本申請根據35U.S.C.§119(e)要求2014年8月8日提交的美國臨時專利申請U.S.S.N.62/034,949的優(yōu)先權,將其并入本文作為參考。
政府支持
本發(fā)明是在政府支持下進行的,授權號為CA156732和U01HD07650803,它們均由國家健康研究所授予。政府對本發(fā)明享有一定權利。
發(fā)明背景
含溴結構域蛋白(含溴結構域蛋白)具有重要的生物學意義,其為轉錄因子復合物的成分和表觀遺傳記憶的決定子。例如,溴和額外末端(BET)蛋白家族(例如,含溴結構域蛋白2(BRD2)、含溴結構域蛋白3(BRD3)、含溴結構域蛋白4(BRD4)和溴結構域睪丸特異性蛋白(BRDT))共享共同區(qū)域結構,其特征在于呈現高水平序列保守性的兩個氨基末端溴結構域和一個更發(fā)散的羧基末端募集結構域(Filippakopoulos等人,Nature 2010,468,1067-1073)。據報道,BRD2和BRD3沿積極轉錄的基因與組蛋白結合并可參與促進轉錄延伸(transcriptional elongation)(Leroy等人,Mol。Cell。2008,30,51-60)。還報道,BRD4或BRD3可在高度惡性型上皮腫瘤形成中與睪丸核蛋白(NUT)融合,形成新的融合癌基因BRD4-NUT或BRD3-NUT(French等人,Cancer Res.,2003,63,304-307;French等人,J.Clin.Oncol.2004,22,4135-4139)。數據顯示,BRD-NUT融合蛋白促使癌變(French等人,Oncogene 2008,27,2237-2242)。BRDT在睪丸和卵巢中特異性表達。已報道,所有的BET家族成員在細胞周期的控制或執(zhí)行方面具有一定的作用,并已被證明在細胞分裂過程中保持與染色體復合,顯示了其在維持表觀遺傳記憶中的作用。此外,一些病毒利用BET蛋白將它們的基因組束縛于宿主細胞染色質,作為病毒復制過程的一部分(You等人,Cell 2004,117,349-360)。BRD4看起來參與募集pTEF-b復合物到誘導基因,導致RNA聚合酶的磷酸化和增加的轉錄輸出(Hargreaves等人,Cell 2009,138,129-145)。在人中,BRD2、BRD3、BRD4和BRDT表現出相似的基因排列、區(qū)域結構和一些功能性質(Wu等人,J.Biol.Chem.2007,282,13141-13145)。
發(fā)明概述
本發(fā)明提供了二氮雜環(huán)庚烷衍生物,例如式(I)化合物。本發(fā)明化合物是轉錄因子(例如含溴結構域蛋白(例如,BET蛋白))的結合劑并可用于男性避孕和治療和/或預防寬范圍疾病(例如,與溴結構域有關的疾病、與溴結構域的活性(例如,異常活性)有關的疾病、與含溴結構域蛋白有關的疾病和與含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚?有關的疾病)??梢酝ㄟ^本發(fā)明方法治療和/或預防的疾病包括,但不限于,增殖性疾病(例如,癌癥、良性腫瘤、病理性血管發(fā)生、炎性疾病和自身免疫性疾病)、心血管疾病、病毒感染、纖維化疾病、神經性疾病、代謝疾病、內分泌疾病和輻射中毒。本發(fā)明還提供了包括或使用本發(fā)明化合物的藥物組合物、試劑盒、方法和用途。
在一個方面,本發(fā)明提供了式(I)化合物:
及其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物和前藥。
本發(fā)明化合物可結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物結合溴結構域(例如,含溴結構域蛋白的溴結構域)。本發(fā)明化合物可抑制含溴結構域蛋白的活性。本發(fā)明化合物還可抑制溴結構域的功能(例如,功能障礙)。
在另一方面,本發(fā)明提供了藥物組合物,其包含本發(fā)明化合物和任選地藥學上可接受的賦形劑。在一些實施方案中,本文所述藥物組合物包含治療或預防有效量的本發(fā)明化合物。所述藥物組合物可用于在有此需要的受試者中治療和/或預防疾病。所述藥物組合物還可用于在受試者或細胞中抑制病毒的復制、殺死病毒、抑制含溴結構域蛋白的活性、抑制溴結構域的活性、抑制含溴結構域蛋白的溴結構域結合組蛋白或其他蛋白的乙?;馁嚢彼釟埢?、調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸、調節(jié)(例如,下調或抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)、誘導細胞凋亡,和/或誘導G1阻滯。
在一些實施方案中,本文所述疾病與含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚?,升高的活性)有關。在一些實施方案中,所述疾病與含溴結構域蛋白的功能(例如,功能障礙)有關。在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域的活性(例如,異常活性,升高的活性)有關。在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域的功能(例如,功能障礙)有關。
在一些實施方案中,所述疾病為增殖性疾病(例如,癌癥、良性腫瘤、病理性血管發(fā)生、炎性疾病或自身免疫性疾病)、心血管疾病、病毒感染、纖維化疾病、神經性疾病、代謝疾病、內分泌疾病或輻射中毒。
在一些實施方案中,所述受試者為哺乳動物。在一些實施方案中,所述受試者為人。在一些實施方案中,所述受試者為非人動物。在一些實施方案中,所述細胞存在于體外。在一些實施方案中,所述細胞存在于體內。
本發(fā)明的其他方面涉及一種在有此需要的受試者中治療疾病的方法。
在另一方面,本發(fā)明提供了一種在有此需要的受試者中預防疾病的方法。
本發(fā)明的其他方面涉及一種在有此需要的受試者中降低出現疾病的風險的方法。
本發(fā)明的其他方面涉及一種抑制病毒(例如,人類免疫缺陷病毒(HIV)、人乳頭狀瘤病毒(HPV)、丙型肝炎病毒(HCV)、單純皰疹病毒(HSV)、埃波拉病毒和流感病毒)復制的方法。
本發(fā)明的其他方面涉及一種殺死病毒(例如,人類免疫缺陷病毒(HIV)、人乳頭狀瘤病毒(HPV)、丙型肝炎病毒(HCV)、單純皰疹病毒(HSV)、埃波拉病毒和流感病毒)的方法。
在另一方面,本發(fā)明提供了一種在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白的活性的方法。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白的活性為含溴結構域蛋白的異?;虿幌M幕钚?例如,升高的活性)。在一些實施方案中,含溴結構域蛋白的活性被所述方法選擇性地抑制(例如,當與不同于含溴結構域蛋白的激酶的活性相比時)。
在其他方面,本發(fā)明提供了一種在受試者或細胞中抑制溴結構域的活性的方法。在一些實施方案中,所述被抑制的溴結構域的活性為所述溴結構域的異?;虿幌M幕钚?例如,升高的活性)。
在其他方面,本發(fā)明提供了一種在受試者或細胞中抑制溴結構域結合第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基化的賴氨酸殘基的方法。在一些實施方案中,所述第二蛋白為包含至少一個乙?;馁嚢彼釟埢牡鞍?。
在另一方面,本發(fā)明提供了一種在受試者或細胞中調節(jié)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的方法。在一些實施方案中,調節(jié)基因表達(例如,轉錄)的方法為下調或抑制所述基因的表達(例如,轉錄)的方法。所述方法可以導致細胞中基因產物(例如,RNA、蛋白)的水平降低。
在另一方面,本發(fā)明提供了一種在受試者或細胞中調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及一種在受試者中誘導細胞凋亡(例如,癌細胞的細胞凋亡)的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及一種誘導細胞(例如,體外細胞,癌細胞)凋亡的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及一種在受試者或細胞中誘導G1阻滯的方法。
本發(fā)明的方法包括向所述受試者給藥有效量的本發(fā)明化合物或藥物組合物。本發(fā)明的方法包括將細胞與有效量的本發(fā)明化合物或藥物組合物接觸。本發(fā)明的方法包括將病毒與有效量的本發(fā)明化合物或藥物組合物接觸。在一些實施方案中,所述有效量是治療有效量。在一些實施方案中,所述有效量是預防有效量。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法還包括向所述受試者給藥與本發(fā)明化合物或藥物組合物組合的其他藥劑。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法還包括將細胞接觸與本發(fā)明化合物或藥物組合物組合的其他藥劑。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法還包括將病毒接觸與本發(fā)明化合物或藥物組合物組合的其他藥劑。在一些實施方案中,所述藥劑和本發(fā)明化合物或藥物組合物的組合是協同的。
本發(fā)明的其他方面涉及篩選化合物庫的方法以鑒定可用于本發(fā)明方法的化合物。
本發(fā)明的其他方面涉及試劑盒,其包括含有本發(fā)明化合物或藥物組合物的容器。本發(fā)明的試劑盒可以包括單劑量或多劑量的本發(fā)明化合物或藥物組合物。所提供的試劑盒可以用于本發(fā)明的方法。在一些實施方案中,所述試劑盒還包括使用所述試劑盒的說明書。
在其他方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明化合物和藥物組合物,用于本發(fā)明的方法。
本申請涉及各種授權專利、公布的專利申請、期刊文章和其他出版物,其全部引入本文作為參考。本發(fā)明的一個或多個實施方案的細節(jié)在本文中闡述。本發(fā)明的其他特征、目的和優(yōu)勢將通過發(fā)明詳述、實施例和權利要求變得明顯。
定義
具體官能團和化學術語的定義在下文中進行更詳細地描述。所述化學元素根據元素周期表,CAS版,Handbook of Chemistry and Physics,第75版,內封面確定,且具體官能團通常按本文所述進行定義。此外,有機化學的一般原理以及具體官能部分和反應性描述于Thomas Sorrell,Organic Chemistry,University Science Books,Sausalito,1999;Smith和March,March’s Advanced Organic Chemistry,第5版,John Wiley&Sons,Inc.,New York,2001;Larock,Comprehensive Organic Transformations,VCH Publishers,Inc.,New York,1989;和Carruthers,Some Modern Methods of Organic Synthesis,第3版,Cambridge University Press,Cambridge,1987。
本文所述化合物可包含一個或多個不對稱中心,并因此可以各種異構體形式存在,例如,對映異構體和/或非對映異構體。例如,本文所述化合物可為單一對映異構體、非對映異構體或幾何異構體的形式,或可為立體異構體的混合物的形式,包括外消旋混合物和富集一種或多種立體異構體的混合物。異構體可通過本領域技術人員已知的方法(包括手性高壓液相色譜(HPLC)和形成并結晶手性鹽)從混合物中分離;或優(yōu)選的異構體可通過不對稱合成制備。參見,例如,Jacques等人,Enantiomers,Racemates and Resolutions(Wiley Interscience,New York,1981);Wilen等人,Tetrahedron 33:2725(1977);Eliel,Stereochemistry of Carbon Compounds(McGraw-Hill,NY,1962);和Wilen,Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions第268頁(E.L.Eliel,編輯,Univ.of Notre Dame Press,Notre Dame,IN 1972)。本發(fā)明還包括作為基本上不含其他異構體的單一異構體的本發(fā)明化合物,且或者,作為各種異構體的混合物的本發(fā)明化合物。
在式中,是單鍵,其中直接連接的部分的立體化學并沒有指定。這種鍵可為或
當列出數值范圍時,旨在涵蓋該范圍內的各數值和子范圍。例如“C1-6”旨在涵蓋C1、C2、C3、C4、C5、C6、C1-6、C1-5、C1-4、C1-3、C1-2、C2-6、C2-5、C2-4、C2-3、C3-6、C3-5、C3-4、C4-6、C4-5和C5-6。
