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一種可以裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶的制備方法與流程

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一種可以裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶的制備方法與流程

本發(fā)明涉及動(dòng)物生物醫(yī)藥工程技術(shù)領(lǐng)域,更具體地,涉及一種可以裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶的制備方法。



背景技術(shù):

大腸桿菌(Escherichia coli)既是人和動(dòng)物腸道中的一種正常棲息菌,同時(shí)也是一種重要的致病菌。大腸桿菌大致可分為腸道非致病性共生菌株、腸道致病性菌株和腸道外致病性菌株三大類。作為一種人和動(dòng)物常見(jiàn)的致病菌,它可導(dǎo)致腸道感染、尿道感染、全身性感染和其它臨床感染等。其中腸道外致病性菌株可引起嚴(yán)重的腸道外感染,尤其是尿道感染,并且在抗生素耐藥性傳播中扮演重要角色。在大腸桿菌多重耐藥性菌株中,腸道外致病性菌株比例居多。多重耐藥性問(wèn)題的出現(xiàn),給大腸桿菌感染的防控增添了不少難題。

沙門(mén)氏菌(Salmonella)是革蘭氏陰性腸道菌,是一種重要的食源性疾病的病原,已經(jīng)在世界范圍內(nèi)造成重大的經(jīng)濟(jì)損失并嚴(yán)重威脅到公共衛(wèi)生安全。由沙門(mén)氏菌感染導(dǎo)致的沙門(mén)氏菌病是一種食源性人畜共患病,臨床癥狀包括腸胃炎、菌血癥、傷寒癥和病灶感染等;腸胃炎癥狀可從溫和型腹部不適到嘔吐脫水,甚至出現(xiàn)死亡。人經(jīng)常因?yàn)閿z入被污染的動(dòng)物源食品而感染沙門(mén)氏菌,如攝入被沙門(mén)氏菌污染的雞蛋。在全球范圍內(nèi),每年由沙門(mén)氏菌感染導(dǎo)致的腸胃炎案例估計(jì)可達(dá)93,800,000例,死亡人數(shù)達(dá)155,000人之多,其中由食物傳播引起的案例占85%左右。

在大腸桿菌耐藥現(xiàn)狀中,β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥問(wèn)題尤為嚴(yán)重。這類菌株的耐藥機(jī)制主要是因?yàn)棣?內(nèi)酰胺酶的存在,該酶能夠降解β-內(nèi)酰胺類抗生素。近年來(lái),在腸道外致病性菌株中出現(xiàn)了新的β-內(nèi)酰胺酶,如質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶、廣譜β-內(nèi)酰胺酶和碳青霉烯酶等。最出名的新型β-內(nèi)酰胺酶于1983年首次被報(bào)道,并被命名為廣譜β-內(nèi)酰胺酶。這類酶能夠降解青霉素類、頭孢菌素類和單環(huán)β-內(nèi)酰胺類抗生素,但不能降解頭霉素和碳青霉烯類抗生素,其活性可被典型的β-內(nèi)酰胺酶抑制劑所抑制。碳青霉烯抗性是最近出現(xiàn)的新問(wèn)題,主要是由質(zhì)粒編碼的碳青霉烯酶所導(dǎo)致的,且目前碳青霉烯抗性主要出現(xiàn)在醫(yī)院的大腸桿菌菌株,給大腸桿菌感染的防治造成不小的難題。

沙門(mén)氏菌耐藥性問(wèn)題也日益嚴(yán)重,多重耐藥菌株層出不窮,對(duì)紅霉素、氨芐青霉素、復(fù)方新諾明、環(huán)丙沙星等的耐藥性均見(jiàn)報(bào)道。規(guī)?;i場(chǎng)的沙門(mén)氏菌耐藥性問(wèn)題也比較嚴(yán)峻,某研究者對(duì)分離自豬場(chǎng)糞樣的沙門(mén)氏菌進(jìn)行耐藥性分析,發(fā)現(xiàn)分離菌株對(duì)四環(huán)素、環(huán)丙沙星、恩諾沙星、阿莫西林、卡那霉素、氟苯尼考和氨芐西林等表現(xiàn)出高度耐藥。目前,多重耐藥菌株的廣泛流行,以及流行菌株不斷產(chǎn)生的對(duì)喹諾酮類、第三代頭孢菌素類等臨床重要抗生素的耐藥性,成為世界范圍內(nèi)新興的棘手問(wèn)題。因此,新型抗菌制劑的研發(fā)顯得極為迫切。

