的產(chǎn)物通過高通量測序,構(gòu)建測序文庫;

將高通量測序結(jié)果進行數(shù)據(jù)預(yù)處理后,把長度大于100bp的短序列拼接為重疊群;

將拼接的序列與數(shù)據(jù)庫中的已知序列數(shù)據(jù)進行比對,找出序列之間的相似性;

分析比對結(jié)果,依據(jù)已知序列設(shè)計擴增引物,通過巢式PCR擴增,獲得未知病毒的全長基因序列,該基因序列編碼SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;

經(jīng)系統(tǒng)進化樹分析,對未知病毒進行物種分類,將該未知病毒歸類為小細環(huán)病毒。

8.權(quán)利要求1所述小細環(huán)病毒的應(yīng)用,其特征在于,用于篩選預(yù)防或治療牙周病的藥物。

9.一種抗權(quán)利要求1所述小細環(huán)病毒的藥物。

10.權(quán)利要求9所述藥物的應(yīng)用,其特征在于,用于制備預(yù)防或治療牙周病的藥物。

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