本發(fā)明屬于分子生物檢測,尤其涉及一種用于檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的多重熒光定量pcr檢測組合物、方法及試劑盒。
背景技術(shù):
1、昆蟲病毒作為一類以昆蟲為宿主并能使昆蟲致病的病毒,其以昆蟲作為媒介,同時也能夠感染人類及其他哺乳動物,引發(fā)疫病,嚴重可導致死亡。昆蟲細胞被廣泛應(yīng)用于在生物醫(yī)藥領(lǐng)域中,包括high?five細胞、sf9細胞、d.mel-2細胞在內(nèi)的昆蟲細胞常被用于病毒疫苗、重組蛋白以及病毒載體的生產(chǎn)中,因此昆蟲細胞中的外源病毒感染被認為是一項主要的安全性問題。
2、常見的能夠感染昆蟲細胞的rna病毒包括彈狀病毒科、諾達病毒科、黃病毒科、布尼亞病毒科等,而比較具有代表性的病毒包括被報道能感染sf細胞系的sf彈狀病毒、能夠感染high?five細胞的獸棚病毒變異株、包括牛病毒性腹瀉病毒、豬瘟病毒、乙腦病毒在內(nèi)的哺乳動物病毒、以及腦心肌炎病毒、松毛蟲ω病毒、白蛉熱病毒等。
3、目前傳統(tǒng)的昆蟲病毒檢測方法一般包括生物學測定法、電子顯微鏡觀察、基于酶聯(lián)免疫吸附反應(yīng)的血清學方法、基于核酸分析的pcr檢測方法等,普遍存在檢測靈敏度低、特異性差等情況,同時傳統(tǒng)的qpcr方法多采用單獨的檢測試劑盒,操作繁瑣、耗時長、容易出現(xiàn)假陽性或無法覆蓋較全的病毒種類,不同病毒檢測反應(yīng)體系及程序相差較大,無法滿足多種病毒同時檢測的需求。同時常見的rna病毒檢測方法在rna抽提、反轉(zhuǎn)等過程中沒有較好的質(zhì)控品,傳統(tǒng)的qpcr選擇的標準品多為質(zhì)粒,并能不夠比較真實的反應(yīng)rna病毒的狀態(tài)。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于提供一種用于檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的多重熒光定量pcr檢測組合物、方法及試劑盒,可以準確、快速的檢測樣品中的昆蟲病毒。
2、為了實現(xiàn)上述目的,本技術(shù)采用了如下技術(shù)方案:
3、第一方面,本發(fā)明提供了一種用于檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的多重熒光定量pcr檢測組合物,所述檢測組合物包括檢測如下rna病毒的引物和探針:
4、檢測sf彈狀病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:1所示,下游引物如seq?idno:2所示,探針如seq?id?no:3所示;
5、檢測獸棚病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:4所示,下游引物如seq?idno:5所示,探針如seq?id?no:6所示;
6、檢測牛病毒性腹瀉病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:7所示,下游引物如seq?id?no:8所示,探針如seq?id?no:9所示;
7、檢測豬瘟病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:10所示,下游引物如seq?idno:11所示,探針如seq?id?no:12所示;
8、檢測乙腦病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:13所示,下游引物如seq?idno:14所示,探針如seq?id?no:15所示;
9、檢測果蠅x病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:16所示,下游引物如seq?idno:17所示,探針如seq?id?no:18所示;
10、檢測腦心肌炎病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:19所示,下游引物如seqid?no:20所示,探針如seq?id?no:21所示;
11、檢測松毛蟲ω病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:22所示,下游引物如seqid?no:23所示,探針如seq?id?no:24所示;