噬菌體廣泛存在于環(huán)境中,是以真菌、細(xì)菌等微生物為宿主的病毒,烈性噬菌體具有高效的殺菌能力。噬菌體在侵染周期的末期合成一種噬菌體裂解酶,裂解酶破壞宿主的細(xì)胞壁,使得宿主細(xì)胞滲透壓失衡并最終破裂而達(dá)到釋放子代噬菌體的目的。噬菌體及其裂解酶對(duì)抗生素耐藥菌同樣具有殺滅作用,通過(guò)基因工程技術(shù),可以大量地人工合成噬菌體裂解酶。因此,噬菌體及其裂解酶具有巨大的應(yīng)用前景。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是尋求新的可同時(shí)抑制大腸桿菌和沙門(mén)氏菌的抗菌制劑,以期減少和替代抗生素的使用,提供表達(dá)能裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體重組裂解酶TrxA-lysin的重組大腸桿菌BL21 /pET-32a-lysin的制備方法。

本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供上述方法制備得到的重組裂解酶TrxA-lysin。

本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供所述重組裂解酶TrxA-lysin用于裂解大腸桿菌和沙門(mén)氏菌。

本發(fā)明的目的是通過(guò)以下技術(shù)方案予以實(shí)現(xiàn)的:

一種可以裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶的制備方法,包括以下步驟:

S1. 擴(kuò)增噬菌體ECGD1的裂解酶lysin基因;與質(zhì)粒相連,并轉(zhuǎn)入基因工程菌獲得含lysin重組質(zhì)粒的基因工程菌;

S2. 培養(yǎng)所述含lysin重組質(zhì)粒的基因工程菌至菌液的OD值為0.6~0.8,用IPTG誘導(dǎo)含lysin重組質(zhì)粒的基因工程菌,獲得可溶性重組蛋白TrxA-lysin;所述裂解酶lysin基因的序列如SEQ ID NO:1所示。

優(yōu)選地,S1所述裂解酶lysin基因由引物P1和P2擴(kuò)增獲得,所述引物P1和P2的序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。

pET-32a表達(dá)系統(tǒng)具有以下優(yōu)點(diǎn):屬于原核表達(dá)系統(tǒng),適用于噬菌體裂解酶基因的表達(dá),自帶硫氧還原蛋白TrxA基因,可增加外源蛋白的二硫鍵形成,增加目的蛋白的可溶性表達(dá)。

作為一種具體的實(shí)施方式,本發(fā)明設(shè)計(jì)引物,采用PCR的方法獲得可裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶lysin基因。將該基因連接于pET-32a表達(dá)質(zhì)粒中構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a-lysin,以ITPG誘導(dǎo)表達(dá)重組蛋白TrxA-lysin。

優(yōu)選地,S2所述IPTG誘導(dǎo)的條件為:IPTG的終濃度為1mM,誘導(dǎo)時(shí)間為2h,誘導(dǎo)溫度為37℃。

作為一種更優(yōu)選地實(shí)施方式,本發(fā)明所述噬菌體裂解酶的制備方法的S1,包括以下步驟:

(1)設(shè)計(jì)引物,利用PCR技術(shù)對(duì)能裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體ECGD1的裂解酶lysin基因進(jìn)行擴(kuò)增。

(2)將獲得的lysin基因連接至pET-32a并篩選得到重組質(zhì)粒pET-32a-lysin;采用熱激轉(zhuǎn)化法將pET-32a-lysin重組質(zhì)粒導(dǎo)入大腸桿菌BL21中,獲得重組大腸桿菌BL21 /pET-32a-lysin。

優(yōu)選地,(1)所述PCR的反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃預(yù)變性3 min;98℃變性10 s,55℃退火10 s,72℃延伸10 s,完成30循環(huán);72℃后延伸5 min。

優(yōu)選地,(2)所述熱激轉(zhuǎn)化法為:取大腸桿菌BL21感受態(tài)細(xì)胞,加入pET-32a-lysin重組質(zhì)粒,混勻冰浴30 min,于42℃熱激轉(zhuǎn)化90 s后,冰浴2 min,加入LB液體培養(yǎng)基復(fù)蘇30 min,平板篩選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子。