術語“脂肪族”包括飽和和不飽和,直鏈(即,非支鏈)、支鏈、非環(huán)狀、環(huán)狀或多環(huán)脂肪烴,其可任選地被一個或多個官能團取代。如本領域技術人員將理解地,“脂肪族”在本文中旨在包括,但不限于,烷基、烯基、炔基、環(huán)烷基、環(huán)烯基和環(huán)炔基部分。因此,術語“烷基”包括直鏈、支鏈和環(huán)狀烷基。類似的規(guī)則適用于其他通用術語,例如“烯基”、“炔基”等。此外,術語“烷基”、“烯基”、“炔基”等涵蓋取代和未取代基團。在一些實施方案中,“低級烷基”用于表示具有1-6個碳原子的那些烷基(環(huán)狀、非環(huán)狀、取代、未取代、支鏈或非支鏈)。
在一些實施方案中,本發(fā)明中所使用的烷基、烯基和炔基包含1-20個脂肪族碳原子。在一些其他實施方案中,本發(fā)明中所使用的烷基、烯基和炔基包含1-10個脂肪族碳原子。還在其他實施方案中,本發(fā)明所使用的烷基、烯基和炔基包含1-8個脂肪族碳原子。還在其他實施方案中,本發(fā)明所使用的烷基、烯基和炔基包含1-6個脂肪族碳原子。還在其他實施方案中,本發(fā)明所使用的烷基、烯基和炔基包含1-4個碳原子。因此,示例性的脂肪族基團包括,但不限于,例如,甲基、乙基、正丙基、異丙基、環(huán)丙基、-CH2-環(huán)丙基、乙烯基、烯丙基、正丁基、仲丁基、異丁基、叔丁基、環(huán)丁基、-CH2-環(huán)丁基、正戊基、仲戊基、異戊基、叔戊基、環(huán)戊基、-CH2-環(huán)戊基、正己基、仲己基、環(huán)己基、-CH2-環(huán)己基部分等,其同樣地可帶有一個或多個取代基。烯基包括,但不限于,例如,乙烯基、丙烯基、丁烯基、1-甲基-2-丁烯-1-基等。代表性的炔基包括,但不限于,乙炔基、2-丙炔基(炔丙基)、1-丙炔基等。
“烷基”是指具有1至20個碳原子的直鏈或支鏈的飽和烴基團(“C1-20烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至10個碳原子(“C1-10烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至9個碳原子(“C1-9烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至8個碳原子(“C1-8烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至7個碳原子(“C1-7烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至6個碳原子(“C1-6烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至5個碳原子(“C1-5烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至4個碳原子(“C1-4烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至3個碳原子(“C1-3烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1至2個碳原子(“C1-2烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有1個碳原子(“C1烷基”)。在一些實施方案中,烷基基團具有2至6個碳原子(“C2-6烷基”)。C1-6烷基基團的實例包括甲基(C1)、乙基(C2)、丙基(C3)(例如,正丙基、異丙基)、丁基(C4)(例如,正丁基、叔丁基、仲丁基、異丁基)、戊基(C5)(例如,正戊基、戊-3-基、戊基、新戊基、3-甲基-丁-2-基、叔戊基)和己基(C6)(例如,正己基)。烷基基團的其他實例包括正庚基(C7)、正辛基(C8)等。除非另外指出,否則烷基基團在每種情況下獨立地未取代(“未取代的烷基”)或被一個或多個取代基(例如,鹵素,例如F)取代(“取代的烷基”)。在一些實施方案中,所述烷基基團為未取代的C1-10烷基(例如未取代的C1-6烷基,例如,-CH3(Me)、未取代的乙基(Et)、未取代的丙基(Pr,例如,未取代的正丙基(n-Pr)、未取代的異丙基(i-Pr))、未取代的丁基(Bu,例如,未取代的正丁基(n-Bu)、未取代的叔丁基(tert-Bu或t-Bu)、未取代的仲丁基(sec-Bu)、未取代的異丁基(i-Bu))。在一些實施方案中,所述烷基基團為取代的C1-10烷基(例如取代的C1-6烷基,例如,-CF3、Bn)。
“烯基”是指具有2-20個碳原子、一或多個碳-碳雙鍵且無叁鍵的直鏈或支鏈烴基的基團(“C2-20烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-10個碳原子(“C2-10烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-9個碳原子(“C2-9烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-8個碳原子(“C2-8烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-7個碳原子(“C2-7烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-6個碳原子(“C2-6烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-5個碳原子(“C2-5烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-4個碳原子(“C2-4烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2-3個碳原子(“C2-3烯基”)。在一些實施方案中,烯基具有2個碳原子(“C2烯基”)。所述一個或多個碳-碳雙鍵可為內部的(例如在2-丁烯基中)或末端的(例如在1-丁烯基中)。C2-4烯基的實例包括乙烯基(C2)、1-丙烯基(C3)、2-丙烯基(C3)、1-丁烯基(C4)、2-丁烯基(C4)、丁二烯基(C4)等。C2-6烯基的實例包括上述C2-4烯基,以及戊烯基(C5)、戊二烯基(C5)、己烯基(C6)等。烯基的額外的實例包括庚烯基(C7)、辛烯基(C8)、辛三烯基(C8)等。除非另外規(guī)定,烯基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代烯基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的烯基”)。在一些實施方案中,所述烯基是未取代的C2-10烯基。在一些實施方案中,所述烯基是取代的C2-10烯基。在烯基基團中,立體化學未指定的C=C雙鍵(例如,-CH=CHCH3或)可以為(E)-或(Z)-雙鍵。
“炔基”是指具有2-20個碳原子、一個或多個碳-碳叁鍵和任選地一個或多個雙鍵的直鏈或支鏈烴基的基團(“C2-20炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-10個碳原子(“C2-10炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-9個碳原子(“C2-9炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-8個碳原子(“C2-8炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-7個碳原子(“C2-7炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-6個碳原子(“C2-6炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-5個碳原子(“C2-5炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-4個碳原子(“C2-4炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2-3個碳原子(“C2-3炔基”)。在一些實施方案中,炔基具有2個碳原子(“C2炔基”)。所述一個或多個碳-碳叁鍵可為內部的(例如在2-丁炔基中)或末端的(例如在1-丁炔基中)。C2-4炔基的實例包括,但不限于,乙炔基(C2)、1-丙炔基(C3)、2-丙炔基(C3)、1-丁炔基(C4)、2-丁炔基(C4)等。C2-6烯基的實例包括上述C2-4炔基以及戊炔基(C5)、己炔基(C6)等。炔基的其他實例包括庚炔基(C7)、辛炔基(C8)等。除非另外規(guī)定,炔基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代的炔基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的炔基”)。在一些實施方案中,所述炔基是未取代的C2-10炔基。在一些實施方案中,所述炔基是取代的C2-10炔基。
“碳環(huán)基”或“碳環(huán)的”是指具有3-10個環(huán)碳原子的非芳香環(huán)烴基的基團(“C3-10碳環(huán)基”)且在該非芳香環(huán)系統中沒有雜原子。在一些實施方案中,碳環(huán)基具有3-8個環(huán)碳原子(“C3-8碳環(huán)基”)。在一些實施方案中,碳環(huán)基具有3-6個環(huán)碳原子(“C3-6碳環(huán)基”)。在一些實施方案中,碳環(huán)基具有3-6個環(huán)碳原子(“C3-6碳環(huán)基”)。在一些實施方案中,碳環(huán)基具有5-10個環(huán)碳原子(“C5-10碳環(huán)基”)。示例性的C3-6碳環(huán)基包括,但不限于,環(huán)丙基(C3)、環(huán)丙烯基(C3)、環(huán)丁基(C4)、環(huán)丁烯基(C4)、環(huán)戊基(C5)、環(huán)戊烯基(C5)、環(huán)己基(C6)、環(huán)己烯基(C6)、環(huán)己二烯基(C6)等。示例性的C3-8碳環(huán)基包括,但不限于,上述C3-6碳環(huán)基以及環(huán)庚基(C7)、環(huán)庚烯基(C7)、環(huán)庚二烯基(C7)、環(huán)庚三烯基(C7)、環(huán)辛基(C8)、環(huán)辛烯基(C8)、二環(huán)[2.2.1]庚基(C7)、二環(huán)[2.2.2]辛基(C8)等。示例性的C3-10碳環(huán)基包括,但不限于,上述C3-8碳環(huán)基以及環(huán)壬基(C9)、環(huán)壬烯基(C9)、環(huán)癸基(C10)、環(huán)癸烯基(C10)、八氫-1H-茚基(C9)、十氫萘基(C10)、螺[4.5]癸基(C10)等。如上述實例所說明,在一些實施方案中,所述碳環(huán)基是單環(huán)的(“單環(huán)碳環(huán)基”)或含有稠合、橋接或螺環(huán)系統,例如二環(huán)系統(“二環(huán)碳環(huán)基”)且可為飽和或部分不飽和的?!疤辑h(huán)基”還可包括環(huán)系統,其中如上文定義的所述碳環(huán)與一個或多個芳基或雜芳基稠合,其中所述連接點在該碳環(huán)上,且在這種情況下,碳數仍指的是在該碳環(huán)環(huán)系統中的碳的個數。除非另外規(guī)定,碳環(huán)基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代碳環(huán)基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的碳環(huán)基”)。在一些實施方案中,所述碳環(huán)基是未取代的C3-10碳環(huán)基。在一些實施方案中,所述碳環(huán)基是取代的C3-10碳環(huán)基。
在一些實施方案中,“碳環(huán)基”是具有3-10個環(huán)碳原子的單環(huán),飽和碳環(huán)基(“C3-10環(huán)烷基”)。在一些實施方案中,環(huán)烷基具有3-8個環(huán)碳原子(“C3-8環(huán)烷基”)。在一些實施方案中,環(huán)烷基具有3-6個環(huán)碳原子(“C3-6環(huán)烷基”)。在一些實施方案中,環(huán)烷基具有5-6個環(huán)碳原子(“C5-6環(huán)烷基”)。在一些實施方案中,環(huán)烷基具有5-10個環(huán)碳原子(“C5-10環(huán)烷基”)。C5-6環(huán)烷基的實例包括環(huán)戊基(C5)和環(huán)己基(C6)。C3-6環(huán)烷基的實例包括上述C5-6環(huán)烷基以及環(huán)丙基(C3)和環(huán)丁基(C4)。C3-8環(huán)烷基的實例包括上述C3-6環(huán)烷基以及環(huán)庚基(C7)和環(huán)辛基(C8)。除非另外規(guī)定,環(huán)烷基在每種情況下獨立地為未取代(“未取代的環(huán)烷基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的環(huán)烷基”)。在一些實施方案中,所述環(huán)烷基是未取代的C3-10環(huán)烷基。在一些實施方案中,所述環(huán)烷基是取代的C3-10環(huán)烷基。
