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用于造血干細胞中核酸酶介導(dǎo)的基因組工程化和校正的方法和組合物與流程

文檔序號:12509298閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種經(jīng)遺傳修飾的細胞,其包含在內(nèi)源性人β-血紅蛋白(Hbb)基因的SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24處或其附近的基因組修飾,其中所述基因組修飾選自插入、缺失和其組合。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述細胞是干細胞。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述干細胞是造血干細胞。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述造血干細胞是CD34+細胞。

5.一種經(jīng)遺傳修飾的分化細胞,其從根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項所述的干細胞轉(zhuǎn)變而來的。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述細胞是紅細胞(RBC)。

7.根據(jù)權(quán)利要求1至6中任一項所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述遺傳修飾使用核酸酶進行。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述核酸酶是鋅指核酸酶。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述核酸酶包含鋅指核酸酶,所述鋅指核酸酶包含5或6個包含識別螺旋的鋅指結(jié)構(gòu)域,且另外,其中所述鋅指蛋白包含以表1的單行所示順序的識別螺旋區(qū)域。

10.根據(jù)權(quán)利要求1至9中任一項所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述插入包括整合編碼轉(zhuǎn)基因的供體多核苷酸。

11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞,其中所述供體多核苷酸校正鐮狀細胞突變。

12.一種藥物組合物,其包含根據(jù)權(quán)利要求1至11中任一項所述的經(jīng)遺傳修飾的細胞。

13.一種鋅指蛋白,其包含5或6個包含識別螺旋區(qū)域的鋅指結(jié)構(gòu)域,其中所述鋅指蛋白包含表1的單一行中所示順序的識別螺旋區(qū)域。

14.一種融合蛋白,其包含根據(jù)權(quán)利要求13所述的鋅指蛋白和野生型或工程改造的裂解半結(jié)構(gòu)域。

15.一種多核苷酸,其編碼根據(jù)權(quán)利要求13或權(quán)利要求14所述的一種或多種蛋白。

16.一種分離細胞,其包含一種或多種根據(jù)權(quán)利要求14所述的融合蛋白或一種或多種根據(jù)權(quán)利要求15所述的多核苷酸。

17.根據(jù)權(quán)利要求16所述的細胞,其中所述細胞選自由紅細胞(RBC)或前體細胞(例如,CD4+造血干細胞)組成的組。

18.一種試劑盒,其包含以下項中的至少一項:i)根據(jù)權(quán)利要求15編碼所述蛋白的多核苷酸或ii)根據(jù)權(quán)利要求13或權(quán)利要求14所述的蛋白。

19.一種改變細胞中的Hbb表達的方法,所述方法包括:

將根據(jù)權(quán)利要求15所述的一種或多種多核苷酸導(dǎo)入所述細胞,其在使得所述一種或多種蛋白被表達并且所述Hbb基因的表達被改變的條件下進行。

20.根據(jù)權(quán)利要求19所述的方法,其中所述Hbb基因的表達增加。

21.根據(jù)權(quán)利要求19或權(quán)利要求20所述的方法,其還包括將供體序列整合到所述細胞的基因組中。

22.根據(jù)權(quán)利要求19至21中任一項所述的方法,其中所述細胞選自由紅細胞(RBC)前體細胞和造血干細胞組成的組。

23.根據(jù)權(quán)利要求19至22中任一項所述的方法,其中所述供體序列包含校正突變的寡核苷酸,該突變改變用于所述Hbb基因的mRNA加工的剪接供體位點。

24.一種產(chǎn)生在內(nèi)源Hbb基因內(nèi)包含基因組修飾的經(jīng)遺傳修飾的細胞的方法,所述方法包括以下步驟:

a)使細胞與編碼根據(jù)權(quán)利要求14所述的融合蛋白的多核苷酸接觸,

b)使所述細胞經(jīng)受有利于從所述多核苷酸表達所述融合蛋白的條件;以及

c)用所表達的所述融合蛋白修飾所述內(nèi)源Hbb基因以足以產(chǎn)生所述經(jīng)遺傳修飾的細胞。

25.根據(jù)權(quán)利要求24所述的方法,其中所述方法還包括用至少一種細胞因子刺激所述細胞。

26.一種治療患有β-地中海貧血的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用足以增加所述患者的Hbb基因表達的量的根據(jù)權(quán)利要求12所述的藥物組合物。

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