1.一種測(cè)定細(xì)菌微生物的抗生素抗性概況的方法，所述細(xì)菌微生物屬于大腸桿菌種，其包括下述步驟：
a）提供含有或疑似含有細(xì)菌微生物的樣品；
b）測(cè)定細(xì)菌微生物的至少一種基因中突變的存在，所述至少一種基因選自表4中列出的基因；
其中所述突變的存在指示對(duì)抗生素藥物的抗性。
2.權(quán)利要求1的方法，其中步驟b）包括測(cè)定在選自表4的至少兩種或更多種基因中突變的存在，并且其中所述在至少兩種基因中突變的存在指示對(duì)抗生素藥物的抗性。
3.權(quán)利要求1的方法，其中步驟b）包括測(cè)定在選自表5中列出的基因的至少一種基因中突變的存在，并且其中所述至少一種基因中突變的存在指示對(duì)抗生素藥物的抗性。
4.權(quán)利要求3的方法，其中測(cè)定在選自hofB、ymdC、potB、ycgK、ycgB和yjjJ的至少一種基因中突變的存在。
5.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述方法涉及測(cè)定大腸桿菌對(duì)一種或多種抗生素藥物的抗性。
6.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述抗生素藥物選自內(nèi)酰胺類抗生素，并且測(cè)定在以下基因中突變的存在：chbG、eutQ、flgL、gudD、gyrA、ldrA、menE、murB、murP、nepI、parC、pphB、ptrB、rhaD、ydiU、yegE、yegI、yfbL、yfiK、ygcR、ygiF、ygjM、yohG和/或yrfB。
7.權(quán)利要求1-5中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述抗生素藥物選自喹諾酮或氨基糖苷類抗生素，并且測(cè)定在以下基因中突變的存在：agaD、chbG、eutE、eutQ、gcvP、gspO、gyrA、livG、menE、nepI、parC、speC、tiaE、torZ、uidB、yegE、yegI、yejA、ygcU、ygfZ、ygiF、ygjM、yjjU、yjjW、ymdC、ypdB、yqjA和/或ytfG。
8.權(quán)利要求1-5中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述抗生素藥物選自四環(huán)素類抗生素，并且測(cè)定在以下基因中突變的存在：astE、chbG、eutQ、flgL、gudD、gyrA、hemF、hypF、kdpE、ldrA、menE、murB、murP、nepI、ompC、parC、pphB、ptrB和/或rhaD。
9.權(quán)利要求1-5中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述抗生素藥物選自甲氧芐啶磺胺甲噁唑，并且測(cè)定在以下基因中突變的存在：astE、chbG、eutQ、flgL、gudD、gyrA、ldrA、menE、murB、nepI、parC、ycjX、ydiU、yegE、yfiK、ygcR、ygiF和/或yrfB。
10.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括測(cè)定在基因中的單一位置處的單一核苷酸的存在。
11.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中檢測(cè)在單一核苷酸位置處的單核苷酸多態(tài)性或突變的存在。
12.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述突變是選自表2和/或表7中列出的突變的突變。
13.權(quán)利要求1-11中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定在選自表6的至少一種基因中突變的存在。
14.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述抗生素藥物選自氨芐青霉素舒巴坦（A.S.）、氨芐青霉素（AM）、阿莫西林克拉維酸鹽（AUG）、氨曲南（AZT）、頭孢曲松（CAX）、頭孢他啶（CAZ）、頭孢噻肟（CFT）、頭孢吡肟（CPM）、環(huán)丙沙星（CP）、厄他培南（ETP）、左氧氟沙星（LVX）、頭孢呋辛（CRM）、哌拉西林他唑巴坦（P/T）、甲氧芐啶磺胺甲噁唑（T/S）、妥布霉素（TO）、慶大霉素（GM）、頭孢唑啉（CFZ）、頭孢噻吩（CF）、亞胺培南（IMP）、美羅培南（MER）和四環(huán)素（TE）。
15.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是AM，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2428183、4525576、1684413、4636902、1181357、206427。
16.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是A/S，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2428183、4054212、1974644。
17.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是AUG，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置中的突變：2463877。
18.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是AZT，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2428183、1615473。
19.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是CAX，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2428183、1615473。
20.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是CFT、CP、CPE、CRM、GM、LVX、TO、T/S或CAZ，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置中的突變：2428183。
21.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是ETP，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2052365、2233638、4553471、2565236。
22.權(quán)利要求1-14的方法，其中所述抗生素藥物是P/T，并且檢測(cè)在以下核苷酸位置的至少一個(gè)中的突變：2233638、2216164、2725302、1567286、2755319、319290、3240296、1517573、2178525、2924554、1516808、37032、1368519、4575887。
23.前述權(quán)利要求15-22中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中根據(jù)圖5-20的決策圖測(cè)試針對(duì)所述相應(yīng)的抗生素藥物的抗性。
24.權(quán)利要求14-22中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定細(xì)菌微生物針對(duì)1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16種抗生素藥物的抗性，所述細(xì)菌微生物屬于大腸桿菌種。
25.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括測(cè)定所述至少一種基因的部分序列或整個(gè)序列。
26.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括測(cè)定所述細(xì)菌微生物的基因組的部分或整個(gè)序列，其中所述基因組的部分或整個(gè)序列包括所述至少一種基因的至少部分序列。
27.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中所述樣品是患者樣品（臨床分離物）。
28.前述權(quán)利要求中一項(xiàng)或多項(xiàng)的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括使用下一代測(cè)序或高通量測(cè)序方法。
29.權(quán)利要求28的方法，其中通過使用下一代測(cè)序或高通量測(cè)序方法測(cè)定所述細(xì)菌生物的部分或整個(gè)基因組序列。
30.權(quán)利要求2的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括測(cè)定選自表4的3、4、5、6、7、8或9種基因的核酸序列信息或突變。
31.權(quán)利要求3的方法，其中測(cè)定核酸序列信息或突變的存在包括測(cè)定選自表5的2、3、4、5、6、7、8或9種基因的核酸序列信息或突變。
32.權(quán)利要求31的方法，其中本發(fā)明的方法還包括測(cè)定針對(duì)2、3、4、5、6種或更多種抗生素藥物的抗性。