優(yōu)選地,本發(fā)明所述噬菌體裂解酶的制備方法還包括純化可溶性重組蛋白TrxA-lysin的步驟。

更優(yōu)選地,所述純化可溶性重組蛋白TrxA-lysin的步驟為:離心收集誘導(dǎo)表達(dá)后的BL21/pET-32a-lysin菌體細(xì)胞,洗滌,重懸后過(guò)濾,用Ni NTA Beads裝入層析柱純化重組蛋白TrxA-lysin。

本發(fā)明還提供上述方法獲得的噬菌體裂解酶重組蛋白TrxA-lysin。

本發(fā)明還提供所述噬菌體裂解酶重組蛋白TrxA-lysin在裂解細(xì)菌方面的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供所述噬菌體裂解酶重組蛋白TrxA-lysin在制備預(yù)防和/或治療細(xì)菌感染的藥物方面的應(yīng)用。

優(yōu)選地,上述應(yīng)用中,所述細(xì)菌為大腸桿菌和/或沙門(mén)氏菌。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:

本發(fā)明提供了一種表達(dá)噬菌體ECGD1裂解酶lysin基因的重組大腸桿菌的制備方法。即采用E.coli BL21/pET-32a大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng),對(duì)噬菌體ECGD1裂解酶lysin基因進(jìn)行了重組表達(dá),通過(guò)硫鐵還原蛋白TrxA增加目的蛋白二硫鍵的形成和表達(dá)條件的優(yōu)化,成功獲得高活性的可溶性蛋白,蛋白純化無(wú)需經(jīng)過(guò)復(fù)雜的變性復(fù)性過(guò)程。同時(shí),將誘導(dǎo)后大腸桿菌BL21/pET-32a-lysin重懸液于-80℃和室溫之間凍融3次后,細(xì)菌重懸液變得澄清、粘稠,即通過(guò)簡(jiǎn)單的凍融,可使細(xì)胞破裂并將大部分目的蛋白釋放出來(lái)。本發(fā)明中重組裂解酶粗提物的制備可通過(guò)簡(jiǎn)單的凍融獲得,不僅操作簡(jiǎn)便、成本低廉,而且不易導(dǎo)致目的蛋白變性,適合用于裂解酶的大量制備。

將制備得到的重組蛋白TrxA-lysin用于裂解氯仿預(yù)處理過(guò)的大腸桿菌和沙門(mén)氏菌菌株,發(fā)現(xiàn)TrxA-lysin對(duì)多株大腸桿菌和沙門(mén)氏菌菌株具有裂解作用,即證實(shí)了TrxA-lysin可同時(shí)裂解大腸桿菌和沙門(mén)氏菌。同時(shí)TrxA-lysin的寬裂解譜揭示其在大腸桿菌和沙門(mén)氏菌感染的防控上具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

附圖說(shuō)明

圖1為噬菌體ECGD1電鏡照片(放大49,000倍)。

圖2為噬菌體ECGD1裂解酶lysin基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果:M為DL 2 000 DNA Marker;1為陰性對(duì)照;2和3為裂解酶lysin基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

圖3為重組質(zhì)粒pET-32a-lysin的雙酶切鑒定結(jié)果:M1為DL10000 DNA Marker;M2為DL 5 000 DNA Marker;1為重組質(zhì)粒pET-32a-lysin;2為重組質(zhì)粒pET-32a-lysin經(jīng)過(guò)Nco I、Hind III進(jìn)行雙酶切鑒定結(jié)果。

圖4為裂解酶重組蛋白TrxA-lysin的純化結(jié)果:M為蛋白標(biāo)準(zhǔn)分子量;1為BL21/pET-32a誘導(dǎo)4 h的細(xì)菌總蛋白;2和3分別為BL21/pET-32a-lysin誘導(dǎo)2 h的細(xì)菌總蛋白及其菌體凍融上清經(jīng)0.22 μm過(guò)濾后的樣品;4為鎳柱純化后的裂解酶重組蛋白。

圖5為裂解酶重組蛋白TrxA-lysin對(duì)氯仿預(yù)處理過(guò)的DH5α細(xì)胞的裂解效果。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合說(shuō)明書(shū)附圖和具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。這些實(shí)施例僅用于說(shuō)明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下例實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照本領(lǐng)域常規(guī)條件或按照制造廠商建議的條件。除非另行定義,文中所使用的所有專業(yè)與科學(xué)用語(yǔ)與本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉的意義相同。