“雜環(huán)基”或“雜環(huán)的”是指具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子的3-至10-元非芳香環(huán)系統的基團,其中各雜原子獨立地選自氮、氧、硫、硼、磷和硅(“3-10元雜環(huán)基”)。在包含一個或多個氮原子的雜環(huán)基中,所述連接點可為碳或氮原子,只要化合價允許。雜環(huán)基可為單環(huán)的(“單環(huán)雜環(huán)基”)或稠合、橋接或螺環(huán)系統,例如二環(huán)系統(“二環(huán)雜環(huán)基”),且可為飽和的或可為部分不飽和的。雜環(huán)基二環(huán)環(huán)系統可在一個或者兩個環(huán)中包含一個或多個雜原子。“雜環(huán)基”還包括環(huán)系統,其中如上文所定義的雜環(huán)與一個或多個碳環(huán)基稠合,其中所述連接點在該碳環(huán)或雜環(huán)上,或包括環(huán)系統,其中如上文所定義的雜環(huán)與一個或多個芳基或雜芳基基團稠合,其中所述連接點在該雜環(huán)上,且在這種情況下,環(huán)原子數仍指的是在該雜環(huán)系統中的環(huán)原子個數。除非另外規(guī)定,雜環(huán)基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代雜環(huán)基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的雜環(huán)基”)。在一些實施方案中,所述雜環(huán)基是未取代的3-10元雜環(huán)基。在一些實施方案中,所述雜環(huán)基是取代的3-10元雜環(huán)基。
在一些實施方案中,雜環(huán)基是具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子的5-10元非芳香環(huán)系統,其中各雜原子獨立地選自氮、氧、硫、硼、磷和硅(“5-10元雜環(huán)基”)。在一些實施方案中,雜環(huán)基是具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子的5-8元非芳香環(huán)系統,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-8元雜環(huán)基”)。在一些實施方案中,雜環(huán)基是具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子的5-6元非芳香環(huán)系統,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-6元雜環(huán)基”)。在一些實施方案中,所述5-6元雜環(huán)基具有1-3個環(huán)雜原子,其選自氮、氧和硫。在一些實施方案中,所述5-6元雜環(huán)基具有1-2個環(huán)雜原子,其選自氮、氧和硫。在一些實施方案中,所述5-6元雜環(huán)基具有一個環(huán)雜原子,其選自氮、氧和硫。
含有一個雜原子的示例性的3元雜環(huán)基包括,但不限于,氮雜環(huán)丙烷基、氧雜環(huán)丙烷基、硫雜環(huán)丙烷基。含有一個雜原子的示例性的4元雜環(huán)基包括,但不限于,氮雜環(huán)丁烷基、氧雜環(huán)丁烷基和硫雜環(huán)丁烷基。含有一個雜原子的示例性的5元雜環(huán)基包括,但不限于,四氫呋喃基、二氫呋喃基、四氫噻吩基、二氫噻吩基、吡咯烷基、二氫吡咯基和吡咯基-2,5-二酮。含有兩個雜原子的示例性的5元雜環(huán)基包括,但不限于,二氧雜環(huán)戊烷基、氧硫雜環(huán)戊烷基(oxasulfuranyl)、二硫雜環(huán)戊烷基(disulfuranyl)和噁唑烷-2-酮。含有三個雜原子的示例性的5元雜環(huán)基包括,但不限于,三唑啉基、噁二唑啉基和噻二唑啉基。含有一個雜原子的示例性的6元雜環(huán)基包括,但不限于,哌啶基、四氫吡喃基、二氫吡啶基和硫雜環(huán)己基(thianyl)。含有兩個雜原子的示例性的6元雜環(huán)基包括,但不限于,哌嗪基、嗎啉基、二硫雜環(huán)己基(dithianyl)和二氧雜環(huán)己基(dioxanyl)。含有三個雜原子的示例性的6元雜環(huán)基包括,但不限于,三嗪烷基(triazinanyl)。含有一個雜原子的示例性的7元雜環(huán)基包括,但不限于,氮雜環(huán)庚烷基(azepanyl)、氧雜環(huán)庚烷基(oxepanyl)和硫雜環(huán)庚烷基(thiepanyl)。含有一個雜原子的示例性的8元雜環(huán)基包括,但不限于,氮雜環(huán)辛烷基(azocanyl)、氧雜環(huán)辛烷基(oxecanyl)和硫雜環(huán)辛烷基(thiocanyl)。與C6芳基環(huán)稠合的示例性的5元雜環(huán)基(在本文也稱為5,6-二環(huán)雜環(huán))包括,但不限于,二氫吲哚基、異二氫吲哚基、二氫苯并呋喃基、二氫苯并噻吩基、苯并噁唑啉酮基(benzoxazolinonyl)等。與芳基環(huán)稠合的示例性的6元雜環(huán)基(在本文中也稱為6,6-二環(huán)雜環(huán))包括,但不限于,四氫喹啉基、四氫異喹啉基等。
“芳基”是指單環(huán)或多環(huán)(例如,二環(huán)或三環(huán))4n+2芳香環(huán)系統(例如,具有6、10或14個在環(huán)陣列中共享的π電子)的基團,其在該芳香環(huán)系統中具有6-14個環(huán)碳原子且無雜原子(“C6-14芳基”)。在一些實施方案中,芳基具有6個環(huán)碳原子(“C6芳基”;例如,苯基)。在一些實施方案中,芳基具有10個環(huán)碳原子(“C10芳基”;例如,萘基,例如1-萘基和2-萘基)。在一些實施方案中,芳基具有14個環(huán)碳原子(“C14芳基”;例如,蒽基)。“芳基”還包括環(huán)系統,其中如上所定義的芳基環(huán)與一個或多個碳環(huán)基或雜環(huán)基稠合,其中所述基團或連接點在該芳基環(huán)上,且在這種情況下,碳原子數仍指的是在該芳基環(huán)系統中的碳原子的個數。除非另外規(guī)定,芳基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代的芳基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的芳基”)。在一些實施方案中,所述芳基是未取代的C6-14芳基。在一些實施方案中,所述芳基是取代的C6-14芳基。
“芳烷基”是烷基和芳基的子集且是指被任選取代的芳基取代的任選取代的烷基。在一些實施方案中,所述芳烷基是任選取代的芐基。在一些實施方案中,所述芳烷基是芐基。在一些實施方案中,所述芳烷基是任選取代的苯乙基。在一些實施方案中,所述芳烷基是苯乙基。
“雜芳基”是指5-10元單環(huán)或二環(huán)4n+2芳香環(huán)系統的基團(例如,具有6或10個在環(huán)陣列中共享的π電子),其在該芳香環(huán)系統中具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-10元雜芳基”)。在含有一個或多個氮原子的雜芳基中,所述連接點可為碳或氮原子,只要化合價允許。雜芳基二環(huán)環(huán)系統可在一個,或兩個環(huán)中包含一個或多個雜原子?!半s芳基”包括環(huán)系統,其中如上文所定義的雜芳基環(huán)與一個或多個碳環(huán)基或雜環(huán)基稠合,其中所述連接點在該雜芳基環(huán)上,且在這種情況下,環(huán)原子數仍指的是在該雜芳基環(huán)系統中的環(huán)原子的個數?!半s芳基”還包括環(huán)系統,其中如上文所定義的雜芳基環(huán)與一個或多個芳基稠合,其中所述連接點在該芳基或雜芳基環(huán)上,且在這種情況下,環(huán)原子數指的是在該稠合的(芳基/雜芳基)環(huán)系統中的環(huán)原子數。在其中一個環(huán)不包含雜原子的二環(huán)雜芳基中(例如,吲哚基、喹啉基、咔唑基等),所述連接點可在任一環(huán)上,即,在含雜原子的環(huán)上(例如,2-吲哚基)或在不含雜原子的環(huán)上(例如,5-吲哚基)。
在一些實施方案中,雜芳基是5-10元芳香環(huán)系統,其在該芳香環(huán)系統中具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-10元雜芳基”)。在一些實施方案中,雜芳基是5-8元芳香環(huán)系統,其在該芳香環(huán)系統中具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-8元雜芳基”)。在一些實施方案中,雜芳基是5-6元芳香環(huán)系統,其在該芳香環(huán)系統中具有環(huán)碳原子和1-4個環(huán)雜原子,其中各雜原子獨立地選自氮、氧和硫(“5-6元雜芳基”)。在一些實施方案中,所述5-6元雜芳基具有選自氮、氧和硫的1-3個環(huán)雜原子。在一些實施方案中,所述5-6元雜芳基具有選自氮、氧和硫的1-2個環(huán)雜原子。在一些實施方案中,所述5-6元雜芳基具有選自氮、氧和硫的1個環(huán)雜原子。除非另外規(guī)定,雜芳基在每種情況下任選獨立地被取代,即,未取代(“未取代的雜芳基”)或被一個或多個取代基取代(“取代的雜芳基”)。在一些實施方案中,所述雜芳基是未取代的5-14元雜芳基。在一些實施方案中,所述雜芳基是取代的5-14元雜芳基。
含有一個雜原子的示例性的5元雜芳基包括,但不限于,吡咯基、呋喃基和噻吩基。含有兩個雜原子的示例性的5元雜芳基包括,但不限于,咪唑基、吡唑基、噁唑基、異噁唑基、噻唑基和異噻唑基。含有三個雜原子的示例性的5元雜芳基包括,但不限于,三唑基、噁二唑基和噻二唑基。含有四個雜原子的示例性的5元雜芳基包括,但不限于,四唑基。含有一個雜原子的示例性的6元雜芳基包括,但不限于,吡啶基。含有兩個雜原子的示例性的6元雜芳基包括,但不限于,噠嗪基、嘧啶基和吡嗪基。含有三個或四個雜原子的示例性的6元雜芳基分別包括,但不限于,三嗪基和四嗪基。含有一個雜原子的示例性的7元雜芳基包括,但不限于,氮雜環(huán)庚三烯基(azepinyl)、氧雜環(huán)庚三烯基(oxepinyl)和硫雜環(huán)庚三烯基(thiepinyl)。示例性的5,6-二環(huán)雜芳基包括,但不限于,吲哚基、異吲哚基、吲唑基、苯并三唑基、苯并噻吩基、異苯并噻吩基、苯并呋喃基、苯并異呋喃基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、苯并異噁唑基、苯并噁二唑基、苯并噻唑基、苯并異噻唑基、苯并噻二唑基、吲嗪基和嘌呤基。示例性的6,6-二環(huán)雜芳基包括,但不限于,二氮雜萘基、蝶啶基、喹啉基、異喹啉基、噌啉基(cinnolinyl)、喹喔啉基、酞嗪基和喹唑啉基。
“雜芳烷基”是烷基和雜芳基的子集且是指被任選取代的雜芳基取代的任選取代的烷基。
“不飽和”或“部分不飽和”是指包含至少一個雙鍵或叁鍵的基團。“部分不飽和”環(huán)系統進一步旨在涵蓋具有多個不飽和位點的環(huán),但不旨在包括芳香基團(例如,芳基或雜芳基)。同樣地,“飽和”是指不含有雙鍵或叁鍵的基團,即,只含單鍵。
烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基,作為二價橋接基團,使用前綴亞時,進一步表示,例如,亞烷基、亞烯基、亞炔基、亞碳環(huán)基、亞雜環(huán)基、亞芳基和亞雜芳基。
除非另外明確規(guī)定,否則本文所述的原子、部分或基團可為未取代的或取代的,只要化合價允許。術語“任選取代的”是指取代的或未取代的。
除非另有說明,基團任選被取代。術語“任選取代的”是指被取代的或未取代的。在一些實施方案中,烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基任選被取代(例如,“取代”或“未取代的”的烷基、“取代”或“未取代的”的烯基、“取代”或“未取代的”的炔基、“取代”或“未取代的”的碳環(huán)基、“取代”或“未取代的”的雜環(huán)基、“取代”或“未取代的”的芳基或“取代”或“未取代的”的雜芳基)。通常,術語“取代的”,無論前面是否有術語“任選地”,表示存在于基團(例如,碳或氮原子)上的至少一個氫原子被可允許的取代基(例如,經取代形成穩(wěn)定化合物的取代基,所述化合物,例如不會自發(fā)進行轉化,如重排、環(huán)化、消除或其他反應)取代。除非另外提及,“取代的”基團在該基團的一個或多個可取代位置具有取代基,且當在任意給定結構中有超過一個位置被取代,則該取代基在各位置相同或不同。術語“取代的”旨在包括用有機化合物所有可允許的取代基(導致形成穩(wěn)定化合物的本文所述的任意取代基)進行的取代。本發(fā)明包括任意和全部這種組合以得到穩(wěn)定的化合物。出于本發(fā)明的目的,雜原子(例如氮)可具有氫取代基和/或本文所述的任意適當的取代基,其滿足該雜原子的化合價并形成穩(wěn)定的基團。在一些實施方案中,所述取代基是碳原子取代基。在一些實施方案中,所述取代基是氮原子取代基。在一些實施方案中,所述取代基是氧原子取代基。在一些實施方案中,所述取代基是硫原子取代基。
