述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀的方 法,所述方法為下述1)、2)或3):
[0038] 1)鑒定或輔助鑒定小麥千粒重性狀的方法,包括按照所述鑒定或輔助鑒定小麥基 因型的方法鑒定待測(cè)小麥的基因型,根據(jù)待測(cè)小麥的基因型確定所述待測(cè)小麥的千粒重性 狀:AlAl基因型待測(cè)小麥的千粒重高于或候選高于A3A3基因型待測(cè)小麥的千粒重,A2A2基 因型待測(cè)小麥的千粒重高于或候選高于A3A3基因型待測(cè)小麥的千粒重;
[0039] 2)鑒定或輔助鑒定小麥每穗小穗數(shù)性狀的方法,包括按照所述鑒定或輔助鑒定小 麥基因型的方法鑒定待測(cè)小麥的基因型,根據(jù)待測(cè)小麥的基因型確定所述待測(cè)小麥的每穗 小穗數(shù)性狀:AlAl基因型待測(cè)小麥的每穗小穗數(shù)小于或候選小于A3A3基因型待測(cè)小麥的每 穗小穗數(shù),A2A2基因型待測(cè)小麥的每穗小穗數(shù)小于或候選小于A3A3基因型待測(cè)小麥的每穗 小穗數(shù);
[0040] 3)鑒定或輔助鑒定小麥單株穗數(shù)性狀的方法,包括按照所述鑒定或輔助鑒定小麥 基因型的方法鑒定待測(cè)小麥的基因型,根據(jù)待測(cè)小麥的基因型確定所述待測(cè)小麥的單株穗 數(shù)性狀:A1A1基因型待測(cè)小麥的單株穗數(shù)小于或候選小于A3A3基因型待測(cè)小麥的單株穗 數(shù)。
[0041] 上述鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀的方法中,所述待測(cè)小麥不為A1A3基因型 小麥、A1A2基因型小麥和A2A3基因型小麥。
[0042] 為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了 CAPS-7A。
[0043] 為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了下述I-VI中的任一種:
[0044] I、所述引物對(duì)P在下述Z1-Z5任一種中的應(yīng)用;
[0045] Zl、鑒定或輔助鑒定小麥基因型;
[0046] Z2、制備鑒定或輔助鑒定小麥基因型產(chǎn)品;
[0047] Z3、鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀;所述小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀為小麥千粒重、每 穗小穗數(shù)和/或單株穗數(shù);
[004引Z4、制備鑒定或輔助鑒定所述小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀產(chǎn)品;
[0049] Z5、小麥育種;
[0050] n、所述成套試劑在上述Z1-Z5任一種中的應(yīng)用;
[0051] 虹、所述鑒定或輔助鑒定小麥基因型的方法在上述Z3或巧中的應(yīng)用;
[0052] IV、所述鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀的方法在上述巧中的應(yīng)用;
[0化3] V、CAPS-7A在上述巧中的應(yīng)用。
[0化4] VI、檢測(cè)CAPS-7A的物質(zhì)在上述Z1-Z5任一種中的應(yīng)用。
[0055] 所述檢測(cè)CAPS-7A的物質(zhì)可為由所述成套試劑與進(jìn)行PCR擴(kuò)增所需的其他試劑和/ 或儀器。所述進(jìn)行PCR擴(kuò)增所需的其他試劑可為含有dATP、dTTP、dCTP和dGTP的dNTPs、DNA聚 合酶和/或PCR反應(yīng)緩沖液;所述進(jìn)行PCR擴(kuò)增所需的儀器可為PCR儀。
[0056] 為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了小麥育種方法,所述方法包括按照所述鑒 定或輔助鑒定小麥基因型的方法鑒定小麥的基因型,選擇AlAl、A2A2或A3A3基因型的小麥 作為親本進(jìn)行育種。
[0057] 本發(fā)明中,所述小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀可為小麥千粒重、每穗小穗數(shù)和/或單株穗數(shù)。 [005引本發(fā)明中,在檢測(cè)PCR產(chǎn)物的大小時(shí),可通過(guò)電泳檢測(cè),也可通過(guò)測(cè)序檢測(cè)。
[0059] 實(shí)驗(yàn)證明,本發(fā)明的發(fā)明人根據(jù)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)與小麥產(chǎn)量相關(guān)的小麥分子標(biāo)記 CAPS-7A,根據(jù)CAPS-7A對(duì)小麥進(jìn)行基因型分型,共可W得到S種均為純合型的基因型,即 AlAl基因型、A2A2基因型和A3A3基因型。AlAl與A2A2基因型小麥的每穗小穗數(shù)均極顯著低 于A3A3基因型小麥,AlAl與A2A2基因型小麥間的每穗小穗數(shù)無(wú)顯著差異;AlAl基因型小麥 的單株穗數(shù)極顯著低于A3A3基因型小麥,AlAl與A2A2基因型小麥間的單株穗數(shù)無(wú)顯著差 異,A2A2與A3A3基因型小麥間的單株穗數(shù)無(wú)顯著差異;AlAl與A2A2基因型小麥的千粒重均 顯著高于A3A3基因型小麥,AlAl與A2A2基因型小麥間的千粒重?zé)o顯著差異。說(shuō)明本發(fā)明中 的CAPS-7A能夠在選育小麥具有優(yōu)異產(chǎn)量性狀中起作用。本發(fā)明為小麥分子標(biāo)記輔助選擇 育種提供了一個(gè)新的方法,在培養(yǎng)高產(chǎn)量小麥品種或研究中具有重要意義。
【具體實(shí)施方式】
[0060] 下面結(jié)合【具體實(shí)施方式】對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)描述,給出的實(shí)施例僅為了闡 明本發(fā)明,而不是為了限制本發(fā)明的范圍。
[0061 ]下述實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。
