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黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)及引物和應(yīng)用的制作方法

文檔序號:11126228閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種黃連木微衛(wèi)星核苷酸,其特征在于所述的核苷酸序列為分別如SEQ ID NO:1~12的PC1、PC19、PC44、PC64、PC70、PC96、PC106、PC172、PC189、PC193、PC196、PC205中任一。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的微衛(wèi)星核苷酸的側(cè)翼序列上設(shè)計(jì)的黃連木微衛(wèi)星引物對,其特征在于:

所述的核苷酸序列PC1的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC1F/R,如SEQ ID NO:13~14。

所述的核苷酸序列PC19的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC19F/R,如SEQ ID NO:15~16。

所述的核苷酸序列PC44的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC44F/R,如SEQ ID NO:17~18;

所述的核苷酸序列PC64的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC64F/R,如SEQ ID NO:19~20;

所述的核苷酸序列PC70的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC70F/R,如SEQ ID NO:21~22;

所述的核苷酸序列PC96的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC96F/R,如SEQ ID NO:23~24;

所述的核苷酸序列PC106的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC106F/R,如SEQ ID NO:25~26;

所述的核苷酸序列PC172的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC172F/R,如SEQ ID NO:27~28;

所述的核苷酸序列PC189的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC189F/R,如SEQ ID NO:29~30;

所述的核苷酸序列PC193的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC193F/R,如SEQ ID NO:31~32;

所述的核苷酸序列PC196的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC196F/R,如SEQ ID NO:33~34;

所述的核苷酸序列PC205的黃連木微衛(wèi)星位點(diǎn)上設(shè)計(jì)的,其上下游序列分別為PC205F/R,如SEQ ID NO:35~36。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的微衛(wèi)星引物在用于黃連木種群遺傳多樣性的檢測中的應(yīng)用。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于引物用于黃連木種群遺傳多樣性的檢測方法包括如下步驟:

1)基因組DNA的提取:采用DNA提取試劑盒針對黃連木自身特征進(jìn)行黃連木基因組DNA的提??;

2)微衛(wèi)星PCR擴(kuò)增:采用權(quán)利要求2設(shè)計(jì)的引物,黃連木基因組DNA為模板進(jìn)行PCR,獲得黃連木個(gè)體微衛(wèi)星擴(kuò)增產(chǎn)物;

3)電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物:采用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳及銀染法檢測微衛(wèi)星擴(kuò)增產(chǎn)物,并且擴(kuò)增結(jié)果利用ABI 3730XL測序儀進(jìn)行測序;

4)遺傳多樣性分析:根據(jù)每個(gè)個(gè)體微衛(wèi)星擴(kuò)增產(chǎn)物的分子量大小確定基因型,序結(jié)果經(jīng)Genmapper4.0判讀后利用POPGENE Version 1.32軟件進(jìn)行群體遺傳分析,計(jì)算微衛(wèi)星等位基因數(shù)(Na)、觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、是否偏離Hardy-Weinberg平衡(P);利用PIC軟件計(jì)算多態(tài)信息含量。

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