示例性的碳原子取代基包括,但不限于,鹵素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORaa、-ON(Rbb)2、-N(Rbb)2、-N(Rbb)3+X-、-N(ORcc)Rbb、-SH、-SRaa、-SSRcc、-C(=O)Raa、-CO2H、-CHO、-C(ORcc)2、-CO2Raa、-OC(=O)Raa、-OCO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-OC(=O)N(Rbb)2、-NRbbC(=O)Raa、-NRbbCO2Raa、-NRbbC(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-OC(=NRbb)Raa、-OC(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-OC(=NRbb)N(Rbb)2、-NRbbC(=NRbb)N(Rbb)2、-C(=O)NRbbSO2Raa、-NRbbSO2Raa、-SO2N(Rbb)2、-SO2Raa、-SO2ORaa、-OSO2Raa、-S(=O)Raa、-OS(=O)Raa、-Si(Raa)3、-OSi(Raa)3-C(=S)N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=S)SRaa、-SC(=S)SRaa、-SC(=O)SRaa、-OC(=O)SRaa、-SC(=O)ORaa、-SC(=O)Raa、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-OP(=O)(Raa)2、-OP(=O)(ORcc)2、-P(=O)(N(Rbb)2)2、-OP(=O)(N(Rbb)2)2、-NRbbP(=O)(Raa)2、-NRbbP(=O)(ORcc)2、-NRbbP(=O)(N(Rbb)2)2、-P(Rcc)2、-P(ORcc)2、-P(Rcc)3+X-、-P(ORcc)3+X-、-P(Rcc)4、-P(ORcc)4、-OP(Rcc)2、-OP(Rcc)3+X-、-OP(ORcc)2、-OP(ORcc)3+X-、-OP(Rcc)4、-OP(ORcc)4、-B(Raa)2、-B(ORcc)2、-BRaa(ORcc)、C1-10烷基、C1-10全鹵代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、雜C1-10烷基、雜C2-10烯基、雜C2-10炔基、C3-10碳環(huán)基、3-14元雜環(huán)基、C6-14芳基和5-14元雜芳基,其中各烷基、烯基、炔基、雜烷基、雜烯基、雜炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代;其中X-是平衡離子;或碳原子上的兩個偕位氫被基團=O、=S、=NN(Rbb)2、=NNRbbC(=O)Raa、=NNRbbC(=O)ORaa、=NNRbbS(=O)2Raa、=NRbb或=NORcc取代;
Raa在每種情況下獨立地選自C1-10烷基、C1-10全鹵代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳環(huán)基、3-14元雜環(huán)基、C6-14芳基和5-14元雜芳基,或兩個Raa基團一起形成3-14元雜環(huán)基或5-14元雜芳基環(huán),其中各烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代;
Rbb在每種情況下獨立地選自氫、-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-CN、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)(N(Rcc)2)2、C1-10烷基、C1-10全鹵代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、雜C1-10烷基、雜C2-10烯基、雜C2-10炔基、C3-10碳環(huán)基、3-14元雜環(huán)基、C6-14芳基和5-14元雜芳基或兩個Rbb基團一起形成3-14元雜環(huán)基或5-14元雜芳基環(huán),其中各烷基、烯基、炔基、雜烷基、雜烯基、雜炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代;其中X-為平衡離子;
Rcc在每種情況下獨立地選自氫、C1–10烷基、C1–10全鹵代烷基、C2–10烯基、C2–10炔基、C3–10碳環(huán)基、3–14元雜環(huán)基、C6–14芳基和5–14元雜芳基或兩個Rcc基團一起形成3–14元雜環(huán)基或5–14元雜芳基環(huán),其中各烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代;
Rdd在每種情況下獨立地選自鹵素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORee、-ON(Rff)2、-N(Rff)2、-N(Rff)3+X-、-N(ORee)Rff、-SH、-SRee、-SSRee、-C(=O)Ree、-CO2H、-CO2Ree、-OC(=O)Ree、-OCO2Ree、-C(=O)N(Rff)2、-OC(=O)N(Rff)2、-NRffC(=O)Ree、-NRffCO2Ree、-NRffC(=O)N(Rff)2、-C(=NRff)ORee、-OC(=NRff)Ree、-OC(=NRff)ORee、-C(=NRff)N(Rff)2、-OC(=NRff)N(Rff)2、-NRffC(=NRff)N(Rff)2、-NRffSO2Ree、-SO2N(Rff)2、-SO2Ree、-SO2ORee、-OSO2Ree、-S(=O)Ree、-Si(Ree)3、-OSi(Ree)3、-C(=S)N(Rff)2、-C(=O)SRee、-C(=S)SRee、-SC(=S)SRee、-P(=O)(ORee)2、-P(=O)(Ree)2、-OP(=O)(Ree)2、-OP(=O)(ORee)2、C1-6烷基、C1-6全鹵代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、雜C1-6烷基、雜C2-6烯基、雜C2-6炔基、C3-10碳環(huán)基、3-10元雜環(huán)基、C6-10芳基、5-10元雜芳基,其中各烷基、烯基、炔基、雜烷基、雜烯基、雜炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rgg基團取代或兩個偕位Rdd取代基可一起形成=O或=S;其中X-為平衡離子;
Ree在每種情況下獨立地選自C1–6烷基、C1–6全鹵代烷基、C2–6烯基、C2–6炔基、C3–10碳環(huán)基、C6–10芳基、3–10元雜環(huán)基和3–10元雜芳基,其中各烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rgg基團取代;
Rff在每種情況下獨立地選自氫、C1–6烷基、C1–6全鹵代烷基、C2–6烯基、C2–6炔基、C3–10碳環(huán)基、3–10元雜環(huán)基、C6–10芳基和5–10元雜芳基或兩個Rff基團一起形成3–14元雜環(huán)基或5–14元雜芳基環(huán),其中各烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rgg基團取代;和
Rgg在每種情況下獨立跌為鹵素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-OC1-6烷基、-ON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)3+X-、-NH(C1-6烷基)2+X-、-NH2(C1-6烷基)+X-、-NH3+X-、-N(OC1-6烷基)(C1-6烷基)、-N(OH)(C1-6烷基)、-NH(OH)、-SH、-SC1-6烷基、-SS(C1-6烷基)、-C(=O)(C1-6烷基)、-CO2H、-CO2(C1-6烷基)、-OC(=O)(C1-6烷基)、-OCO2(C1-6烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)N(C1-6烷基)2、-OC(=O)NH(C1-6烷基)、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)C(=O)(C1-6烷基)、-NHCO2(C1-6烷基)、-NHC(=O)N(C1-6烷基)2、-NHC(=O)NH(C1-6烷基)、-NHC(=O)NH2、-C(=NH)O(C1-6烷基)、-OC(=NH)(C1-6烷基)、-OC(=NH)OC1-6烷基、-C(=NH)N(C1-6烷基)2、-C(=NH)NH(C1-6烷基)、-C(=NH)NH2、-OC(=NH)N(C1-6烷基)2、-OC(NH)NH(C1-6烷基)、-OC(NH)NH2、-NHC(NH)N(C1-6烷基)2、-NHC(=NH)NH2、-NHSO2(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2NH2、-SO2C1-6烷基、-SO2OC1-6烷基、-OSO2C1-6烷基、-SOC1-6烷基、-Si(C1-6烷基)3、-OSi(C1-6烷基)3-C(=S)N(C1-6烷基)2、C(=S)NH(C1-6烷基)、C(=S)NH2、-C(=O)S(C1-6烷基)、-C(=S)SC1-6烷基、-SC(=S)SC1-6烷基、-P(=O)(OC1-6烷基)2、-P(=O)(C1-6烷基)2、-OP(=O)(C1-6烷基)2、-OP(=O)(OC1-6烷基)2、C1-6烷基、C1-6全鹵代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、雜C1-6烷基、雜C2-6烯基、雜C2-6炔基、C3-10碳環(huán)基、C6-10芳基、3-10元雜環(huán)基、5-10元雜芳基;或兩個偕位Rgg取代基可一起形成=O或=S;其中X-為平衡離子。
“平衡離子”或“陰離子平衡離子”是與帶正電荷的基團締合的帶負電荷的基團,以保持電中性。陰離子平衡離子可為一價的(即,包括一個形式負電荷)。陰離子平衡離子也可為多價的(即,包括一個以上的形式負電荷),例如二價或三價。示例性的平衡離子包括鹵離子(例如,F–、Cl–、Br–、I–)、NO3–、ClO4–、OH–、H2PO4–、HCO3-、HSO4–、磺酸根離子(例如,甲磺酸根、三氟甲磺酸根、對甲苯磺酸根、苯磺酸根、10-樟腦磺酸根、萘-2-磺酸根、萘-1-磺酸-5-磺酸根、乙烷-1-磺酸-2-磺酸根等)、羧酸根離子(例如,乙酸根、丙酸根、苯甲酸根、甘油酸根、乳酸根、酒石酸根、羥乙酸根、葡糖酸根等)、BF4-、PF4–、PF6–、AsF6–、SbF6–、B[3,5-(CF3)2C6H3]4]–、B(C6F5)4-、BPh4–、Al(OC(CF3)3)4–和卡硼烷陰離子(例如,CB11H12–或(HCB11Me5Br6)–)??蔀槎鄡r的示例性的平衡離子包括CO32-、HPO42-、PO43-、B4O72-、SO42-、S2O32-、羧酸根陰離子(例如,酒石酸根、檸檬酸根、富馬酸根、馬來酸根、蘋果酸根、丙二酸根、葡糖酸根、琥珀酸根、戊二酸根、己二酸根、庚二酸根、辛二酸根、壬二酸根、癸二酸根、水楊酸根、鄰苯二甲酸根、天冬氨酸根、谷氨酸根等)和卡硼烷。
“鹵”或“鹵素”是指氟(fluoro、-F)、氯(chloro、-Cl)、溴(bromo、-Br)或碘(iodo、-I)。
“?;笔侵高x自-C(=O)Raa、-CHO、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-C(=O)NRbbSO2Raa、-C(=S)N(Rbb)2、-C(=O)SRaa或-C(=S)SRaa的基團,其中Raa和Rbb如本文所定義。
氮原子可為取代的或未取代的,只要原子價允許,且包括伯、仲、叔和季氮原子。示例性氮原子取代基包括,但不限于,氫、-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-CN、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、-P(=O)(ORcc)2、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(N(Rcc)2)2、C1-10烷基、C1-10全鹵代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、雜C1-10烷基、雜C2-10烯基、雜C2-10炔基、C3-10碳環(huán)基、3-14元雜環(huán)基、C6-14芳基和5-14元雜芳基或兩個與N原子相連的Rcc基團一起形成3-14元雜環(huán)基或5-14元雜芳基環(huán),其中各烷基、烯基、炔基、雜烷基、雜烯基、雜炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如上文所定義。