12、檢測白蛉熱病毒的引物和探針:上游引物如seq?id?no:25所示,下游引物如seqid?no:26所示,探針如seq?id?no:27所示。
13、第二方面,本發(fā)明提供了一種用于檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的多重熒光定量pcr檢測試劑盒,所述檢測試劑盒包含上述檢測組合物。
14、探針的熒光基團為fam、vic或cy5,淬滅基團選擇bhq1或bhq2。
15、在以上技術(shù)方案中,所述檢測試劑盒包含陽性對照品、陰性對照品以及熒光定量pcr反應(yīng)試劑。
16、在以上技術(shù)方案中,所述熒光定量pcr反應(yīng)試劑為熒光定量pcr反應(yīng)預(yù)混液,包括2×one?step?rt-pcr?bufferⅲ、ex?taq?hs、rt?enzyme?mixⅱ、rox?reference?dye內(nèi)參染料、無核酶水、以及上述檢測組合物。
17、在以上技術(shù)方案中,所述陽性對照品包含陽性rna標準品,濃度均為2×108copies/μl。
18、在以上技術(shù)方案中,所述檢測試劑盒中的熒光定量pcr反應(yīng)體系為20μl,包含15μl的所述熒光定量pcr反應(yīng)預(yù)混液和5μl的模板;所述模板為待測樣品的rna、陽性對照標準品和陰性對照標準品。
19、在以上技術(shù)方案中,所述反應(yīng)體系的反應(yīng)條件為:42℃反轉(zhuǎn)5min;95℃預(yù)變性3min;95℃變性5s,60℃退火34s,40個循環(huán)。
20、第三方面,本發(fā)明提供了一種用于檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的多重熒光定量pcr檢測方法,所述檢測方法非診斷或治療目的,包括如下步驟:
21、(1)提取待測樣品的rna模板;
22、(2)采用上述檢測組合物建立熒光定量pcr反應(yīng)體系;
23、(3)進行熒光定量pcr檢測;
24、(4)待測樣品的結(jié)果分析。
25、在以上技術(shù)方案中,所述熒光定量pcr反應(yīng)體系為20μl,包含15μl的熒光定量pcr反應(yīng)預(yù)混液和5μl的模板;所述模板為待測樣品的rna、陽性對照標準品和陰性對照標準品;所述熒光定量pcr反應(yīng)預(yù)混液包括2×one?step?rt-pcr?bufferⅲ、ex?taq?hs、rt?enzymemixⅱ、rox?reference?dye內(nèi)參染料、無核酶水、以及上述檢測組合物。
26、在以上技術(shù)方案中,所述熒光定量pcr反應(yīng)體系的反應(yīng)條件為:42℃反轉(zhuǎn)5min;95℃預(yù)變性3min;95℃變性5s,60℃退火34s,40個循環(huán)。
27、本發(fā)明的有益效果在于:
28、1、本發(fā)明旨在檢測能夠感染昆蟲細胞的多種rna病毒,通過數(shù)據(jù)庫分析比對分析,尋找病毒基因組保守序列,設(shè)計具有較強特異性的引物探針,可檢出該病毒的絕大部分亞型。
29、2、本發(fā)明所述檢測組合物,其中探針熒光報告基團可選擇fam、vic或cy5,熒光淬滅基團選擇bhq1或bhq2,即可滿足檢測上述任意一種的rna病毒,同時可檢測任意組合的rna病毒。
30、3、通過對病毒保守區(qū)域設(shè)計多對探針引物,最終篩選特異性好、靈敏度高的引物探針,可準確定量2×107copies/μl至20copies/μl的病毒含量,大部分病毒檢測靈敏度能達到10copies/μl,部分病毒最低靈敏度可達2copies/μl。
31、4、本發(fā)明所述檢測昆蟲細胞中多種rna病毒的檢測試劑盒,含有用于檢測的陽性rna標準品,能夠更真實的反應(yīng)rna病毒檢測過程,同時對rna的qpcr檢測方法進行測試,能夠滿足在一個程序里同時檢測多種rna病毒。
32、5、本發(fā)明通過反復(fù)篩選優(yōu)化反應(yīng)體系,包括引物和探針的濃度,最終該檢測方法可在較少核酸樣本下,能夠穩(wěn)定檢出多種rna病毒,操作簡單,且具有較高的靈敏度。