技術(shù)特征:
技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及一種α1?AR亞型蛋白的三維晶體結(jié)構(gòu)模型及其建立方法,建立方法包括步驟:以α1?AR亞型蛋白的氨基酸序列為探針,搜索蛋白晶體數(shù)據(jù)庫,通過氨基酸序列比對得到相似度最高的同源模板β2?AR;使用的Prime模塊對α1?AR亞型蛋白同源模建;采用Macromodel模塊對同源模建得到的蛋白優(yōu)化,通過模型評價得到α1?AR亞型蛋白的三維晶體結(jié)構(gòu)模型。本發(fā)明提供了α1?AR三個亞型蛋白α1A?AR、α1B?AR和α1D?AR的模型構(gòu)象,為準確研究靶點和拮抗劑的構(gòu)效關(guān)系提供了基礎(chǔ);并模建了可能的結(jié)合口袋,找到關(guān)鍵殘基,為解釋α1?AR亞型選擇性拮抗劑的選擇度提供理論依據(jù)。
技術(shù)研發(fā)人員:鄒長林;許芳;孫憲強;章慧;陳文豪;陳星星;李慧芳
受保護的技術(shù)使用者:鄒長林
技術(shù)研發(fā)日:2017.02.23
技術(shù)公布日:2017.07.18