實(shí)施例1 含lysin基因的大腸桿菌BL21表達(dá)菌株的構(gòu)建

包括以下步驟:

S1. 重組質(zhì)粒pET-32a-lysin的構(gòu)建

S11. lysin基因的獲得:從生活污水中分離得到了一株可同時(shí)裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體(命名為ECGD1,其電鏡照片見(jiàn)圖1),大量培養(yǎng)噬菌體后提取該噬菌體的基因組,并進(jìn)行高通量測(cè)序和測(cè)序結(jié)果的拼接和分析。

噬菌體ECGD1基因組的提?。喝?00 μl過(guò)濾除菌后的噬菌體濃縮液,加入DNase I與RNase A至終濃度均為1 μg/ml,37℃消化過(guò)夜(徹底去除宿主菌核酸),80℃滅活15 min(注意:該溫度不能滅活RNase A);向濃縮液中分別加入24 μl的0.5 mol/L EDTA(終濃度20 mmol/L),1.5 μl的20 mg/mL蛋白酶K(終濃度50 μg/mL),30 μl的10%SDS(終濃度0.5%),56℃水浴1 h;加等體積平衡酚,溫和震蕩1 min,12 000 rpm離心5 min,轉(zhuǎn)移上層水相于新的離心管中;加等體積酚—氯仿—異戊醇(25:24:1),溫和震蕩1 min,12 000 rpm離心5 min,轉(zhuǎn)移上層水相于新離心管中;加等體積異丙醇,-70℃放置3 h;4℃,13 000 rpm離心20 min,緩慢倒掉上清;加入等體積75%冰乙醇,靜置1 min,7 000 g離心1 min,緩慢倒掉乙醇,室溫開(kāi)蓋放置10 min,使乙醇完全揮發(fā),用適量的去離子水溶解DNA,-20℃保存。

將噬菌體ECGD1全基因序列上傳至GenBank(序列號(hào)為:KU522583.1),通過(guò)序列注釋和比對(duì)獲得了lysin基因,大小為501 bp。根據(jù)該基因序列設(shè)計(jì)引物P1、P2,在上游引物P1中插入限制性內(nèi)切酶Nco I酶切位點(diǎn),Nco I為含有起始密碼子ATG的融合表達(dá)酶切位點(diǎn),在其5’端加上4個(gè)保護(hù)堿基CATG。在下游引物P2中插入限制性內(nèi)切酶Hind III的酶切位點(diǎn),在下游引物5’端加入3個(gè)保護(hù)堿基CCC。lysin基因序列如SEQ ID NO:1所示;合成的P1、P2引物序列如SEQ ID NO:2~3所示;以1 μL噬菌體ECGD1的基因組為模板,加入高保真DNA聚合酶Prime STAR Max(2×) 25 μL,10 μM的引物P1、P2各1 μL,用ddH2O補(bǔ)至50 μL,反應(yīng)程序?yàn)?8℃預(yù)變性3 min;98℃變性10 s,55℃退火10 s,72℃延伸10 s,完成30循環(huán);72℃后延伸5 min。PCR反應(yīng)完成,將產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠觀察與回收,可見(jiàn)大小約500 bp的擴(kuò)增條帶,與預(yù)期結(jié)果一致(如圖2)。

