1.一種篩選與棉花抗旱性相關(guān)基因的方法,包括如下步驟:
(1)設(shè)置如下實(shí)驗組和對照組:
實(shí)驗組:對待測棉花進(jìn)行干旱脅迫處理;
對照組:對所述待測棉花不進(jìn)行干旱脅迫處理;
(2)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式,找到兩組中甲基化水平和/或模式存在差異的基因,即為或候選為與棉花抗旱性相關(guān)基因。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于:所述棉花為陸地棉。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的方法,其特征在于:步驟(2)中,采用MSAP技術(shù)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于:采用MSAP技術(shù)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式時,雙酶切組合為EcoR I/Hpa II和EcoR I/Msp I。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于:采用MSAP技術(shù)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式時,針對EcoR I的接頭由序列表中序列1和序列2所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成,針對Hpa II和Msp I的接頭由序列表中序列3和序列4所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其特征在于:采用MSAP技術(shù)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式時,針對EcoR I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列5所示單鏈DNA分子,針對Hpa II和Msp I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列6所示單鏈DNA分子。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于:采用MSAP技術(shù)檢測并比較所述實(shí)驗組和所述對照組中所述待測棉花的基因組DNA的甲基化水平和/或模式時,針對EcoR I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列7、序列8、序列9或序列10所示單鏈DNA分子,針對Hpa II和Msp I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列11、序列12、序列13或序列14所示單鏈DNA分子。
8.含有如下組合的產(chǎn)品在篩選與棉花抗旱性相關(guān)基因中的應(yīng)用:
(1)限制性內(nèi)切酶EcoR I、Hpa II和Msp I;
(2)針對EcoR I的接頭,以及針對Hpa II和Msp I的接頭;
所述針對EcoR I的接頭由序列表中序列1和序列2所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成;所述針對Hpa II和Msp I的接頭由序列表中序列3和序列4所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成;
(3)針對EcoR I的預(yù)擴(kuò)增引物和針對Hpa II和Msp I的預(yù)擴(kuò)增引物;
所述針對EcoR I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列5所示單鏈DNA分子;所述針對Hpa II和Msp I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列6所示單鏈DNA分子;
(4)針對EcoR I的選擇性擴(kuò)增引物和針對Hpa II和Msp I的選擇性擴(kuò)增引物;
所述針對EcoR I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列7、序列8、序列9或序列10所示單鏈DNA分子;所述針對Hpa II和Msp I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列11、序列12、序列13或序列14所示單鏈DNA分子。
9.一種用于篩選與棉花抗旱性相關(guān)基因的產(chǎn)品,含有如下:
(1)限制性內(nèi)切酶EcoR I、Hpa II和Msp I;
(2)針對EcoR I的接頭,以及針對Hpa II和Msp I的接頭;
所述針對EcoR I的接頭由序列表中序列1和序列2所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成;所述針對Hpa II和Msp I的接頭由序列表中序列3和序列4所示的兩條單鏈DNA分子互補(bǔ)配對形成;
(3)針對EcoR I的預(yù)擴(kuò)增引物和針對Hpa II和Msp I的預(yù)擴(kuò)增引物;
所述針對EcoR I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列5所示單鏈DNA分子;所述針對Hpa II和Msp I的預(yù)擴(kuò)增引物為序列表中序列6所示單鏈DNA分子;
(4)針對EcoR I的選擇性擴(kuò)增引物和針對Hpa II和Msp I的選擇性擴(kuò)增引物;
所述針對EcoR I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列7、序列8、序列9或序列10所示單鏈DNA分子;所述針對Hpa II和Msp I的選擇性擴(kuò)增引物為序列表中序列11、序列12、序列13或序列14所示單鏈DNA分子。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的應(yīng)用或權(quán)利要求9所述的產(chǎn)品,其特征在于:所述棉花為陸地棉。