在一些實施方案中,氮原子上存在的取代基為氮保護基(也稱為氨基保護基)。氮保護基包括,但不限于,-OH、-ORaa、-N(Rcc)2、-C(=O)Raa、-C(=O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(=NRcc)Raa、-C(=NRcc)ORaa、-C(=NRcc)N(Rcc)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(=S)N(Rcc)2、-C(=O)SRcc、-C(=S)SRcc、C1-10烷基(例如,芳烷基、雜芳烷基)、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳環(huán)基、3-14元雜環(huán)基、C6-14芳基和5-14元雜芳基,其中各烷基、烯基、炔基、碳環(huán)基、雜環(huán)基、芳烷基、芳基和雜芳基獨立地被0、1、2、3、4或5個Rdd基團取代,且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如本文定義。氮保護基是本領域眾所周知的且包括詳細描述于Protecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,第三版,John Wiley&Sons,1999中的那些,其在此引入作為參考。
例如,氮保護基如酰胺基團(例如,-C(=O)Raa),包括,但不限于,甲酰胺、乙酰胺、氯乙酰胺、三氯乙酰胺、三氟乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、2-吡啶酰胺(picolinamide)、吡啶-3-基甲酰胺、N-苯甲?;交滨;苌?、苯甲酰胺、對苯基苯甲酰胺、鄰硝基苯基乙酰胺、鄰硝基苯氧基乙酰胺、乙?;阴0?、(N’-二硫代芐基氧基酰基氨基)乙酰胺、3-(對羥基苯基)丙酰胺、3-(鄰硝基苯基)丙酰胺、2-甲基-2-(鄰硝基苯氧基)丙酰胺、2-甲基-2-(鄰苯偶氮基苯氧基)丙酰胺、4-氯丁酰胺、3-甲基-3-硝基丁酰胺、鄰硝基肉桂酰胺、N-乙?;鞍彼嵫苌?、鄰硝基苯甲酰胺和鄰(苯甲?;趸谆?苯甲酰胺。
氮保護基如氨基甲酸酯基(例如,-C(=O)ORaa),包括,但不限于,氨基甲酸甲基酯、氨基甲酸乙基酯、氨基甲酸9-芴基甲基酯(Fmoc)、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲基酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲基酯、氨基甲酸2,7-二-叔丁基-[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氫噻噸基)]甲基酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸4-甲氧基苯甲酰甲基酯(Phenoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙基酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙基酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙基酯(hZ)、氨基甲酸1-(1-金剛烷基)-1-甲基乙基酯(Adpoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-鹵代乙基酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙基酯(DB-t-BOC)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙基酯(TCBOC)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-聯苯基)乙基酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙基酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸2-(2’-和4’-吡啶基)乙基酯(Pyoc)、氨基甲酸2-(N,N-二環(huán)己基甲酰胺基)乙基酯、氨基甲酸叔丁基酯(BOC或Boc)、氨基甲酸1-金剛烷基酯(Adoc)、氨基甲酸乙烯基酯(Voc)、氨基甲酸烯丙基酯(Alloc)、氨基甲酸1-異丙基烯丙基酯(Ipaoc)、氨基甲酸肉桂基酯(Coc)、氨基甲酸4-硝基肉桂基酯(Noc)、氨基甲酸8-喹啉基酯、氨基甲酸N-羥基哌啶基酯、氨基甲酸烷基二硫基酯、氨基甲酸芐基酯(Cbz)、氨基甲酸對甲氧基芐基酯(Moz)、氨基甲酸對硝基芐基酯、氨基甲酸對溴芐基酯、氨基甲酸對氯芐基酯、氨基甲酸2,4-二氯芐基酯、氨基甲酸4-甲基亞磺酰基芐基酯(Msz)、氨基甲酸9-蒽基甲基酯、氨基甲酸二苯基甲基酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙基酯、氨基甲酸2-甲基磺?;一?、氨基甲酸2-(對甲苯磺酰基)乙基酯、氨基甲酸[2-(1,3-二噻烷基)]甲基酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基噻吩基酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基噻吩基酯(Bmpc)、氨基甲酸2-磷基乙基酯(Peoc)、氨基甲酸2-三苯基磷基異丙基酯(Ppoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙基酯、氨基甲酸間氯-對?;趸S基酯、氨基甲酸對(二羥基硼基)芐基酯、氨基甲酸5-苯并異唑基甲基酯、氨基甲酸2-(三氟甲基)-6-色酮基甲基酯(Tcroc)、氨基甲酸間硝基苯基酯、氨基甲酸3,5-二甲氧基芐基酯、氨基甲酸鄰硝基芐基酯、氨基甲酸3,4-二甲氧基-6-硝基芐基酯、氨基甲酸苯基(鄰硝基苯基)甲基酯、氨基甲酸叔戊基酯、氨基硫代甲酸S-芐基酯、氨基甲酸對氰基芐基酯、氨基甲酸環(huán)丁基酯、氨基甲酸環(huán)己基酯、氨基甲酸環(huán)戊基酯、氨基甲酸環(huán)丙基甲基酯、氨基甲酸對癸基氧基芐基酯、氨基甲酸2,2-二甲氧基酰基乙烯基酯、氨基甲酸鄰(N,N-二甲基甲酰胺基)芐基酯、氨基甲酸1,1-二甲基-3-(N,N-二甲基甲酰胺基)丙基酯、氨基甲酸1,1-二甲基丙炔基酯、氨基甲酸二(2-吡啶基)甲基酯、氨基甲酸2-呋喃基甲基酯、氨基甲酸2-碘乙基酯、氨基甲酸異冰片基酯、氨基甲酸異丁基酯、氨基甲酸異煙?;ァ被姿醦-(p’-甲氧基苯偶氮基)芐基酯、氨基甲酸1-甲基環(huán)丁基酯、氨基甲酸1-甲基環(huán)己基酯、氨基甲酸1-甲基-1-環(huán)丙基甲基酯、氨基甲酸1-甲基-1-(3,5-二甲氧基苯基)乙基酯、氨基甲酸1-甲基-1-(對苯偶氮基苯基)乙基酯、氨基甲酸1-甲基-1-苯基乙基酯、氨基甲酸1-甲基-1-(4-吡啶基)乙基酯、氨基甲酸苯基酯、氨基甲酸對(苯偶氮基)芐基酯、氨基甲酸2,4,6-三-叔丁基苯基酯、氨基甲酸4-(三甲基銨)芐基酯和氨基甲酸2,4,6-三甲基芐基酯。
氮保護基如磺酰胺基團(例如,-S(=O)2Raa),包括,但不限于,對甲苯磺酰胺(Ts)、苯磺酰胺、2,3,6,-三甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mtr)、2,4,6-三甲氧基苯磺酰胺(Mtb)、2,6-二甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Pme)、2,3,5,6-四甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mte)、4-甲氧基苯磺酰胺(Mbs)、2,4,6-三甲基苯磺酰胺(Mts)、2,6-二甲氧基-4-甲基苯磺酰胺(iMds)、2,2,5,7,8-五甲基色滿-6-磺酰胺(Pmc)、甲烷磺酰胺(Ms)、β-三甲基甲硅烷基乙烷磺酰胺(SES)、9-蒽磺酰胺、4-(4’,8’-二甲氧基萘基甲基)苯磺酰胺(DNMBS)、芐基磺酰胺、三氟甲基磺酰胺和苯甲酰甲基磺酰胺。
其它氮保護基包括,但不限于,吩噻嗪基-(10)-酰基衍生物、N’-對甲苯磺?;被;苌?、N’-苯基氨基硫代酰基衍生物、N-苯甲酰基苯基丙氨?;苌铩-乙?;鞍彼嵫苌?、4,5-二苯基-3-唑啉-2-酮、N-鄰苯二甲酰亞胺、N-二硫代琥珀酰亞胺(Dts)、N-2,3-二苯基馬來酰亞胺、N-2,5-二甲基吡咯、N-1,1,4,4-四甲基二甲硅烷基氮雜環(huán)戊烷加合物(STABASE)、5-取代的1,3-二甲基-1,3,5-三氮雜環(huán)己-2-酮、5-取代的1,3-二芐基-1,3,5-三氮雜環(huán)己-2-酮、1-取代的3,5-二硝基-4-吡啶酮、N-甲基胺、N-烯丙基胺、N-[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基胺(SEM)、N-3-乙酰氧基丙基胺、N-(1-異丙基-4-硝基-2-氧代-3-吡咯烷-3-基)胺、季銨鹽、N-芐基胺、N-二(4-甲氧基苯基)甲基胺、N-5-二苯并環(huán)庚三烯基胺、N-三苯基甲基胺(Tr)、N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺(MMTr)、N-9-苯基芴基胺(PhF)、N-2,7-二氯-9-芴基亞甲基胺、N-二茂鐵基甲基氨基(Fcm)、N-2-吡啶甲基氨基N’-氧化物、N-1,1-二甲基硫基亞甲基胺、N-亞芐基胺、N-對甲氧基亞芐基胺、N-二苯基亞甲基胺、N-[(2-吡啶基)基]亞甲基胺、N-(N’,N’-二甲基氨基亞甲基)胺、N,N’-亞異丙基二胺、N-對硝基亞芐基胺、N-亞水楊基胺、N-5-氯亞水楊基胺、N-(5-氯-2-羥基苯基)苯基亞甲基胺、N-亞環(huán)己基胺、N-(5,5-二甲基-3-氧代-1-環(huán)己烯基)胺、N-硼烷衍生物、N-二苯基硼酸衍生物、N-[苯基(五?;t-或鎢)酰基]胺、N-銅螯合物、N-鋅螯合物、N-硝基胺、N-亞硝胺、胺N-氧化物、二苯基膦酰胺(Dpp)、二甲基硫代膦酰胺(Mpt)、二苯基硫代膦酰胺(Ppt)、二烷基氨基磷酸酯、二芐基氨基磷酸酯、二苯基氨基磷酸酯、苯亞磺酰胺、鄰硝基苯亞磺酰胺(Nps)、2,4-二硝基苯亞磺酰胺、五氯苯亞磺酰胺、2-硝基-4-甲氧基苯亞磺酰胺、三苯基甲基亞磺酰胺和3-硝基吡啶亞磺酰胺(Npys)。
示例性的氧原子取代基包括,但不限于,-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3+X-、-P(ORcc)2、-P(ORcc)3+X-、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2和-P(=O)(N(Rbb)2)2,其中X-、Raa、Rbb和Rcc如本文所定義。在一些實施方案中,存在于氧原子上的氧原子取代基是氧保護基(也稱為羥基保護基)。氧保護基是本領域眾所周知的且包括詳細描述于Protecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,第三版,John Wiley&Sons,1999中的那些,其在此引入作為參考。示例性氧保護基包括,但不限于,甲基、叔丁氧羰基(BOC或Boc)、甲氧基甲基(MOM)、甲基硫基甲基(MTM)、叔丁基硫基甲基、(苯基二甲基甲硅烷基)甲氧基甲基(SMOM)、芐基氧基甲基(BOM)、對甲氧基芐基氧基甲基(PMBM)、(4-甲氧基苯氧基)甲基(p-AOM)、愈創(chuàng)木酚甲基(GUM)、叔丁氧基甲基、4-戊烯基氧基甲基(POM)、甲硅烷氧基甲基、2-甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2,2,2-三氯乙氧基甲基、二(2-氯乙氧基)甲基、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEMOR)、四氫吡喃基(THP)、3-溴代四氫吡喃基、四氫噻喃基、1-甲氧基環(huán)己基、4-甲氧基四氫吡喃基(MTHP)、4-甲氧基四氫噻喃基、4-甲氧基四氫噻喃基S,S-二氧化物、1-[(2-氯-4-甲基)苯基]-4-甲氧基哌啶-4-基(CTMP)、1,4-二烷-2-基、四氫呋喃基、四氫噻吩基、2,3,3a,4,5,6,7,7a-八氫-7,8,8-三甲基-4,7-甲橋苯并呋喃(methanobenzofuran)-2-基、1-乙氧基乙基、1-(2-氯乙氧基)乙基、1-甲基-1-甲氧基乙基、1-甲基-1-芐基氧基乙基、1-甲基-1-芐基氧基-2-氟乙基、2,2,2-三氯乙基、2-三甲基甲硅烷基乙基、2-(苯基氫硒基)乙基、叔丁基、烯丙基、對氯苯基、對甲氧基苯基、2,4-二硝基苯基、芐基(Bn)、對甲氧基芐基、3,4-二甲氧基芐基、鄰硝基芐基、對硝基芐基、對鹵代芐基、2,6-二氯芐基、對氰基芐基、對苯基芐基、2-吡啶甲基、4-吡啶甲基、3-甲基-2-吡啶甲基N-氧化物、二苯基甲基、p,p’-二硝基二苯甲基、5-二苯并環(huán)庚三烯基、三苯基甲基、α-萘基二苯基甲基、對甲氧基苯基二苯基甲基、二(對甲氧基苯基)苯基甲基、三(對甲氧基苯基)甲基、4-(4′-溴代苯甲?;趸交?