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用于個性化疼痛管理的方法與組合物與流程

文檔序號:12285389閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.對需要鎮(zhèn)痛的患者選擇鎮(zhèn)痛藥物的方法,所述方法包括:

確定或接收患者對至少一種遺傳變體的基因型,

基于患者對該至少一種遺傳變體的基因型,將患者分配到定義為對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件低風險和高風險的兩個風險組之一中,和

基于患者被分配的風險組對患者選擇藥物,其中如果患者被分配到高風險組中,所述藥物選自非嗎啡阿片樣物質或非阿片樣物質鎮(zhèn)痛藥,如果患者被分配到低風險組中,所述藥物選自嗎啡或另一種阿片樣物質鎮(zhèn)痛藥。

2.鑒定處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險下的患者的方法,所述方法包括:

確定或接收患者對至少一種遺傳變體的基因型,

基于患者對該組的至少一種遺傳變體的基因型,將患者分配到定義為對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件低和高風險的兩個風險組之一中,其中被分配到高風險組中的患者被鑒定為處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險下的患者。

3.權利要求1或2的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含選自ABCB1 rs9282564、ABCC3 rs4148412和ABCC3 kgp8560677的至少一種變體。

4.權利要求3的方法,其中將所述變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

ABCB1 rs9282564GG高,AG高,AA低[RD];

ABCC3 rs4148412AA高,AG高,GG低[延長的RD];和

ABCC3 kgp8560677AA高,AG高,GG低[PONV]。

5.權利要求1至4任一項的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含或進一步包含選自OPRM1 rs1799971、ABCC3 rs739923、FAAH rs 324420和ABCB1 rs1045642的至少一種變體。

6.權利要求5的方法,其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

OPRM1 rs1799971GG高,AG高,AA低[RD];

ABCC3 rs739923GG空;AG低;AA低[延長的RD];

FAAH rs324420AA高,AC高,CC低[PONV];和

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低[RD]。

7.權利要求4至6任一項的方法,其中所述PONY是頑固性的。

8.權利要求1或2的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含由FAAH rs2295632、ABCB1 rs1045642和ADRB2 rs1042713組成的至少三種變體。

9.權利要求8的方法,其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件是呼吸抑制[RD]:

FAAH rs2295632AA高,CA高,CC低;

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低;和

ADRB2 rs1042713GG高,GA高,AA低。

10.權利要求1至9任一項的方法,其中所述分配通過計算機實施的方法來進行。

11.權利要求10的方法,其中所述計算機實施的方法包括決策規(guī)則。

12.權利要求10或11的方法,其中所述計算機實施的方法包括編碼所述基因型,以使得各SNP產生兩個耦合的二進制變量。

13.權利要求3的方法,其中所述分配通過包含決策規(guī)則的計算機實施的方法來進行,并且所述決策規(guī)則包括:

IF[(rs9282564=AA)OR(rs4148412=GG)OR(kgp8560677=GG)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

14.權利要求8的方法,其中所述分配通過包含決策規(guī)則的計算機實施的方法來進行,并且所述決策規(guī)則包括:

IF[(rs2295632=CC)OR(rs1045642=CC)OR(rs1042713=AA)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

15.權利要求1至14任一項的方法,其中至少一種額外的非遺傳因素用于完善將患者分配到兩個風險組之一或選擇所述藥物的劑量。

16.權利要求15的方法,其中所述至少一種額外非遺傳因素選自性別、種族、年齡和診斷。

17.權利要求1至16任一項的方法,其中所述患者是兒科患者。

18.權利要求1至17任一項的方法,其中所述患者具有白人血統(tǒng)。

19.權利要求16的方法,其中所述患者是分配到低風險組中的具有白人血統(tǒng)的女性兒科患者,并且施用所述阿片樣物質藥物以使得總劑量不超過0.15毫克/千克、0.2毫克/千克或0.275毫克/千克。