[0062]下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等,如無(wú)特殊說(shuō)明,均可從商業(yè)途徑得到。
[0063] 下述實(shí)施例中的5 XPCR buffer和化ansfas化化巧U)均為北京全式金生物技術(shù)有 限公司產(chǎn)品,產(chǎn)品目錄號(hào)為AP221 -02; dNTPs為Roche公司產(chǎn)品,產(chǎn)品貨號(hào)為#316K5S。
[0064] 下述實(shí)施例中的化〇1為化men化S公司產(chǎn)品,產(chǎn)品目錄號(hào)為邸0575。
[0065] 實(shí)施例1、CAPS-7A與小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀相關(guān)
[0066] -、CAPS-7A 的發(fā)現(xiàn)
[0067] 本發(fā)明的發(fā)明人根據(jù)表1中32份普通六倍體小麥品種(來(lái)自于國(guó)家種質(zhì)資源庫(kù),公 眾可從國(guó)家種質(zhì)資源庫(kù)獲得)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)與小麥產(chǎn)量相關(guān)的小麥分子標(biāo)記,將其命名為 CAPS-7A,該CAPS-7A為W小麥基因組DNA為模板、利用引物對(duì)P進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物, 在不同的小麥品種中共有S種序列,序列1、序列2和序列3。引物對(duì)P由名稱為Pl和p2的單鏈 0麻組成,91為序列4(5'-461'機(jī)414〔(:此4〔4〇:〇:41'(:-3')所示的單鏈0麻,92為序列5(5'-GCATTGAGTAGTGTTTTGTGCTGT-3')所示的單鏈DNA。
[0068] 將PCR產(chǎn)物序列為序列1的小麥命名為AlAl基因型小麥;將PCR產(chǎn)物序列為序列2的 小麥命名為A2A2基因型小麥;將PCR產(chǎn)物序列為序列3的小麥命名為A3A3基因型小麥;將PCR 產(chǎn)物序列為序列1和序列2的小麥命名為A1A2基因型小麥;將PCR產(chǎn)物序列為序列1和序列3 的小麥命名為A1A3基因型小麥;將PCR產(chǎn)物序列為序列2和序列3的小麥命名為A2A3基因型 小麥。
[0069] 其中,序列2與序列3所示的DNA分子中均含有限制性內(nèi)切酶NcoI的識(shí)別序列,用 NcoI對(duì)序列2所示的DNA分子進(jìn)行酶切,可W得到兩條大小分別為215bp與79bp的DNA片段, 用NcoI對(duì)序列3所示的DNA分子進(jìn)行酶切,可W得到兩條大小分別為229bp與78bp的DNA片 段。
[0070] 表1、32份普通六倍體小麥品種 「00711
[0072] 二、CAPS-7A與小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀相關(guān)
[0073] 選取262份六倍體小麥組成自然群體1 (表2),采用步驟一中的CAPS-7A標(biāo)記對(duì)自然 群體1進(jìn)行基因型分型,并對(duì)基因型與每穗小穗數(shù)、單株穗數(shù)和千粒重=個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn) 行關(guān)聯(lián)分析。
[0074] 1、基因型的確定
[0075] 1)提取待測(cè)小麥的基因組DNA,用基因組特異引物(F和R)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到PCR擴(kuò) 增產(chǎn)物A;
[0076] F:5' -TCCAAAACAACCACGGCTAAC-3';
[0077] R:5'-AGGACTCGGCCAAGAATACAAG-3' 〇
[0078] 2似稀釋150倍的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物A為模板,采用步驟一中的引物對(duì)P進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得 至化CR擴(kuò)增產(chǎn)物B;
[0079] PCR擴(kuò)增的體系(1 扣L)為:d地2〇 8.0iiL、5XPCR buffer 3.0化、引物pl(5皿ol/L) 和p2 (扣mo 1 /L)各0.化L、dNTPs (2.扣mo 1 /L) 0.化L、transf as 化化酶(5U) 0.化L、基因組DNA (20ngAiL)2.^L
[0080] PCR 擴(kuò)增條件為:95。[5111111,95。[303,59。[303,72。[303,35次循環(huán);72。(:10111111,4。[ 保存。
[0081] 3)對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物B進(jìn)行測(cè)序,根據(jù)步驟一中基因型分型的方法對(duì)自然群體1中的 各植株進(jìn)行基因型分型,結(jié)果如表2所示。
[0082] 表2、自然群體1各個(gè)小麥單倍型統(tǒng)計(jì)結(jié)果 [
[00861
[0087] 注表示無(wú) PCR產(chǎn)物。
[0088] 4)用限制性內(nèi)切酶NcoI酶切PCR擴(kuò)增產(chǎn)物B進(jìn)行測(cè)序,根據(jù)酶切產(chǎn)物的大小按照步 驟一中的方法對(duì)小麥進(jìn)行基因型分型,結(jié)果與步驟3)中的基因型分型結(jié)果一致。
[0089] 2、基因型與產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析
[0090] 種植期間調(diào)查各個(gè)小麥品種的每穗小穗數(shù)、單株穗數(shù)與千粒重。用化ssel2.1軟件 利用GLM模型對(duì)=種單倍型和相關(guān)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。
[0091] 結(jié)果發(fā)現(xiàn),AlAl與A2A2基因型小麥的每穗小穗數(shù)均極顯著低于A3A3基因型小麥, AlAl與A2A2