二苯基甲基、4,4′,4″-三(4,5-二氯苯二酰亞氨基苯基)甲基、4,4′,4″-三(乙酰丙?;趸交?甲基、4,4′,4″-三(苯甲?;趸交?甲基、3-(咪唑-1-基)二(4′,4″-二甲氧基苯基)甲基、1,1-二(4-甲氧基苯基)-1′-芘基甲基、9-蒽基、9-(9-苯基)噸基、9-(9-苯基-10-氧代)蒽基、1,3-苯并二硫雜噻吩(disulfuran)-2-基、苯并異噻唑基S,S-二氧化物、三甲基甲硅烷基(TMS)、三乙基甲硅烷基(TES)、三異丙基甲硅烷基(TIPS)、二甲基異丙基甲硅烷基(IPDMS)、二乙基異丙基甲硅烷基(DEIPS)、二甲基己基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)、三芐基甲硅烷基、三-對二甲苯基甲硅烷基、三苯基甲硅烷基、二苯基甲基甲硅烷基(DPMS)、叔丁基甲氧基苯基甲硅烷基(TBMPS)、甲酸酯、苯甲?;姿狨?、乙酸酯、氯乙酸酯、二氯乙酸酯、三氯乙酸酯、三氟乙酸酯、甲氧基乙酸酯、三苯基甲氧基乙酸酯、苯氧基乙酸酯、對氯苯氧基乙酸酯、3-苯基丙酸酯、4-戊酮酸酯(乙酰丙酸酯)、4,4-(亞乙基二硫基)戊酸酯(乙酰丙?;蚩s醛)、新戊酸酯、金剛酸酯、巴豆酸酯、4-甲氧基巴豆酸酯、苯甲酸酯、對苯基苯甲酸酯、2,4,6-三甲基苯甲酸酯(米酮酸酯)、烷基甲基碳酸酯、9-芴基甲基碳酸酯(Fmoc)、烷基乙基碳酸酯、烷基2,2,2-三氯乙基碳酸酯(Troc)、2-(三甲基甲硅烷基)乙基碳酸酯(TMSEC)、2-(苯基磺?;?乙基碳酸酯(Psec)、2-(三苯基磷基)乙基碳酸酯(Peoc)、烷基異丁基碳酸酯、烷基乙烯基碳酸酯、烷基烯丙基碳酸酯、烷基對硝基苯基碳酸酯、烷基芐基碳酸酯、烷基對甲氧基芐基碳酸酯、烷基3,4-二甲氧基芐基碳酸酯、烷基鄰硝基芐基碳酸酯、烷基對硝基芐基碳酸酯、烷基S-芐基硫代碳酸酯、4-乙氧基-1-萘基碳酸酯、甲基二硫代碳酸酯、2-碘代苯甲酸酯、4-疊氮基丁酸酯、4-硝基-4-甲基戊酸酯、鄰-(二溴甲基)苯甲酸酯、2-甲酰基苯磺酸酯、2-(甲基硫基甲氧基)乙基、4-(甲基硫基甲氧基)丁酸酯、2-(甲基硫基甲氧基甲基)苯甲酸酯、2,6-二氯-4-甲基苯氧基乙酸酯、2,6-二氯-4-(1,1,3,3-四甲基丁基)苯氧基乙酸酯、2,4-二(1,1-二甲基丙基)苯氧基乙酸酯、氯二苯基乙酸酯、異丁酸酯、單琥珀酸酯、(E)-2-甲基-2-丁烯酸酯、鄰(甲氧基?;?苯甲酸酯、α-萘甲酸酯、硝酸酯、烷基N,N,N’,N’-四甲基磷酰二胺酯(phosphorodiamidate)、烷基N-苯基氨基甲酸酯、硼酸酯、二甲基膦基亞硫?;⑼榛?,4-二硝基苯基次磺酸酯、硫酸酯、甲烷磺酸酯(甲磺酸酯)、芐基磺酸酯和甲苯磺酸酯(Ts)。
示例性的硫原子取代基包括,但不限于,-Raa、-N(Rbb)2、-C(=O)SRaa、-C(=O)Raa、-CO2Raa、-C(=O)N(Rbb)2、-C(=NRbb)Raa、-C(=NRbb)ORaa、-C(=NRbb)N(Rbb)2、-S(=O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3、-P(Rcc)2、-P(Rcc)3+X-、-P(ORcc)2、-P(ORcc)3+X-、-P(=O)(Raa)2、-P(=O)(ORcc)2和-P(=O)(N(Rbb)2)2,其中Raa、Rbb和Rcc如本文所定義。在一些實施方案中,存在于硫原子的硫原子取代基是硫保護基團(也稱為巰基保護基)。硫保護基是本領域熟知的且包括Protecting Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene和P.G.M.Wuts,第3版,John Wiley&Sons,1999中詳細描述的那些,將其并入本文作為參考。
術語“離去基團”被賦予其在合成有機化學領域的一般含義且是指能夠被親核試劑置換的原子或基團。參見,例如,Smith,March Advanced OrganicChemistry,第6版,(501-502)。合適的離去基團的實例包括,但不限于,鹵素(例如F、Cl、Br或I(碘))、烷氧基羰基氧基、芳基氧基羰基氧基、烷基磺?;趸⒎蓟酋;趸?、烷基-羰基氧基(例如,乙酰氧基)、芳基羰基氧基、芳基氧基、甲氧基、N,O-二甲基羥基氨基、pixyl和鹵代甲酸酯。在一些情況下,所述離去基團是磺酸酯,例如甲苯磺酸酯(tosylate、–OTs)、甲磺酸酯(mesylate、–OMs)、對溴苯磺酰氧基(對溴苯磺酸酯、–OBs)、–OS(=O)2(CF2)3CF3(全氟丁磺酸酯、–ONf)或三氟甲磺酸酯(triflate,–OTf)。在一些情況下,所述離去基團是對溴苯磺酸酯,例如對溴苯磺酰氧基。在一些情況下,所述離去基團是硝基苯磺酸酯(nosylate),例如2-硝基苯磺?;趸T谝恍嵤┓桨钢?,所述離去基團是含磺酸酯的基團。在一些實施方案中,所述離去基團是甲苯磺酸酯基團。所述離去基團也可為氧化膦(例如,在Mitsunobu反應中形成)或內部離去基團例如環(huán)氧化物或環(huán)硫酸酯。離去基團的其他非限制性實例是水、氨、醇、醚部分、硫醚部分、鹵化鋅、鎂部分、重氮鹽和銅部分。其他示例性的離去基團包括,但不限于,活化取代的羥基(例如,–OC(=O)SRaa、–OC(=O)Raa、–OCO2Raa、–OC(=O)N(Rbb)2、–OC(=NRbb)Raa、–OC(=NRbb)ORaa、–OC(=NRbb)N(Rbb)2、–OS(=O)Raa、–OSO2Raa、–OP(Rcc)2、–OP(Rcc)3、–OP(=O)2Raa、–OP(=O)(Raa)2、–OP(=O)(ORcc)2、–OP(=O)2N(Rbb)2和–OP(=O)(NRbb)2,其中Raa、Rbb和Rcc如本文所定義)。
本公開不旨在以任何方式限制為上述示例性的取代基列表。
術語“藥學上可接受的鹽”是指那些鹽,其在合理的醫(yī)學判斷范圍內適用于與人和低等動物的組織接觸而沒有過分毒性、刺激性、過敏反應等且與合理的利益/風險比相稱。藥學上可接受的鹽是本領域熟知的。例如,Berge等人在J.Pharmaceutical Sciences,1977,66,1-19中詳細描述的藥學上可接受的鹽,將其引入本文作為參考。本發(fā)明化合物的藥學上可接受的鹽包括衍生自適當的無機和有機酸和無機和有機堿的那些。藥學上可接受的無毒酸加成鹽的實例是氨基與無機酸(例如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸和高氯酸)或與有機酸(例如乙酸、草酸、馬來酸、酒石酸、檸檬酸、琥珀酸或丙二酸)形成的鹽或使用本領域已知的其他方法(例如離子交換)形成的鹽。其他藥學上可接受的鹽包括己二酸鹽、海藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬氨酸鹽、苯磺酸鹽、苯甲酸鹽、硫酸氫鹽、硼酸鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環(huán)戊丙酸鹽、二葡糖酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、甘油磷酸鹽、葡糖酸鹽、半硫酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、氫碘酸鹽、2-羥基-乙磺酸鹽、乳糖酸鹽、乳酸鹽、月桂酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、甲磺酸鹽、2-萘磺酸鹽、煙酸鹽、硝酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、撲酸鹽、果膠酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸鹽、磷酸鹽、苦味酸鹽、新戊酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、硫氰酸鹽、對甲苯磺酸鹽、十一酸鹽、戊酸鹽等。衍生自適當的堿的鹽包括堿金屬鹽、堿土金屬鹽、銨鹽和N+(C1-4烷基)4-鹽。代表性的堿金屬或堿土金屬鹽包括鈉鹽、鋰鹽、鉀鹽、鈣鹽、鎂鹽等。其他藥學上可接受的鹽包括,當合適時,使用平衡離子形成的無毒銨、季銨和胺陽離子的鹽,所述平衡離子例如鹵化物、氫氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、低級烷基磺酸根和芳基磺酸根。
術語“溶劑合物”是指通常由溶劑分解反應形成的與溶劑締合的化合物或其鹽的形式。這種物理締合可包括氫鍵鍵合。常規(guī)溶劑包括包括水、甲醇、乙醇、乙酸、DMSO、THF、乙醚等。本文所述的化合物可制備成,例如,結晶形式,且可被溶劑化。合適的溶劑合物包括藥學上可接受的溶劑合物且進一步包括化學計量的溶劑合物和非化學計量的溶劑合物。在一些情況下,所述溶劑合物將能夠分離,例如,當一或多個溶劑分子摻入結晶固體的晶格中時?!叭軇┖衔铩卑ㄈ芤籂顟B(tài)的溶劑合物和可分離的溶劑合物。代表性的溶劑合物包括水合物、乙醇合物和甲醇合物。
術語“水合物”是指與水結合的化合物。通常,包含在化合物的水合物中的水分子數與該水合物中該化合物分子數的比率是確定的。因此,化合物的水合物可用例如通式R·x H2O代表,其中R是該化合物,和x是大于0的數。給定化合物可形成超過一種水合物類型,包括,例如,單水合物(x為1)、低級水合物(x是大于0且小于1的數,例如,半水合物(R·0.5H2O))和多水合物(x為大于1的數,例如,二水合物(R·2H2O)和六水合物(R·6H2O)。
術語“互變異構體”或“互變異構的”是指由至少一種氫原子的形式遷移和至少一種化合價變化(例如,單鍵到雙鍵,叁鍵到單鍵,或反之亦然)引起的兩種或多種可互相轉化的化合物?;プ儺悩嬻w的確切比率取決于多種因素,包括溫度、溶劑和pH。互變異構作用(即,提供互變異構對的反應)可用酸或堿催化。示例性的互變異構作用包括酮-烯醇、酰胺-酰亞胺、內酰胺-內酰亞胺、烯胺-亞胺和烯胺-(不同烯胺)的互變異構作用。
還應理解,具有相同分子式但性質或它們原子的鍵合順序或它們的原子的空間排列不同的化合物被稱為“異構體”。原子的空間排列不同的異構體被稱為“立體異構體”。
彼此間不是鏡像關系的立體異構體被稱為“非對映異構體”而彼此間是非重疊鏡像關系的那些被稱為“對映異構體”。當化合物具有不對稱中心時,例如,當它與四個不同的基團鍵合時,可能有一對對映異構體。對映異構體可通過其不對稱中心的絕對構型表征且可用Cahn和Prelog的R-和S-次序規(guī)則進行描述,或通過以下方式進行描述,其中該分子在偏振光平面旋轉并指定為右旋或左旋(即,分別為(+)或(-)-異構體)。手性化合物可以單一對映異構體或其混合物存在。含有等比對映異構體的混合物被稱為“外消旋混合物”。
術語“多晶型物”是指化合物的(或其鹽、水合物或溶劑合物)結晶形式。所有的多晶型物具有相同的元素組成。不同的結晶形式通常具有不同的X射線衍射圖、紅外光譜、熔點、密度、硬度、晶體形狀、光電性質、穩(wěn)定性和溶解度。重結晶溶劑、結晶速率、貯存溫度和其他因素可導致一種結晶形式占優(yōu)?;衔锏母鞣N多晶型物可在不同的條件下通過結晶制備。
術語“前藥”是指化合物,其具有可斷裂基團且通過溶劑分解或在生理條件下成為本文所述化合物,其在體內是藥學上活性的。這種實例包括,但不限于,膽堿酯衍生物等、N-烷基嗎啉酯等。本發(fā)明化合物的其他衍生物在其酸或酸衍生物形式下均具有活性,但在酸敏感形式下通常在溶解度、組織相容性或哺乳動物生物體延遲釋放方面提供優(yōu)勢(參見,Bundgard,H.,Designof前藥s,第7-9,21-24頁,Elsevier,Amsterdam 1985)。前藥包括本領域從業(yè)者熟知的酸衍生物,例如,通過母體酸與合適的醇的反應制備的酯,或通過母體酸化合物與取代或未取代的胺的反應制備的酰胺,或酸酐,或混合酐類。衍生自本發(fā)明化合物上的酸性基團的簡單的脂肪族或芳族酯、酰胺和酐是具體的前藥。在一些情況下,需要制備雙酯型前藥,例如(酰氧基)烷基酯或((烷氧基羰基)氧基)烷基酯。本文所述化合物的C1-C8烷基、C2-C8烯基、C2-C8炔基、芳基、C7-C12取代的芳基和C7-C12芳基烷基酯可為優(yōu)選的。