20.權利要求1至19任一項的方法,其中所述患者的基因型直接接收自用于確定患者的基因型的設備。

21.權利要求1至20任一項的方法,其中通過包括以下步驟的方法確定患者的基因型:獲得或接收來自患者的生物樣品,從所述樣品中提取DNA,并分析所述DNA以確定患者在所述組中的各遺傳變體處的基因型。

22.權利要求21的方法,其中使用基于聚合酶鏈式反應的基因分型平臺分析所述DNA。

23.權利要求22的方法,其中所述基因分型平臺采用5’端核酸酶測定法來擴增和檢測特定的遺傳變體。

24.權利要求21至23任一項的方法,其中所述生物樣品選自血液樣品和頰粘膜拭子。

25.生物測定試劑盒,包含以下組件:(i)一組序列特異性正向和反向引物,其有效擴增下列各SNP OPRMI rs1799971、ABCB1 rs9282564、ABCB1 rs1045642和ADRB2 rs1042713;(ii)兩個標記的DNA探針,各自有效地雜交至該SNP的不同等位基因;和(iii)具有5’端核酸酶活性的DNA聚合酶。

26.生物測定試劑盒,包含以下組件:(i)一組序列特異性正向和反向引物,其有效擴增選自ABCB1 rs9282564、ABCC3 rs4148412和ABCC3 kgp8560677的一種或多種遺傳變體;(ii)兩個標記的DNA探針,各自有效地雜交至該SNP的不同等位基因;和(iii)具有5’端核酸酶活性的DNA聚合酶。

27.權利要求26的生物測定試劑盒,進一步包含有效擴增選自OPRM1 rs1799971、ABCC3 rs739923、FAAH rs 324420和ABCB1 rs1045642的一種或多種額外的遺傳變體的一組序列特異性正向和反向引物。

28.生物測定試劑盒,包含以下組件:(i)一組序列特異性正向和反向引物,其有效擴增由FAAH rs2295632、ABCB1 rs1045642和ADRB2 rs1042713組成的至少三種變體;(ii)兩個標記的DNA探針,各自有效地雜交至該SNP的不同等位基因;和(iii)具有5’端核酸酶活性的DNA聚合酶。

29.用于對需要鎮(zhèn)痛的患者選擇鎮(zhèn)痛藥物的計算機實施的方法,所述方法包括:

通過至少一個數據處理器基于患者對至少一種遺傳變體的基因型,將患者分配至定義為對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件低和高風險的兩個風險組之一,并

通過至少一個數據處理器基于患者所分配的風險組對所述患者選擇藥物,其中如果患者被分配到高風險組中,所述藥物選自非嗎啡阿片樣物質或其它鎮(zhèn)痛藥,如果患者被分配到低風險組中,所述藥物選自嗎啡或嗎啡基阿片樣物質。

30.鑒定患者處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件風險下的計算機實施的方法,所述方法包括:

通過至少一個數據處理器確定或接收患者對至少一種遺傳變體的基因型,

通過至少一個數據處理器基于患者對所述組的至少一種遺傳變體的基因型,將患者分配到定義為對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件低和高風險的兩個風險組之一中,其中被分配到高風險組中的患者被鑒定為處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險下的患者。

31.權利要求29或30的計算機實施的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含選自ABCB1 rs9282564、ABCC3 rs4148412和ABCC3 kgp8560677的至少一種變體。

32.權利要求30的計算機實施的方法,其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

ABCB1 rs9282564GG高,AG高,AA低[RD]

ABCC3 rs4148412AA高,AG高,GG低[延長的RD]

ABCC3 kgp8560677AA高,AG高,GG低[PONV]。

33.權利要求29至32任一項的計算機實施的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含或進一步包含選自OPRM1 rs1799971、ABCC3 rs739923、FAAH rs 324420和ABCB1 rs1045642的至少一種變體。

34.權利要求33的計算機實施的方法,其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

OPRM1 rs1799971GG高,AG高,AA低[RD]

ABCC3 rs739923GG空;AG低;AA低[延長的RD]

