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基于FLT3和NAT2基因的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物、試劑盒及應(yīng)用的制作方法

文檔序號:12697868閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于FLT3和NAT2基因的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物,其特征在于,所述的SNP標志物是包括FLT3基因SNP位點和NAT2基因SNP位點的組合,所述的FLT3基因SNP位點是rs9319408,所述NAT2基因SNP位點是rs4921914、rs10103029和rs7816847中一個或多個。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物,其特征在于,所述的SNP標志物還包括VAV2基因SNP位點rs679106、XO基因SNP位點rs1429372和IL6基因SNP位點rs2069852中一個或多個。

3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物,其特征在于,所述的SNP標志物還包括NAT2基因的其他與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP位點rs1041983和/或rs1495741。

4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物在抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)方面非診斷的應(yīng)用。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的SNP標志物在抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)方面非診斷的應(yīng)用。

6.一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒用于檢測與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的至少如下的SNP標志物:所述的SNP標志物是包括FLT3基因SNP位點和NAT2基因SNP位點的組合,所述的FLT3基因SNP位點是rs9319408,所述NAT2基因SNP位點是rs4921914、rs10103029和rs7816847中一個或多個。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒含有特異于如權(quán)利要求6所述的SNP標志物的特異性擴增引物和/或特異于如權(quán)利要求6所述的SNP標志物的特異性延伸引物。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性擴增引物中:

所述的SNP位點rs9319408的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.10和SEQ ID No.11。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性延伸引物中:

所述的SNP位點rs9319408的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.12。

10.根據(jù)權(quán)利要求8或9所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性擴增引物中:

所述的SNP位點s4921914的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.22和SEQ ID No.23;

所述的SNP位點rs10103029的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.25和SEQ ID No.26;

所述的SNP位點rs7816847的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.28和SEQ ID No.29。

11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性延伸引物中:

所述的SNP位點rs4921914的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.24;

所述的SNP位點rs10103029的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.27;

所述的SNP位點rs7816847的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.30。

12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒還用于檢測與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的VAV2基因SNP位點rs679106、XO基因SNP位點rs1429372和IL6基因SNP位點rs2069852中的一個或多個。

13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒含有特異于如權(quán)利要求12所述的SNP標志物的特異性擴增引物和/或特異于如權(quán)利要求12所述的SNP標志物的特異性延伸引物。

14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性擴增引物中:

所述的SNP位點rs679106的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.13和SEQ ID No.14;

所述的SNP位點rs1429372的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.16和SEQ ID No.17;

所述的SNP位點rs2069852的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.19和SEQ ID No.20。

15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性延伸引物中:

所述的SNP位點rs679106的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.15;

所述的SNP位點rs1429372的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.18;

所述的SNP位點rs2069852的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.21。

16.根據(jù)權(quán)利要求15所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒還用于檢測與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的NAT2基因位點rs1495741和/或rs1041983。

17.根據(jù)權(quán)利要求16所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒含有特異于如權(quán)利要求16所述的SNP標志物的特異性擴增引物和/或特異于如權(quán)利要求16所述的SNP標志物的特異性延伸引物。

18.根據(jù)權(quán)利要求17所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性擴增引物中:

所述的SNP位點rs1041983的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.31和SEQ ID No.32;

所述的SNP位點rs1495741的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.34和SEQ ID No.35。

19.根據(jù)權(quán)利要求18所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,在所述的含有的特異性延伸引物中:

所述的SNP位點rs1041983的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.33;

所述的SNP位點rs1495741的特異性延伸引物序列為SEQ ID No.36。

20.根據(jù)權(quán)利要求19所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒用于檢測FLT3基因SNP位點rs9319408,NAT2基因SNP位點rs4921914、VAV2基因SNP位點rs679106、XO基因SNP位點rs1429372、IL6基因SNP位點rs2069852和NAT2基因SNP位點rs1495741;

其中,所述的試劑盒含有以上所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物,并且,所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物分別如下:

rs9319408的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.10和SEQ ID No.11;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.12;

rs4921914的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.22和SEQ ID No.23;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.24;

rs679106的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.13和SEQ ID No.14;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.15;

rs1429372的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.16和SEQ ID No.17;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.18;

rs2069852的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.19和SEQ ID No.20;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.21;

rs1495741的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.34和SEQ ID No.35;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.36。

21.根據(jù)權(quán)利要求19所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒用于檢測FLT3基因SNP位點rs9319408、NAT2基因SNP位點rs4921914、XO基因SNP位點rs1429372、以及NAT2基因SNP位點rs1041983和rs1495741;

其中,所述的試劑盒含有以上所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物,并且,所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物分別如下:

rs9319408的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.10和SEQ ID No.11;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.12;

rs4921914的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.22和SEQ ID No.23;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.24;

rs1429372的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.16和SEQ ID No.17;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.18;

rs1041983的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.31和SEQ ID No.32;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.33;

rs1495741的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.34和SEQ ID No.35;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.36。

22.根據(jù)權(quán)利要求19所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒用于檢測FLT3基因SNP位點rs9319408、NAT2基因SNP位點rs10103029、XO基因SNP位點rs1429372、以及NAT2基因SNP位點rs1041983和rs1495741;

其中,所述的試劑盒含有以上所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物,并且,所需檢測基因SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物分別如下:

rs9319408的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.10和SEQ ID No.11;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.12;

rs10103029的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.25和SEQ ID No.26;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.27;

rs1429372的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.16和SEQ ID No.17;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.18;

rs1041983的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.31和SEQ ID No.32;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.33;

rs1495741的特異性擴增引物序列為SEQ ID No.34和SEQ ID No.35;其特異性延伸引物序列為SEQ ID No.36。

23.根據(jù)權(quán)利要求11所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒還用于檢測與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的NAT2基因位點rs1495741和/或rs1041983。

24.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒還用于檢測與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的VAV2基因SNP位點rs679106、XO基因SNP位點rs1429372和IL6基因SNP位點rs2069852中的一個或多個。

25.根據(jù)權(quán)利要求24所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,該試劑盒還用于檢測與其他抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的NAT2基因位點。

26.根據(jù)權(quán)利要求25所述的一種評估抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)風(fēng)險的試劑盒,其特征在于,所述的其他與抗結(jié)核藥物肝毒性反應(yīng)相關(guān)的NAT2基因位點是rs1495741和/或rs1041983。

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