S12. 重組質(zhì)粒pET-32a-lysin的構(gòu)建:將S11中回收的PCR產(chǎn)物用Nco I、Hind III進(jìn)行雙酶切處理,膠回收大小約500 bp的條帶;以同樣的方法對(duì)pET-32a空質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,膠回收大小約5900 bp的條帶。分別取4 μL雙酶切后膠回收的lysin基因完整修飾片段和1 μL雙酶切后膠回收的pET-32a空質(zhì)粒,加入1 μL的T4 DNA連接酶和1 μL 的10 × buffer,用ddH2O補(bǔ)至10 μL,混勻后置于16℃條件下連接過(guò)夜,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞,在含有100 μg/mL 氨芐青霉素(Ampicillin)的LB瓊脂培養(yǎng)板中,37℃培養(yǎng)過(guò)夜,然后挑取單個(gè)菌落。將菌落接種于含100 μg/mL 氨芐青霉素(Ampicillin)的LB液體培養(yǎng)基中過(guò)夜培養(yǎng)。PCR鑒定以待檢菌液為模板,加入DNA聚合酶2×EsTaq Master Mix 10 μL,引物P1、P2各0.5 μL,模板0.5 μL,用ddH2O補(bǔ)至20 μL,PCR反應(yīng)程序?yàn)?5℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72℃后延伸10 min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),可見(jiàn)大小約500 bp的擴(kuò)增條帶,與預(yù)期結(jié)果一致(如圖1)。對(duì)檢測(cè)陽(yáng)性的菌液用質(zhì)粒DNA抽提試劑盒進(jìn)行質(zhì)粒抽提,并進(jìn)行雙酶切鑒定和序列測(cè)定,雙酶切后電泳出現(xiàn)約500 bp和5900 bp兩條目的條帶(如圖3),并且測(cè)序鑒定結(jié)果與預(yù)期一致,即獲得了重組質(zhì)粒pET-32a-lysin。

S2. 含lysin基因的大腸桿菌BL21表達(dá)菌株的構(gòu)建

S21. 大腸桿菌BL21感受態(tài)細(xì)胞的制備:將凍存的E.coli BL21于LB平板培養(yǎng)基上劃線復(fù)蘇,挑取單菌落于LB液體培養(yǎng)基中過(guò)夜擴(kuò)大培養(yǎng)。按照1:100的比例將過(guò)夜培養(yǎng)的BL21接種于25 ml新鮮LB液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期,OD600nm值約為0.6。將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)入離心管中,冰上放置10 min,于4℃下3000 g離心10 min。棄去上清,用預(yù)冷的0.05 mol/L的CaCl2 溶液10 mL輕輕懸浮細(xì)胞,冰上放置15-30 min后,4℃下3000 g離心10 min。棄去上清,加入4 mL預(yù)冷含15%甘油的0.05 mol/L的CaCl2 溶液,輕輕懸浮細(xì)胞,冰上放置幾分鐘,即成感受態(tài)細(xì)胞懸液。

S22. 大腸桿菌BL21的轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)化子的PCR鑒定:取50 μL大腸桿菌BL21感受態(tài)細(xì)胞,冰浴上融解,加入1 μL pET-32a-lysin重組質(zhì)粒,輕輕混勻;將以上混合物冰浴30 min后放入42℃熱激90 s,迅速將混合物冰浴3 min,加入100μL的LB液體培養(yǎng)基,于37℃,140 rpm的培養(yǎng)條件培養(yǎng)45 min。將培養(yǎng)后的菌液均勻涂布于含100 μg/mL 氨芐青霉素(Ampicillin)的LB固體培養(yǎng)基中,于37℃培養(yǎng)過(guò)夜,挑取單菌落。將菌落接種于含100 μg/mL 氨芐青霉素(Ampicillin)的LB液體培養(yǎng)基中過(guò)夜培養(yǎng)。PCR鑒定以待檢菌液為模板,加入DNA聚合酶2×EsTaq Master Mix 10 μL,引物P1、P2各0.5 μL,模板0.5 μL,用ddH2O補(bǔ)至20 μL,PCR反應(yīng)程序?yàn)?5℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72℃后延伸10 min。。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),可見(jiàn)大小約500 bp的擴(kuò)增條帶。

S3. 含lysin基因的E.coli BL21/pET-32a-lysin重組表達(dá)菌誘導(dǎo)表達(dá)過(guò)程:

