1.引物和探針組合,其特征在于,包括:引物一、引物二和探針一的組合;和引物三、引物四和探針二的組合;
所述引物一由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2組成,
所述引物二由SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4組成,
所述探針一為SEQ ID NO:5,
所述引物三由SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:7組成,
所述引物四由SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:9組成,
所述探針二為SEQ ID NO:10。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的引物和探針組合在檢測或輔助檢測轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406中的應(yīng)用。
3.一種試劑盒,其特征在于,包括權(quán)利要求1所述的引物和探針組合。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,還包括Mix 2和Mix 1,所述Mix 2包括dNTPs、反應(yīng)緩沖液和MgCl2,所述Mix 1包括DNA聚合酶;
任選的,所述Mix 2和Mix 1均來自寶生物工程大連有限公司的貨號為RR060A的試劑盒中的試劑;
任選的,還包括基因組DNA提取試劑;
任選的,所述基因組DNA提取試劑來自天根生化科技(北京)有限公司的貨號為DP305-02的植物基因組DNA提取試劑盒中的試劑;
任選的,還包括Probe qPCR Mix;
任選的,所述Probe qPCR Mix來自寶生物工程(大連)有限公司的貨號為RR391S的試劑盒中的試劑;
任選的,還包括陽性對照和陰性對照;
任選的,所述陽性對照為轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406的DNA或含轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406的品系特異性序列的質(zhì)粒DNA,所述陰性對照不含轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406的品系特異性序列。
5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的試劑盒在檢測或輔助檢測轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406中的應(yīng)用。
6.一種檢測或輔助檢測轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406的雙重巢式熒光PCR方法,其特征在于,包括使用權(quán)利要求1所述的引物和探針組合或權(quán)利要求3-4中任一項所述試劑盒的步驟。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)雙重巢式熒光PCR擴增:以生物樣品含有的DNA為模板與權(quán)利要求1所述的引物一和引物三進行第一輪雙重PCR反應(yīng);然后以第一輪雙重PCR反應(yīng)所得的PCR產(chǎn)物為模板與引物二、引物四、探針一和探針二進行第二輪熒光PCR反應(yīng);
2)根據(jù)雙重巢式熒光PCR擴增的結(jié)果判斷生物樣品是否含有轉(zhuǎn)基因大豆DAS44406的品系特異性序列。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,在步驟1)之前還包括在生物樣品中提取DNA的步驟;
任選的,所述在生物樣品中提取DNA是采用天根生化科技(北京)有限公司的貨號為DP305-02的植物基因組DNA提取試劑盒進行。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于:所述雙重巢式熒光PCR擴增的第一輪雙重PCR反應(yīng)的反應(yīng)體系如下:
所述Mix 2包括dNTPs、MgCl2和反應(yīng)緩沖液;
所述Mix 1包括DNA聚合酶;
所述Mix 2和Mix 1均來自寶生物工程(大連)有限公司的貨號為RR060A的試劑盒中的試劑;
任選的,所述雙重巢式熒光PCR擴增的第二輪熒光PCR反應(yīng)的反應(yīng)體系如下:
所述Probe qPCR Mix來自寶生物工程大連有限公司的貨號為RR391S的試劑盒中的試劑。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法,其特征在于:所述雙重巢式熒光PCR擴增的第一輪雙重PCR反應(yīng)的反應(yīng)程序如下:94℃ 5min;94℃ 30s,60℃ 30s,72℃ 90s,15個循環(huán);72℃ 5min;
所述雙重巢式熒光PCR擴增的第二輪熒光PCR反應(yīng)的反應(yīng)程序如下:95℃預變性1min;95℃15s,60℃1min,40個循環(huán)。