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一種非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法與流程

文檔序號:12249188閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于,其包括:

以純化的Beauveria bassiana ATCC 7159菌株DNA為模板,通過聚合酶鏈式反應(yīng)分別擴增出具有AscI位點的目標(biāo)基因片段G1和具有B srGI位點的目標(biāo)基因片段G2,然后將G1連接到載體的NheI和PmlI位點之間,構(gòu)建質(zhì)粒P1,G2連接到另一個載體的NdeI和PmlI位點之間,構(gòu)建質(zhì)粒P2的步驟;和,

以P1和P2為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),擴增出目標(biāo)基因片段G3的步驟;和,

將G3連接到P1的AscI和PmlI位點之間或P2的BsrGI和PmlI位點之間,獲得重組質(zhì)粒P3的步驟;和,

將P1、P2或P3與包含NpgA基因片段的質(zhì)粒P4共轉(zhuǎn)化導(dǎo)入標(biāo)準菌株ATCC 208288,得到基因工程菌的步驟;和

將基因工程菌進行培養(yǎng)發(fā)酵,提取,得到非核糖體多肽活性產(chǎn)物的步驟。

2.如權(quán)利要求1所述的非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于包括以下步驟:

1)構(gòu)建重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA:

①以純化的Beauveria bassiana ATCC 7159菌株DNA為模板,使用引物組合:

上游引物bbBeas-F:5’-aaGCTAGCatggagccgctcaaaaatgt-3’,

下游引物bbBeas-R:5’-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3’,

通過聚合酶鏈式反應(yīng)擴增目標(biāo)基因片段C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas),擴增反應(yīng)的條件為:95℃40秒,63℃40秒,72℃15.5分鐘,36個循環(huán);

②利用限制性核酸內(nèi)切酶NheI和PmlI將步驟①擴增得到的目標(biāo)基因片段連接到pESC-URA載體上的NheI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA;

2)構(gòu)建重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA:

Ⅰ)以純化的Beauveria bassiana ATCC 7159菌株DNA為模板,使用引物組合:

上游引物bbBsls-F:5′-aaCATATGgagccacccaacaacgc-3′,

下游引物bbBsls-R:5′-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3′,

通過聚合酶鏈式反應(yīng)擴增目標(biāo)基因片段C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls),擴增反應(yīng)的條件為:95℃40秒,63℃40秒,72℃15.5分鐘,36個循環(huán);

Ⅱ)利用限制性核酸內(nèi)切酶NdeI和PmlI將上述擴增得到的基因片段連接到pESC-URA載體上的NdeI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA;

3)通過以下A、B、C、D、E或F步驟構(gòu)建重組質(zhì)粒;

A

A1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pE SC-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pES C-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

上游片段下游引物

BbBEAS with T2aT2bC3(BbBSLS)-R:5'-ggtgccgacttttgcaccatcgtcgtcgtccggg-3',

下游片段上游引物

BbBEAS with T2aT2bC3(BbBSLS)-F:5'-cccggacgacgacgatggtgcaaaagtcggcacc-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

得到目標(biāo)基因片段(AscI)bbBeas with T2aT2bC3(bbBsls)

A2.利用限制性核酸內(nèi)切酶AscI和PmlI將步驟A1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA的AscI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MT(bbBeas)T2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA;

B

B1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pE SC-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pES C-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

上游片段下游引物

BbBEAS with T2bC3(BbBSLS)-R:5'-tctttcttgtcctggcctccaccaccattcaaag-3',

下游片段上游引物

BbBEAS with T2bC3(BbBSLS)-F:5'-ctttgaatggtggtggaggccaggacaagaaaga-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

得到目標(biāo)基因片段(AscI)bbBeas with T2bC3(bbBsls);

B2.利用限制性核酸內(nèi)切酶AscI和PmlI將步驟B1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA的AscI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2a(bbBeas)T2bC3(bbBsls)in pESC-URA;

C

C1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pE SC-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pES C-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

上游片段下游引物

BbBEAS with C3(BbBSLS)-R:5'-gcatcggcggcgggaatgagttgaaacgcagtgt-3',

下游片段上游引物

BbBEAS with C3(BbBSLS)-F:5'-acactgcgtttcaactcattcccgccgccgatgc-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBEAS-AscI7195-F:5'-aaactagatggcgcgccctggatatccgccgt-3',

下游片段下游引物

BbBSLS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGtaaagacgcattcaaagcct-3';

得到目標(biāo)基因片段(AscI)bbBeas with C3(bbBsls);

C2.利用限制性核酸內(nèi)切酶AscI和PmlI將步驟C1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA的AscI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2b(bbBeas)-C3(bbBsls)in pESC-URA;

D

D1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pE SC-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pES C-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

上游片段下游引物

BbBSLS with T2aT2bC3(BbBEAS)-R:5'-ggcttctttttcttcgtctttttgatagctttgg-3',

下游片段上游引物

BbBSLS with T2aT2bC3(BbBEAS)-F:5'-ccaaagctatcaaaaagacgaagaaaaagaagcc-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

得到目標(biāo)基因片段(BsrGI)bbBsls with T2aT2bC3(bbBeas);

D2.利用限制性核酸內(nèi)切酶BsrGI和PmlI將步驟D1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA的BsrGI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MT(bbBsls)T2aT2bC3(bbBeas)in pESC-URA;