FAAH rs324420AA高,AC高,CC低[PONV]

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低[RD]。

35.權利要求32至34任一項的計算機實施的方法,其中所述PONY是頑固性的。

36.權利要求29或30的計算機實施的方法,其中所述至少一種遺傳變體包含由FAAH rs2295632、ABCB1 rs1045642和ADRB2 rs1042713組成的至少三種變體。

37.權利要求36的計算機實施的方法,其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件是呼吸抑制[RD]:

FAAH rs2295632AA高,CA高,CC低

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低

ADRB2 rs1042713GG高,GA高,AA低。

38.權利要求29至37任一項的計算機實施的方法,其中所述分配基于決策規(guī)則。

39.權利要求29至38任一項的計算機實施的方法,進一步包括編碼所述基因型,以使得各SNP產生兩個耦合的二進制變量。

40.權利要求38的計算機實施的方法,其中所述決策規(guī)則包括:

IF[(rs9282564=AA)OR(rs4148412=GG)OR(kgp8560677=GG)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

41.權利要求38的計算機實施的方法,其中所述決策規(guī)則包括

IF[(rs2295632=CC)OR(rs1045642=CC)OR(rs1042713=AA)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

42.權利要求29至41任一項的計算機實施的方法,進一步包括使用至少一種額外的非遺傳因素以完善將患者分配到兩個風險組之一或選擇所述藥物的劑量。

43.權利要求42的計算機實施的方法,其中所述至少一種額外的非遺傳因素選自性別、種族和臨床診斷。

44.權利要求29至43任一項的方法,其中所述患者是兒科患者。

45.權利要求29至44任一項的計算機實施的方法,其中所述患者具有白人血統(tǒng)。

46.權利要求29至45任一項的計算機實施的方法,其中所述患者是分配到低風險組中的具有白人血統(tǒng)的女性兒科患者,并且施用所述嗎啡基阿片樣物質藥物以使得總嗎啡劑量不超過0.15毫克/千克、0.2毫克/千克或0.275毫克/千克。

47.權利要求29至46任一項的計算機實施的方法,其中所述患者的基因型直接接收自用于確定患者的基因型的設備。

48.權利要求29至47任一項的計算機實施的方法,其中通過包括以下步驟的方法確定患者的基因型:獲得或接收來自患者的生物樣品,從所述樣品中提取DNA,并分析所述DNA以確定所述患者在所述組中的各遺傳變體處的基因型。

49.權利要求48的計算機實施的方法,其中使用基于聚合酶鏈式反應的基因分型平臺分析所述DNA。

50.權利要求49的計算機實施的方法,其中所述基因分型平臺采用5’端核酸酶測定法來擴增和檢測特定的遺傳變體。

51.權利要求48至50任一項的計算機實施的方法,其中所述生物樣品選自血液樣品和頰粘膜拭子。

52.對需要鎮(zhèn)痛的患者選擇鎮(zhèn)痛藥物的系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:

數據庫,其用于對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險組存儲患者的基因型和藥物,所述風險組包括低風險組和高風險組;

處理器,其配置成根據患者對所述至少一種遺傳變體的基因型將所述患者分配到風險組之一,并根據患者分配的風險組對所述患者選擇藥物,其中如果患者被分配到高風險組中,所述藥物選自非嗎啡阿片樣物質或其它鎮(zhèn)痛藥,如果患者被分配到低風險組中,所述藥物選自嗎啡或嗎啡基阿片樣物質。

53.用于鑒定處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件風險下的患者的系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:

數據庫,其用于對嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險組存儲患者的基因型和藥物,所述風險組包括低風險組和高風險組;

處理器,其配置成根據患者對所述組的至少一種遺傳變體的基因型將所述患者分配到風險組之一,其中被分配到高風險組中的患者被鑒定為處于嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件的風險下的患者。

54.權利要求52或53的系統(tǒng),其中所述至少一種遺傳變體包含選自ABCB1 rs9282564、ABCC3 rs4148412和ABCC3 kgp8560677的至少一種變體。

