1.一種新疆野蘋果miR156表達量的檢測方法,其特征在于:步驟如下:
(一)總RNA提取
總RNA采用CTAB法提取,具體步驟如下:
⑴取不同樹齡的新疆野蘋果的葉片或愈傷組織,將其在液氮中充分研磨成粉狀;
⑵取粉末置于加有裂解液1的離心管中,粉末與裂解液1的比例g:μL為1:8000,渦旋混勻,60-70℃溫育8-15min,期間上下顛倒混勻2-3次;
所述裂解液1的組成成分及比例如下:
100mM pH 8.0Tris-HCl;
25m MEDTA;
2M NaCl;
質量終濃度為2%的CTAB;
質量終濃度為2%的PVP;
質量終濃度為0.5%的spermidine;
體積終濃度為2%的β-mercaptoethanol;
⑶再加入三氯甲烷,三氯甲烷與裂解液1的體積比為1:1,渦旋混勻,室溫放置5min;
⑷13000rpm 4℃離心10min;
⑸吸上清于新的離心管中,加入上清體積1/5的三氯甲烷,渦旋混勻,室溫放置5-10min;
⑹10000-13000rpm 4℃離心13-18min,吸上清于新的離心管中,加入上清兩倍體積的異丙醇,輕柔混勻;
⑺10000-13000rpm 4℃離心13-18min,棄上清,得沉淀;
⑻加入17μLRNase-Free Water于離心管中,加入10×DNase I緩沖液2μL,Dnase I 1μL,37℃溫浴10-20min;
⑼加入總體積兩倍體積的異丙醇,10000-13000rpm 4℃離心13-18min,棄上清,使用質量分數(shù)為80%的乙醇清洗沉淀2-3次;
⑽待乙醇完全揮發(fā)后,加入30-50μLRNase-Free Water,即得總RNA,將總RNA立即電泳檢測,檢測質量合格后,備用;
(二)反轉錄
(A)反轉錄的總RNA質量為1μg,體系為10μL,內參基因的反轉錄為polyA加尾法,miR156反轉錄為頸環(huán)引物法,引物如下:
⑴內參基因反轉錄體系:
⑵miR156反轉錄體系:
(B)將混合物進行70-80℃、5-8min預變性,完成后取出置于冰上;待其冷卻后,迅速離心,轉速500-3000r/min,離心20s,,將液體全部收集于管底;
(C)配制反轉錄體系,向每個樣品加入以下10μL:
(D)設置反轉錄程序,包括退火、延伸、逆轉錄酶失活三步:
該程序完成后,得到完整cDNA;
(三)qRT-PCR檢測:
(A)試劑:SYBR Green混合液;(B)儀器:定量PCR儀;(C)2個內參基因,1個目的基因,引物如下:
(D)qRT-PCRR體系,將cDNA模板稀釋2倍使用:
(E)反應程序:
(四)對qRT-PCR獲得的數(shù)據(jù)進行2-△△Ct法分析,在excel表中作柱狀圖,得到目的基因新疆野蘋果miR156的相對表達量。
2.根據(jù)權利要求1所述的新疆野蘋果miR156表達量的檢測方法,其特征在于:所述步驟(一)⑴中不同樹齡為生長1年、2年、3年、5年、6年或者幾十年;或者,所述步驟(一)⑴中葉片為新疆野蘋果的新生當年生枝條距頂端10cm的葉片;或者,所述步驟(一)⑴中愈傷組織為:取新疆野蘋果的當年生枝條,取葉片進行組織培養(yǎng)獲得的愈傷組織。
3.根據(jù)權利要求1所述的新疆野蘋果miR156表達量的檢測方法,其特征在于:所述步驟(三)(D)中cDNA模板稀釋2倍后,每個樣做三個重復。
4.根據(jù)權利要求1所述的新疆野蘋果miR156表達量的檢測方法,其特征在于:所述步驟(一)⑴中新疆野蘋果生長于新疆維吾爾自治區(qū)伊犁新源野果林。