首先是最佳誘導(dǎo)時(shí)間的確定,將PCR鑒定為陽(yáng)性的BL21/pET-32a-lysin劃線培養(yǎng)過(guò)夜;挑取單菌落接種于3 mL LA液體培養(yǎng)基中,37℃,220 rpm培養(yǎng)10 h,取出菌液,置4℃冰箱過(guò)夜;按1%體積比例將上述菌液接種于3 mL LA液體培養(yǎng)基,37℃,220 rpm振搖培養(yǎng);當(dāng)OD600為0.6~0.8時(shí),加入終濃度為1 mmol/L IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。取誘導(dǎo)不同時(shí)間的菌液,12,000 rpm離心2 min,去上清,細(xì)菌沉淀中加100 μL 1×SDS上樣緩沖液,沸水中煮5 min左右,12,000 rpm離心2 min,取上清進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè)最佳誘導(dǎo)時(shí)間。同時(shí),設(shè)立pET-32a空質(zhì)粒在BL21中的誘導(dǎo)表達(dá)菌液作為對(duì)照。上樣前,將凝膠放進(jìn)垂直電泳槽,將電壓設(shè)置為80 V進(jìn)行預(yù)電泳30 min以消除凝膠中未聚合物質(zhì)的影響;上樣后設(shè)定電壓為80 V,待溴酚藍(lán)染料壓成一條水平的直線,即將進(jìn)入分離膠時(shí)將電壓升高至160 V;染料接近凝膠底部時(shí)停止電泳。取下凝膠,于水平搖床上用考馬斯亮藍(lán)染色液染色1 h左右,再用脫色液進(jìn)行脫色,期間更換脫色液,脫色至蛋白區(qū)帶清晰為止,用凝膠成像系統(tǒng)對(duì)凝膠進(jìn)行照相。

結(jié)果顯示最佳誘導(dǎo)時(shí)間為2 h。利用上述確定的最佳誘導(dǎo)時(shí)間,進(jìn)行目的蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)。離心收集誘導(dǎo)后的菌體,用1 mL PBS重懸后,在-80℃和室溫之間反復(fù)凍融3次,4℃條件下10,000 rpm離心2 min,取上清液,加入等體積的2×SDS上樣緩沖液,沸水中煮5 min左右,12,000 rpm離心2 min,取上清進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè)重組蛋白的表達(dá)形式,結(jié)果顯示目的蛋白主要為可溶性表達(dá)。

S4.重組蛋白TrxA-lysin純化過(guò)程:離心收集誘導(dǎo)表達(dá)后的BL21/pET-32a-lysin菌體細(xì)胞,用PBS洗滌兩次。按照菌體:Lysis buffer = 1:10(W/V)將菌體懸浮起來(lái),于-80℃和室溫之間反復(fù)凍融3次,4℃條件下10,000 rpm離心20 min,取上清液,并用0.22 μm濾膜過(guò)濾,收集濾液,用于目的蛋白的純化。

將Ni NTA Beads裝入合適的層析柱,用5倍柱體積的Lysis buffer平衡柱子,使填料與目的蛋白處于相同的緩沖體系下,起到保護(hù)蛋白的作用。將樣品加到平衡好的Ni NTA Beads中(保證目的蛋白與Ni2+充分接觸,提高目的蛋白的回收率),收集流出液,用于SDS-PAGE分析蛋白質(zhì)的結(jié)合情況。用10~15倍柱體積的Wash buffer進(jìn)行清洗,去除非特異性吸附的雜蛋白,收集洗雜液。使用5~10倍柱體積的Elution buffer洗脫柱子,收集洗脫液,即目的蛋白組分。利用10 kDa超濾離心管對(duì)純化的蛋白進(jìn)行后續(xù)脫鹽及濃縮處理。純化結(jié)果如圖4所示。

實(shí)施例2 重組蛋白TrxA-lysin的活性檢測(cè)

包括以下步驟:

S1. 用重組蛋白TrxA-lysin裂解氯仿預(yù)處理過(guò)的DH5α:按1%比例將待測(cè)菌株接種于LB培養(yǎng)基中,過(guò)夜培養(yǎng),菌液中加入終濃度為5%的氯仿,振蕩培養(yǎng)15 min,離心收集菌體,并用去離子水清洗兩次,-80℃保存?zhèn)溆?。測(cè)定活性之前,細(xì)菌沉淀用50 mmol/L的Tris-HCl(PH 8.2,含0.1% Triton X-100)重懸。將10 μL的裂解酶溶液(重組蛋白TrxA-lysin溶液)加入到90 μL細(xì)菌重懸液中,室溫靜置至裂解效果明顯,測(cè)定OD450。試驗(yàn)設(shè)置三個(gè)重復(fù),且將Tris-HCl緩沖液處理作為陰性對(duì)照。由于噬菌體ECGD1能裂解大腸桿菌基因工程菌株DH5α,因此先用DH5α作為待測(cè)菌株檢測(cè)重組裂解酶TrxA-lysin的裂解活性。利用氯仿預(yù)處理的濁度法檢測(cè)重組裂解酶TrxA-lysin的裂解活性,發(fā)現(xiàn)菌液在TrxA-lysin的作用下迅速變得澄清,OD450在10 min內(nèi)降低了0.79(圖5),說(shuō)明本試驗(yàn)表達(dá)的TrxA-lysin具有裂解活性。