術語“小分子”具有相對低的分子量的分子,無論是天然存在的還是人工創(chuàng)造的(例如,通過化學合成)。通常,小分子是有機化合物(即,它含有碳)。所述小分子可含有多個碳-碳鍵、立體中心和其他官能團(例如,胺、羥基、羰基和雜環(huán)等)。在一些實施方案中,小分子的分子量最多約1,000g/mol、最多約900g/mol、最多約800g/mol、最多約700g/mol、最多約600g/mol、最多約500g/mol、最多約400g/mol、最多約300g/mol、最多約200g/mol或最多約100g/mol。在一些實施方案中,小分子的分子量至少約100g/mol、至少約200g/mol、至少約300g/mol、至少約400g/mol、至少約500g/mol、至少約600g/mol、至少約700g/mol、至少約800g/mol或至少約900g/mol或至少約1,000g/mol。上述范圍的組合(例如,至少約200g/mol和最多約500g/mol)也是可能的。在一些實施方案中,所述小分子是治療活性劑,例如藥物(例如,由美國食品與藥物管理局批準,提供在美國聯邦法規(guī)匯編(C.F.R.)中的分子)。所述小分子也可與一或多個原子和/或金屬離子絡合。優(yōu)選的小分子是生物活性的,其在動物,優(yōu)選哺乳動物,更優(yōu)選人中產生生物效應。小分子包括,但不限于,放射性核素和顯像劑。在一些實施方案中,所述小分子是藥物。優(yōu)選地,但不是一定,該藥物是已被合適的政府機構或監(jiān)管機構認定為安全且有效地用于人或動物的藥物。例如,批準用于人的藥物由FDA在21C.F.R.§§330.5,331至361和440至460中列出,將其并入本文作為參考;獸醫(yī)用途的藥物由FDA在21C.F.R.§§500至589中列出,將其并入本文作為參考。所有列出的藥物被認為是可以接受地用于本發(fā)明。
“蛋白”、“肽”或“多肽”包括通過肽鍵連接在一起的氨基酸殘基的聚合物并涉及任何大小、結構或功能的蛋白、多肽和肽。通常,蛋白將至少為3個氨基酸長度。蛋白可以是指單獨的蛋白或蛋白的集合。本申請所述的蛋白優(yōu)選僅含有天然氨基酸,但也可替代地采用非天然氨基酸(即,天然不存在但可摻入多肽鏈中的化合物)和/或本領域已知的氨基酸類似物。此外,蛋白中的一個或多個氨基酸可被修飾,例如,通過加入化學實體,例如碳水化合物基團、羥基、磷酸基、法呢基、異法呢基、脂肪酸基團、用于綴合或官能化的連接基,或其他修飾。蛋白可為單分子或可為多分子復合物。蛋白可為天然存在蛋白或肽的片段。蛋白可為天然存在的、重組的、合成的或這些的任意組合。
術語“基因”是指核酸片段,其表達特定蛋白,包括編碼序列前的調節(jié)序列(5'非編碼序列)和編碼序列后的調節(jié)序列(3'非編碼序列)。“天然基因”是指在自然界中以其自身調節(jié)序列被發(fā)現的基因?!扒逗匣颉被颉扒逗蠘嫿w”是指任意基因或構建體(非天然基因),其包含在自然界中未一同存在的調節(jié)序列和編碼序列。因此,嵌合基因或嵌合構建體可包含衍生自不同來源的調節(jié)序列和編碼序列,或衍生自相同來源但與自然界中發(fā)現的排列方式不同的調節(jié)序列和編碼序列。“內源基因”是指天然位于生物體基因組中的天然基因。“外源”基因是指通常不存在于宿主生物體中但通過基因轉移引入宿主生物體中的基因。外源基因可包括插入非天然生物體的天然基因,或嵌合基因?!稗D基因”是通過轉化方法已經導入基因組中的基因。
術語“組蛋白”是指在真核細胞核中發(fā)現的強堿性蛋白,其包裝和排列DNA至稱為核小體的結構單元。它們是染色質的主要蛋白成分,作為DNA所圍繞的線軸并發(fā)揮基因調控的作用。在一些實施方案中,所述組蛋白為組蛋白H1(例如,組蛋白H1F、組蛋白H1H1)。在一些實施方案中,所述組蛋白為組蛋白H2A(例如,組蛋白H2AF、組蛋白H2A1、組蛋白H2A2)。在一些實施方案中,所述組蛋白為組蛋白H2B(例如,組蛋白H2BF、組蛋白H2B1、組蛋白H2B2)。在一些實施方案中,所述組蛋白為組蛋白H3(例如,組蛋白H3A1、組蛋白H3A2、組蛋白H3A3)。在一些實施方案中,所述組蛋白為組蛋白H4(例如,組蛋白H41、組蛋白H44)。
術語“溴結構域”是指識別乙?;嚢彼釟埢?例如在組蛋白N末端尾部的那些殘基)的蛋白結構域。在一些實施方案中,BET蛋白的溴結構域包含大約110個氨基酸并共享一個保守的折疊,其包括由與染色質相互作用的不同環(huán)區(qū)域連接的4α螺旋的左側束(left-handed bundle)。在一些實施方案中,所述溴結構域為ASH1L(GenBank ID:gi|8922081)、ATAD2(GenBank ID:gi|24497618)、BAZ2B(GenBank ID:gi|7304923)、BRD1(GenBank ID:gi|11321642)、BRD2(1)(GenBank ID:gi|4826806)、BRD2(2)(GenBank ID:gi|4826806)、BRD3(1)(GenBank ID:gi|11067749)、BRD3(2)(GenBank ID:gi|11067749)、BRD4(1)(GenBank ID:gi|19718731)、BRD4(2)(GenBank ID:gi|19718731)、BRD9(GenBank ID:gi|57770383)、BRDT(1)(GenBank ID:gi|46399198)、BRPF1(GenBank ID:gi|51173720)、CECR2(GenBank ID:gi|148612882)、CREBBP(GenBank ID:gi|4758056)、EP300(GenBank ID:gi|50345997)、FALZ(GenBank ID:gi|38788274)、GCN5L2(GenBank ID:gi|10835101)、KIAA1240(GenBank ID:gi|51460532)、LOC93349(GenBank ID:gi|134133279)、PB1(1)(GenBank ID:gi|30794372)、PB1(2)(GenBank ID:gi|30794372)、PB1(3)(GenBank ID:gi|30794372)、PB1(5)(GenBank ID:gi|30794372)、PB1(6)(GenBank ID:gi|30794372)、PCAF(GenBank ID:gi|40805843)、PHIP(2)(GenBank ID:gi|34996489)、SMARCA2(GenBank ID:gi|48255900)、SMARCA4(GenBank ID:gi|21071056)、SP140(GenBank ID:gi|52487219)、TAF1(1)(GenBank ID:gi|20357585)、TAF1(2)(GenBank ID:gi|20357585)、TAF1L(1)(GenBank ID:gi|24429572)、TAF1L(2)(GenBank ID:gi|24429572)、TIF1(GenBank ID:gi|14971415)、TRIM28(GenBank ID:gi|5032179)或WDR9(2)(GenBank ID:gi|16445436)。
術語“含溴結構域蛋白”或“溴結構域蛋白”是指一種蛋白或其變體,無論是野生型或突變型,天然或合成的,截短的或完整的,其具有足以使功能性溴結構域能夠調節(jié)在第二蛋白(例如,組蛋白)上(例如在組蛋白尾部)的乙?;嚢彼釟埢姆肿幼R別的最小氨基酸序列。含溴結構域蛋白包括,例如,包含溴結構域的融合蛋白和具有所需功能的額外的部分(例如,報道基因部分)。
術語“抑制”或“抑制劑”是指相對于媒介物,化合物降低、減緩、停止或阻止細胞中具體生物過程的活性(例如,溴結構域和/或含溴結構域蛋白的活性)的能力。
當化合物、藥物組合物、方法、用途或試劑盒被稱為“選擇性地”、“特異性地”或“競爭性地”結合第一蛋白或第一染色質時,所述化合物、藥物組合物、方法、用途或試劑盒以比結合第二蛋白或第二染色質更高的結合親和力(例如,不小于約2倍、不小于約5倍、不小于約10倍、不小于約30倍、不小于約100倍、不小于約1,000倍或不小于約10,000倍)結合第一蛋白或第一染色質,所述第二蛋白或第二染色質與第一蛋白和第一染色質不同。當化合物、藥物組合物、方法、用途或試劑盒被稱為“選擇性地”、“特異性地”或“競爭性地”調控(例如,增加或抑制)所述含溴結構域蛋白的活性時,所述化合物、藥物組合物、方法、用途或試劑盒相比于調節(jié)至少一種蛋白的活性,將在更大程度上調節(jié)含溴結構域蛋白的活性(例如,不小于約2倍,不小于約5倍,不小于約10倍,不小于約30倍,不小于約100倍,不小于約1,000倍或不小于約10,000倍),所述至少一種蛋白不同于所述含溴結構域蛋白。
術語“異?;钚浴笔侵钙x正常活性的活性。術語“升高的活性”是指高于正?;钚缘幕钚浴?/p>
術語“組合物”和“制劑”可互換使用。
預期實施給藥的“受試者”是指人(即,任何年齡組的男性或女性,例如,兒科受試者(例如,嬰兒、兒童、青少年)或成人受試者(例如,年輕成人、中年成人或老年成人))和/或其他非人動物。在一些實施方案中,所述非人動物是哺乳動物(例如,靈長類(例如,食蟹猴、恒河猴)、市售相關的哺乳動物(例如牛、豬、馬、綿羊、山羊、貓或狗)或鳥(例如,市售相關的鳥,例如雞、鴨、鵝或火雞)。在一些實施方案中,所述非人動物是魚、爬行動物或兩棲動物。該非人動物可為任意發(fā)育階段的雄性或雌性。該非人動物可為轉基因動物或基因工程動物。“患者”是指需要治療疾病的人受試者。所述受試者也可為植物。在一些實施方案中,所述植物為陸生植物。在一些實施方案中,所述植物為非維管陸生植物。在一些實施方案中,所述植物為維管陸生植物。在一些實施方案中,所述植物為種子植物。在一些實施方案中,所述植物為栽培植物。在一些實施方案中,所述植物為雙子葉植物。在一些實施方案中,所述植物為單子葉植物。在一些實施方案中,所述植物為有花植物。在一些實施方案中,所述植物為谷類植物,例如,玉蜀黍(maize)、玉米(corn)、小麥、稻、燕麥、大麥、黑麥或粟。在一些實施方案中,所述植物是豆科植物,例如,豆植物,例如,大豆植物。在一些實施方案中,所述植物是樹或灌木。
術語“施用”、“給予”或“給藥”是指植入、吸收、攝入、注射、吸入、或以其他的方式向受試者引入本申請所述的化合物,或其組合物。
術語“治療”和“處理”是指逆轉、減輕、延遲發(fā)作或抑制本文所述疾病的進展。在一些實施方案中,治療可在該疾病已出現或已觀察到一或多種跡象或癥狀后施用。在其他實施方案中,治療可在沒有該疾病的跡象或癥狀的情況下施用。例如,治療可在癥狀發(fā)作前施用至易感受試者(例如,根據癥狀史和/或根據對病原體的暴露)。治療也可在癥狀消失后繼續(xù),例如,以延遲和/或預防復發(fā)。
術語“病癥”、“疾病”和“障礙”可互換使用。
本文所述化合物的“有效量”是指足以引起所需生物學響應(即,治療該病癥)的量。如本領域技術人員將理解的,本文所述化合物的有效量可根據以下因素而變化:預期生物學終點、化合物的藥代動力學、所治療的病癥、給藥方式和受試者的年齡和健康狀況。有效量包括治療性和預防性治療。在一些實施方案中,有效量是治療有效量。在一些實施方案中,有效量是預防有效量。在一些實施方案中,有效量是在單次劑量中本發(fā)明化合物或藥物組合物的量。在一些實施方案中,有效量是在多劑量中本發(fā)明化合物或藥物組合物的組合量。
本文所述化合物的“治療有效量”是足以提供在治療病癥中的治療益處或延遲或最小化與該病癥有關的一種或多種癥狀的量?;衔锏闹委熡行Я渴侵竼为毣蚺c其他療法組合來提供治療該病癥的治療益處的治療劑的量。術語“治療有效量”可包括改善整個治療、減輕或消除該病癥的癥狀、跡象或病因、和/或提高另一治療劑的療效的量。
本文所述化合物的“預防有效量”是足以預防病癥或與該病癥相關的一種或多種癥狀,或預防其復發(fā)的量?;衔锏念A防有效量是指單獨或與其他藥物組合來提供在預防該病癥的預防性益處的治療劑的量。術語“預防有效量”可包括提高整體預防或提高另一預防劑的預防效果的量。
“增殖性疾病”是指由于細胞增生造成的異常生長或擴張而造成的疾病(Walker,Cambridge Dictionary of Biology;Cambridge University Press:Cambridge,UK,1990)。增殖性疾病可與以下有關:1)正常靜止期細胞的病理增生;2)細胞從它們的正常位置的病理遷移(例如,腫瘤細胞的轉移);3)蛋白水解酶(例如基質金屬蛋白酶(例如,膠原酶、明膠酶和彈性蛋白酶))的病理表達;或4)在增殖性視網膜病和腫瘤轉移中的病理性血管發(fā)生。示例性的增殖性疾病包括癌癥(即,“惡性腫瘤”)、良性腫瘤、病理性血管發(fā)生、炎性疾病和自身免疫性疾病。
術語“血管發(fā)生(angiogenesis)”是指從早已存在的血管形成新的血管的生理過程。血管發(fā)生不同于血管新生(vasculogenesis),其是從中胚層細胞前體從頭形成內皮細胞。在通過血管新生形成發(fā)育胚胎的第一血管之后,血管發(fā)生在正?;虍惓0l(fā)育過程中主要負責絕大多數的血管生長。血管發(fā)生在生長和發(fā)育,以及傷口愈合和肉芽組織的形成中是重要過程。但是,血管發(fā)生也是腫瘤從良性狀態(tài)轉變到惡性狀態(tài)的基礎步驟,從而導致在治療癌癥過程中使用血管發(fā)生抑制劑。血管發(fā)生可通過血管發(fā)生蛋白(例如生長因子(例如,VEGF))進行化學刺激?!安±硇缘难馨l(fā)生”是指異常的(例如,過度或不足的)血管發(fā)生,其發(fā)展成疾病和/或與疾病有關。