55.權利要求54的系統(tǒng),其中將所述變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

ABCB1 rs9282564GG高,AG高,AA低[RD]

ABCC3 rs4148412AA高,AG高,GG低[延長的RD]

ABCC3 kgp8560677AA高,AG高,GG低[PONV]。

56.權利要求52至55任一項的系統(tǒng),其中所述至少一種遺傳變體包含或進一步包含選自OPRM1 rs1799971、ABCC3 rs739923、FAAH rs 324420和ABCB1 rs1045642的至少一種變體。

57.權利要求56的系統(tǒng),其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件選自呼吸抑制[RD]、因RD而處于延長的恢復[延長的RD]和手術后惡心與嘔吐[PONV]:

OPRM1 rs1799971GG高,AG高,AA低[RD]

ABCC3 rs739923GG空;AG低;AA低[延長的RD]

FAAH rs324420AA高,AC高,CC低[PONV]

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低[RD]。

58.權利要求55至57任一項的系統(tǒng),其中所述PONY是頑固性的。

59.權利要求52或53的系統(tǒng),其中所述至少一種遺傳變體包含由FAAH rs2295632、ABCB1 rs1045642和ADRB2 rs1042713組成的至少三種變體。

60.權利要求59的系統(tǒng),其中將該變體如下分配到兩個風險組之一,并且所述嚴重的阿片樣物質誘導的不良事件是呼吸抑制[RD]:

FAAH rs2295632AA高,CA高,CC低

ABCB1 rs1045642TT高,TC高,CC低

ADRB2 rs1042713GG高,GA高,AA低。

61.權利要求52至60任一項的系統(tǒng),其中所述處理器配置成根據決策規(guī)則來分配。

62.權利要求52至61任一項的系統(tǒng),其中所述處理器進一步配置為編碼所述基因型,以使得各SNP產生兩個耦合的二進制變量。

63.權利要求61的系統(tǒng),其中所述決策規(guī)則包括:

IF[(rs9282564=AA)OR(rs4148412=GG)OR(kgp8560677=GG)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

64.權利要求61至63任一項的系統(tǒng),其中所述決策規(guī)則包括:

IF[(rs2295632=CC)OR(rs1045642=CC)OR(rs1042713=AA)]THEN RISK=NO(低)

ELSE RISK=YES(高)。

65.權利要求52至64任一項的系統(tǒng),其中所述處理器進一步配置成采用至少一種額外的非遺傳因素來完善將患者分配到兩個風險組之一或選擇所述藥物的劑量。

66.權利要求65的系統(tǒng),其中所述至少一種額外的非遺傳因素選自性別、種族和臨床診斷。

67.權利要求52至66任一項的系統(tǒng),其中所述患者是兒科患者。

68.權利要求52至67任一項的系統(tǒng),其中所述患者具有白人血統(tǒng)。

69.權利要求66的系統(tǒng),其中所述患者是分配到低風險組中的具有白人血統(tǒng)的女性兒科患者,并且施用所述嗎啡基阿片樣物質藥物以使得總嗎啡劑量不超過0.15毫克/千克、0.2毫克/千克或0.275毫克/千克。

70.權利要求52至69任一項的系統(tǒng),其中所述患者的基因型直接接收自用于確定患者的基因型的設備。

71.權利要求52至70任一項的系統(tǒng),其中通過包括以下步驟的方法確定患者的基因型:獲得或接收來自患者的生物樣品,從所述樣品中提取DNA,并分析所述DNA以確定患者在該組中的各遺傳變體處的基因型。

72.權利要求71的系統(tǒng),其中使用基于聚合酶鏈式反應的基因分型平臺分析所述DNA。

73.權利要求72的系統(tǒng),其中所述基因分型平臺采用5’端核酸酶測定法來擴增和檢測特定的遺傳變體。

74.權利要求71至73任一項的系統(tǒng),其中所述生物樣品選自血液樣品和頰粘膜拭子。

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