S2. 多粘菌素B與重組蛋白TrxA-lysin聯(lián)用裂解活菌:該試驗(yàn)分為兩組,包括多粘菌素B與重組蛋白協(xié)同作用組和多粘菌素B對(duì)照組。協(xié)同作用組試驗(yàn)處理大致為,用2倍倍比稀釋法制備含多粘菌素B終濃度為210、29、28、27……2-4、2-5 μg/mL的LB培養(yǎng)基(每個(gè)梯度3 mL),往每個(gè)稀釋梯度添加100 μL重組蛋白TrxA-lysin溶液,再按1%比例接種大腸桿菌DH5α,37℃振蕩培養(yǎng)過(guò)夜。多粘菌素B對(duì)照組處理同上,但是不添加重組蛋白TrxA-lysin溶液。結(jié)果顯示,多粘菌素B對(duì)照組中,多粘菌素B對(duì)DH5α最低抑菌濃度為2 μg/mL;裂解酶TrxA-lysin與多粘菌素B協(xié)同作用組中,多粘菌素B對(duì)DH5α最低抑菌濃度為1 μg/mL。即裂解酶TrxA-lysin的存在降低了多粘菌素B的最低抑菌濃度,從而證明這兩者存在協(xié)同抑菌效果。

S3. 重組蛋白TrxA-lysin裂解譜的測(cè)定:利用S1所述的氯仿預(yù)處理的方法檢測(cè)裂解酶重組蛋白對(duì)測(cè)試菌株的裂解活性,觀察細(xì)菌裂解效果及其OD450值變化。測(cè)試菌株包括大腸桿菌和沙門(mén)氏菌臨床分離菌株,以及大腸桿菌基因工程菌株。裂解酶對(duì)待測(cè)菌株的裂解值=Δ450nm(試驗(yàn)組降低值)—Δ450nm(Tris-HCl對(duì)照組降低值)。相對(duì)裂解活性=裂解酶對(duì)待測(cè)菌株的裂解值/裂解酶對(duì)DH5α的裂解值。以大腸桿菌DH5α為裂解陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn),利用氯仿預(yù)處理的濁度法檢測(cè)裂解酶對(duì)大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的裂解活性,結(jié)果顯示,裂解酶對(duì)不同來(lái)源的大腸桿菌及沙門(mén)氏菌均有裂解活性,表現(xiàn)出對(duì)大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的廣譜殺菌活性。由相對(duì)裂解活性測(cè)定結(jié)果得知,裂解酶對(duì)大腸桿菌的裂解活性普遍高于沙門(mén)氏菌。

SEQUENCE LISTING

<110> 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)

<120> 一種可以裂解大腸桿菌及沙門(mén)氏菌的噬菌體裂解酶的制備方法

<130>

<160> 3

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 501

<212> DNA

<213> 裂解酶lysin基因序列

<400> 1

atggctaaag tagttgatgt gtttgatatg ttacgttttg atgaaggact aaagctaact 60

gtatatactg ataccgaagg gtattggacg gttggtattg gacaccttct gacaaaactt 120

aaagataaat cagaagctat acgcattctt gataacttag taggtagaaa aactaatggg 180

gttattactg aagcggaagc tagaaaaatc tttgagggtg acgtaaagaa agcgatacaa 240

caaatccatt caagtaccat attatctcct atttacgata aagtaagtcc taatcgtaaa 300

atggctatta tcaatatggt atttcaaatg ggattgaaag gtgcagaatc tttcaaaaat 360

agcttgactt tagtgagtaa ttcatattat actcaagcct ctataaattt acgtaaaagt 420

aaatggtatc gccaaacgcc taatcgcgca gagcgtgtaa ttcaggtgct taaaactgga 480

acattagacg cttataacta a 501

<210> 2

<211> 26

<212> DNA

<213> 引物P1序列

<400> 2

catgccatgg ctaaagtagt tgatgt 26

<210> 3

<211> 29

<212> DNA

<213> 引物P2序列

<400> 3

cccaagcttt tagttataag cgtctaatg 29

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