E

E1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pE SC-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pES C-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

上游片段下游引物

BbBSLS with T2bC3(BbBEAS)-R:5'-gacccttgcttcgcttgaccaccaccggccgaag-3',

下游片段上游引物

BbBSLS with T2bC3(BbBEAS)-F:5'-cttcggccggtggtggtcaagcgaagcaagggtc-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

得到目標(biāo)基因片段(BsrGI)bbBsls with T2bC3(bbBeas);

E2.利用限制性核酸內(nèi)切酶BsrGI和PmlI將步驟E1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA的BsrGI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2a(bbBsls)T2bC3(bbBeas)in pESC-URA;

F

F1.以步驟1)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBeas)in pES C-URA和步驟2)得到的重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA為模板,通過重疊延伸PCR技術(shù),進行兩輪擴增,第一輪擴增使用的引物為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

上游片段下游引物

BbBSLS with C3(BbBEAS)-R:5'-aaatcttcaacagacaagagctggaaggcagtgt-3',

下游片段上游引物

BbBSLS with C3(BbBEAS)-F:5'-acactgccttccagctcttgtctgttgaagattt-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

再以擴增得到的上游片段和下游片段的等比例混合物作為擴增模板,進行第二輪擴增,使用引物組合為:

上游片段上游引物

BbBSLS-BsrGI6843-F:5'-aaTGTACActtgcgcggctcagac-3',

下游片段下游引物

BbBEAS-B-PmlI-wostop-R:5'-aaCACGTGcaaagccgagtttagactct-3';

得到目標(biāo)基因片段(BsrGI)bbBsls with T2bC3(bbBeas);

F2.利用限制性核酸內(nèi)切酶BsrGI和PmlI將步驟F1中得到的目標(biāo)基因片段連接到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2bC3(bbBsls)in pESC-URA的BsrGI和PmlI位點之間,得到重組質(zhì)粒C1A1T1C2A2MTT2aT2b(bbBsls)-C3(bbBeas)in pESC-URA;

4)構(gòu)建重組質(zhì)粒NpgA in pESC-TRP:

α)以純化的Emericella nidulans ATCC 38163菌株DNA為模板,使用引物組合:

上游引物NpgA-NdeI-5:5'-aaCATATGgtgcaagacacatcaag-3’,

下游引物NpgA-PmeI-3:5'-aaGTTTAAACttaggataggcaatt-3’,

通過聚合酶鏈式反應(yīng)擴增目標(biāo)基因片段NpgA,擴增反應(yīng)的條件為:95℃40秒,63℃40秒,72℃1.1分鐘,30個循環(huán);

β)利用限制性核酸內(nèi)切酶NdeI和PmeI將步驟α)擴增得到的目標(biāo)基因片段連接到pESC-TRP載體上的NdeI和PmeI位點之間,得到重組質(zhì)粒NpgA in pESC-TRP;

5)構(gòu)建工程菌株:

將步驟1)得到的重組質(zhì)粒、步驟2)得到的重組質(zhì)?;虿襟E3)通過A、B、C、D、E或F得到的重組質(zhì)粒與步驟4)得到的重組質(zhì)粒N pgA in pESC-TRP共轉(zhuǎn)化導(dǎo)入標(biāo)準菌株ATCC 208288中,獲得工程菌株;

6)提取非核糖體多肽活性產(chǎn)物:

將步驟5)中獲得的工程菌株培養(yǎng)進行培養(yǎng),收集培養(yǎng)液并通過色譜分析柱進行洗脫,得到非核糖體多肽活性產(chǎn)物。

3.如權(quán)利要求2所述的非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于:3)的A、B、C、D、E和F步驟中,重疊延伸PCR技術(shù)的擴增反應(yīng)的條件均為:第一輪:95℃40秒,63℃40秒,72℃2分鐘,30個循環(huán);第二輪:95℃40秒,58℃40秒,72℃3分鐘,40個循環(huán)。

4.如權(quán)利要求2所述的非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于:步驟5)中,通過聚乙二醇-醋酸鋰介導(dǎo)的方法將步驟3)通過A、B、C、D、E或F得到的重組質(zhì)粒與重組質(zhì)粒NpgA in pESC-TRP共轉(zhuǎn)化導(dǎo)入標(biāo)準菌株ATCC 208288中。

5.如權(quán)利要求2所述的非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于:步驟6)中,將步驟5)中獲得的工程菌株培養(yǎng)在含有1%葡萄糖的YPD培養(yǎng)基中,在溫度30℃,轉(zhuǎn)速250rpm的條件下震蕩培養(yǎng)3天,得到培養(yǎng)液;

將培養(yǎng)液用等體積的乙酸乙酯提取,得到提取液;

將提取液進行減壓蒸干后,放入MCI色譜分析柱中,進行梯度洗脫,收集含有非核糖體多肽活性產(chǎn)物的組分用乙腈水溶液進行洗脫純化,得到非核糖體多肽活性產(chǎn)物。

6.如權(quán)利要求5所述的非核糖體多肽活性產(chǎn)物的獲得方法,其特征在于:將提取液進行減壓蒸干后,放入MCI色譜分析柱中,依次用體積比為0:100、20:80、50:50和100:0的甲醇水溶液進行梯度洗脫。

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