術語“新生物(neoplasm)”和“腫瘤(tumor)”可互換使用并指的是組織的異常腫塊,其中該腫塊的生長超過正常組織的生長且與正常組織的生長不協調。新生物或腫瘤可為“良性的”或“惡性的”,其取決于以下特征:細胞分化程度(包括形態(tài)和功能)、生長速度、局部侵害和轉移?!傲夹阅[瘤”通常是充分分化的、比惡性腫瘤具有顯著慢的生長、并仍局限于起源位置。此外,良性腫瘤不具有滲透、侵入或轉移到遠距離位置的能力。示例性的良性腫瘤包括,但不限于,脂肪瘤、軟骨瘤、腺瘤、軟垂疣、老年性血管瘤、脂溢性角化病、雀斑痣和皮脂腺增生。在一些情況下,一些“良性”腫瘤可能在以后引起惡性腫瘤,其可能是由于該腫瘤的腫瘤細胞亞群額外的基因變化所導致的,且這些腫瘤被稱為“癌前腫瘤(pre-malignant neoplasm)”。示例性的癌前腫瘤是畸胎瘤。相反,“惡性腫瘤”通常為低分化的(間變(anaplasia))并具有顯著地快速生長,伴有進行性滲透、侵入和破壞周圍組織。此外,惡性腫瘤通常具有轉移到遠距離位置的能力。術語“轉移”、“轉移的”或“遷移”是指癌細胞從原發(fā)性或原始腫瘤擴散或轉移至另一器官或組織且其通常通過以下進行確定:在繼發(fā)性(轉移性)腫瘤所在的器官或組織中,存在原發(fā)性或原始腫瘤的組織類型并且不是所在器官或組織的組織類型的“繼發(fā)性腫瘤”或“繼發(fā)性細胞腫塊”。例如,已經轉移到骨的前列腺癌被稱為轉移性前列腺癌并包括在骨組織中生長的癌性前列腺癌細胞。
術語“癌癥”是指惡性腫瘤(Stedman’s Medical Dictionary,第25版;Hensyl編輯;Williams&Wilkins:Philadelphia,1990)。示例性的癌癥包括,但不限于,聽神經瘤;腺癌;腎上腺癌;肛門癌;血管肉瘤(angiosarcoma)(例如,淋巴血管肉瘤、淋巴管內皮肉瘤、血管肉瘤(hemangiosarcoma));闌尾癌;良性單克隆丙球蛋白??;膽道癌(例如,膽管上皮癌);膀胱癌;乳腺癌(例如,乳腺腺癌、乳腺乳頭狀癌、乳癌、乳腺髓樣癌);腦癌(例如,腦膜瘤、膠質母細胞瘤、神經膠質瘤(例如,星形細胞瘤、少突神經膠質瘤)、髓母細胞瘤);支氣管癌癥;類癌瘤;宮頸癌(例如,宮頸腺癌);絨毛膜癌;脊索瘤;顱咽管瘤;結腸直腸癌(例如,結腸癌、直腸癌、結腸直腸腺癌);結締組織癌;上皮癌;室管膜瘤;內皮肉瘤(例如,卡波西肉瘤、多發(fā)性特發(fā)性出血性肉瘤);子宮內膜癌(例如,子宮癌、子宮肉瘤);食道癌(例如,食道腺癌、巴雷特腺癌);尤因肉瘤;眼癌(例如,眼內黑素瘤、視網膜母細胞瘤);家族性嗜伊紅細胞增多癥;膽囊癌;胃癌(例如,胃腺癌);胃腸道間質瘤(GIST);生殖細胞癌;頭和頸癌(例如,頭和頸鱗狀細胞癌、口腔癌(例如,口腔鱗狀細胞癌)、喉癌(例如,喉頭癌、咽癌、鼻咽癌、口咽癌));造血癌癥(例如,白血病,例如急性淋巴細胞性白血病(ALL)(例如,B細胞ALL、T細胞ALL)、急性髓細胞性白血病(AML)(例如,B細胞AML、T細胞AML)、慢性髓細胞性白血病(CML)(例如,B細胞CML、T細胞CML)和慢性淋巴細胞性白血病(CLL)(例如,B細胞CLL、T細胞CLL));淋巴瘤,例如霍奇金淋巴瘤(HL)(例如,B細胞HL、T細胞HL)和非霍奇金淋巴瘤(NHL)(例如,B細胞NHL,例如彌漫性大細胞淋巴瘤(DLCL)(例如,彌漫性大B細胞淋巴瘤)、濾泡性淋巴瘤、慢性淋巴細胞性白血病/小淋巴細胞性淋巴瘤(CLL/SLL)、套細胞淋巴瘤(MCL)、邊緣區(qū)B細胞淋巴瘤(例如,黏膜相關淋巴組織(MALT)淋巴瘤、淋巴結邊緣區(qū)B細胞淋巴瘤、脾邊緣區(qū)B細胞淋巴瘤)、原發(fā)性縱隔B細胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、淋巴質漿細胞淋巴瘤(即,瓦爾登斯特倫巨球蛋白血癥)、毛細胞性白血病(HCL)、免疫母細胞性大細胞淋巴瘤、前體B淋巴母細胞性淋巴瘤和原發(fā)性中樞神經系統(CNS)淋巴瘤;和T細胞NHL,例如前體T淋巴母細胞性淋巴瘤/白血病、外周T細胞淋巴瘤(PTCL)(例如,皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)(例如,蕈樣肉芽腫病、塞扎里綜合征)、血管免疫母細胞T細胞淋巴瘤、結節(jié)外天然殺傷T細胞淋巴瘤、腸病型T細胞淋巴瘤、皮下脂膜炎樣T細胞淋巴瘤和間變性大細胞淋巴瘤);一種或多種上述白血病/淋巴瘤的混合狀態(tài);和多發(fā)性骨髓瘤(MM))、重鏈病(例如,α鏈病、γ鏈病、μ鏈病);血管母細胞瘤;下咽癌;炎性肌纖維母細胞腫瘤;免疫細胞淀粉樣變性;腎癌(例如,腎母細胞瘤,也稱為維爾姆斯腫瘤、腎細胞癌);肝癌(例如,肝細胞癌(HCC)、惡性肝細胞瘤);肺癌(例如,支氣管原癌、小細胞肺癌(SCLC)、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌);平滑肌肉瘤(LMS);肥大細胞增多癥(例如,系統性肥大細胞增多癥);肌癌;骨髓增生異常綜合征(MDS);間皮瘤;骨髓增生性障礙(MPD)(例如,真性紅細胞增多癥(PV)、原發(fā)性血小板增多癥(ET)、原因不明性髓樣化生(AMM),也稱為骨髓纖維化(MF)、慢性特發(fā)性骨髓纖維化、慢性髓細胞性白血病(CML)、慢性中性粒細胞性白血病(CNL)、嗜酸細胞增多綜合征(HES));神經母細胞瘤;神經纖維瘤(例如,神經纖維瘤病(NF)1型或2型、施萬瘤病(schwannomatosis));神經內分泌腫瘤(例如,胃腸胰神經內分泌腫瘤(GEP-NET)、類癌瘤);骨肉瘤(例如,骨癌);卵巢癌(例如,囊腺癌、卵巢胚胎癌、卵巢腺癌);乳頭狀腺癌;胰腺癌(例如,胰腺腺癌(pancreatic andenocarcinoma)、導管內乳頭狀黏液性腫瘤(IPMN)、胰島細胞癌);陰莖癌(例如,陰莖和陰囊的佩吉特病);松果體瘤;原始性神經外胚層腫瘤(PNT);漿細胞瘤;副腫瘤綜合征(paraneoplasticsyndromes);上皮內腫瘤;前列腺癌(例如,前列腺腺癌);直腸癌;橫紋肌肉瘤;涎腺癌;皮膚癌(例如,鱗狀細胞癌(SCC)、角化棘皮瘤(KA)、黑色素瘤、基底細胞癌(BCC));小腸癌(例如,闌尾癌);軟組織肉瘤(例如,惡性纖維組織細胞瘤(MFH)、脂肪肉瘤、惡性外周神經鞘瘤(MPNST)、軟骨肉瘤、纖維肉瘤、粘液肉瘤);皮脂腺癌;小腸癌;汗腺癌;滑膜瘤;睪丸癌(例如,精原細胞瘤、睪丸胚胎性癌);甲狀腺癌(例如,甲狀腺的乳頭狀癌、乳頭狀甲狀腺癌(PTC)、髓樣甲狀腺癌);尿道癌;陰道癌;和外陰癌(例如,外陰的佩吉特病)。
術語“炎性疾病”是指由炎癥導致、引起或造成炎癥的疾病。術語“炎性疾病”也可指失調的炎癥反應,其導致由巨噬細胞、粒細胞和/或T-淋巴細胞引起的夸大反應,造成異常組織損傷和/或細胞死亡。炎性疾病可為急性或慢性炎性病癥且可由感染或非感染性原因導致。炎性疾病包括,但不限于,動脈粥樣硬化、動脈硬化、自身免疫障礙、多發(fā)性硬化、系統性紅斑狼瘡、風濕性多肌痛(PMR)、痛風性關節(jié)炎、退行性關節(jié)炎、肌腱炎、滑囊炎、銀屑病、囊性纖維化、骨關節(jié)炎、類風濕性關節(jié)炎、炎性關節(jié)炎、干燥綜合征、巨細胞動脈炎、進行性系統性硬化(硬皮病)、強直性脊柱炎、多肌炎、皮肌炎、天皰瘡、類天皰瘡、糖尿病(例如,I型)、重癥肌無力、橋本氏甲狀腺炎、格雷夫斯病、古德帕斯徹病、混合結締組織病、硬化性膽管炎、炎性腸病、克羅恩病、潰瘍性結腸炎、惡性貧血、炎性皮膚病、常見間質肺炎(UIP)、石棉沉滯癥、矽肺、支氣管擴張癥、鈹中毒、滑石病、肺塵癥、類肉狀瘤病、脫屑性間質性肺炎、淋巴樣間質性肺炎、巨細胞間質性肺炎、細胞間質性肺炎、外源性過敏性肺泡炎、韋格納肉芽腫病和脈管炎的相關形式(顳動脈炎和結節(jié)性多發(fā)性動脈炎)、炎性皮膚病、遲發(fā)型超敏反應(例如,毒葛皮炎)、肺炎、呼吸道炎癥、成人呼吸窘迫綜合征(ARDS)、腦炎、速發(fā)型超敏反應、哮喘、花粉癥、過敏、急性過敏反應、風濕熱、腎小球腎炎、腎盂腎炎、蜂窩織炎、膀胱炎、慢性膽囊炎、缺血(缺血性損傷)、再灌注損傷、同種異體移植排斥、宿主抗移植物排斥反應、闌尾炎、動脈炎、眼瞼炎、細支氣管炎、支氣管炎、宮頸炎、膽管炎、絨毛膜羊膜炎、結膜炎、淚腺炎、皮肌炎、心內膜炎、子宮內膜炎、腸炎、小腸結腸炎、上髁炎、附睪炎、筋膜炎、纖維組織炎、胃炎、胃腸炎、牙齦炎、回腸炎、虹膜炎、喉炎、脊髓炎、心肌炎、腎炎、臍炎、卵巢炎、睪丸炎(orchitis)、骨炎、耳炎、胰腺炎、腮腺炎、心包炎、咽炎、胸膜炎、靜脈炎、肺炎、直腸炎、前列腺炎、鼻炎、輸卵管炎、鼻竇炎、口腔炎、滑膜炎、睪丸炎(testitis)、扁桃腺炎、尿道炎、膀胱炎、葡萄膜炎、陰道炎、血管炎、外陰炎、外陰陰道炎、脈管炎、慢性支氣管炎、骨髓炎、視神經炎、顳動脈炎、橫貫性脊髓炎、壞死性筋膜炎和壞死性小腸結腸炎。眼炎性疾病包括,但不限于,手術后的炎癥。
“自身免疫性疾病”是指由于受試者機體對通常存在于所述機體中的物質和組織的不恰當的免疫應答所造成的疾病。換句話說,免疫系統錯把該機體的一部分當做病原體并攻擊其自身的細胞。這可以被限制為特定的器官(例如,在自身免疫性甲狀腺炎中)或涉及不同位置的特定組織(例如,古德帕斯徹病,其可能影響肺和腎的基底膜)。自身免疫性疾病的治療通常是用免疫抑制,例如,降低免疫應答的藥物。示例性的自身免疫性疾病包括,但不限于,腎小球腎炎、古德帕斯徹綜合征、壞死性血管炎、淋巴結炎、結節(jié)性動脈周圍炎、系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節(jié)炎、牛皮癬關節(jié)炎、系統性紅斑狼瘡、銀屑病、潰瘍性結腸炎、系統性硬化癥、皮肌炎/多肌炎、抗磷脂抗體綜合征、硬皮病、尋常型天皰瘡、ANCA相關的血管炎(例如,韋格納肉芽腫病、顯微鏡下多血管炎(microscopic polyangiitis))、葡萄膜炎、干燥綜合征、克羅恩病、賴特綜合征、強直性脊柱炎、萊姆病、格林-巴利綜合征、橋本甲狀腺炎和心肌病。
術語“神經性疾病”是指神經系統的任何疾病,包括涉及中樞神經系統(腦、腦干和小腦)、周圍神經系統(包括顱神經)和自主神經系統(其部分位于中樞和周圍神經系統)的疾病。神經變性疾病是指以神經細胞損失為特征的一種神經性疾病,包括,但不限于,阿爾茨海默氏病、帕金森病、肌萎縮側索硬化、Tau病變(包括額顳癡呆)和亨廷頓舞蹈病。神經性疾病的實例包括,但不限于,頭痛、麻木和昏迷、癡呆、癲癇、睡眠障礙、創(chuàng)傷、感染、腫瘤、神經眼科、運動障礙、脫髓鞘疾病、脊髓疾病和外周神經、肌肉和神經肌肉接頭的疾病。成癮和精神疾病,包括,但不限于,雙相性精神障礙和精神分裂癥,也包括在神經性疾病的定義中。神經性疾病的其他實例包括獲得型癲癇樣失語癥;急性播散性腦脊髓炎;腎上腺腦白質營養(yǎng)不良;胼胝體發(fā)育不全;失認癥;艾卡迪綜合征;亞歷山大??;阿爾珀斯?。唤徊嫘灾w癱瘓;阿爾茨海默氏??;肌萎縮側索硬化;無腦畸形;Angelman綜合征;血管瘤病;缺氧癥;失語癥;失用癥;蛛網膜囊腫;蛛網膜炎;Arnold-Chiari畸形;動靜脈畸形;阿斯佩格綜合征;運動失調性毛細血管擴張癥;注意力缺陷伴多動障礙;自閉癥;自主功能障礙;背痛;巴藤??;貝赫切特??;貝爾麻痹;良性自發(fā)性瞼痙攣;良性病灶;肌肉萎縮;良性顱內高壓;Binswanger病;眼瞼痙攣;Bloch-Sulzberger綜合征;臂叢神經損傷;腦膿腫;腦損傷;腦腫瘤(包括多形性成膠質細胞瘤);脊髓腫瘤;Brown-Sequard綜合征;卡納萬??;腕管綜合征(CTS);灼性神經痛;中樞性疼痛;中心性腦橋髓鞘溶解;頭部障礙;腦動脈瘤;腦動脈硬化;大腦萎縮;大腦性巨人癥;大腦性麻痹;夏-馬-圖三氏?。换瘜W療法誘導的神經病和神經性疼痛;Chiari畸形;舞蹈癥;慢性炎癥性脫髓鞘性多發(fā)性神經病(CIDP);慢性疼痛;慢性區(qū)域性疼痛綜合征;科-勒二氏綜合征;昏迷,包括持續(xù)性植物人狀態(tài);先天性面癱;皮質基底節(jié)變性(corticobasal degeneration);顱動脈炎;顱縫早閉;克雅氏病(Creutzfeldt-Jakob disease);累積創(chuàng)傷障礙;庫欣綜合征;嗜酸性巨細胞包涵體疾病(CIBD);巨細胞病毒感染;舞眼舞腳綜合征(dancing eyes-dancing feet綜合征);丹-沃二氏綜合征;道森病;德摩西埃綜合征;Dejerine-Klumpke麻痹;癡呆;皮肌炎;糖尿病神經病變;彌漫性硬化;自主神經機能異常;書寫困難;誦讀困難;張力失調;早期幼兒癲癇性腦?。豢盏熬C合征;腦炎;腦疝;腦三叉神經血管瘤?。话d癇;歐勃麻痹(Erb’s palsy);特發(fā)性震顫;法布里?。环柺暇C合征(Fahr’s syndrome);昏厥;家族性痙攣性癱瘓;發(fā)熱性驚厥;菲希爾綜合征;弗里德賴希共濟失調;額顳癡呆和其他“Tau病變”;戈謝?。桓袼固芈C合征;巨細胞動脈炎;巨細胞包涵體?。磺驑蛹毎X白質營養(yǎng)不良;格-巴二氏綜合征;HTLV-1相關性脊髓病;哈-斯二氏病(Hallervorden-Spatz disease);頭部損傷;頭痛;半面痙攣;遺傳性痙攣性截癱;遺傳病性多神經炎樣共濟失調(heredopathia atactica polyneuritiformi);耳部帶狀皰疹;帶狀皰疹;平山綜合征(Hirayama綜合征);HIV-相關性癡呆和神經病(也參見AIDS的神經性表現);前腦無裂畸形;亨廷頓舞蹈病和其他多聚谷氨酰胺病;積水性無腦畸形;腦積水;皮質醇增多癥;缺氧;免疫介導的腦脊髓炎;包涵體肌炎;色素失調癥;嬰兒植酸貯積??;嬰兒雷弗蘇姆??;嬰兒痙攣癥;炎癥性肌??;顱內囊腫;顱內高壓;朱伯綜合征;卡恩斯-塞爾綜合征;肯尼迪病;舞蹈眼綜合征;克-費二氏綜合征;克拉伯??;庫-韋病(Kugelberg-Welander disease);庫魯??;拉福拉??;朗-愛二氏肌無力綜合征;Landau-Kleffner綜合征;外側髓質(Wallenberg)綜合征;學習失能;利氏??;Lennox-Gastaut綜合征;萊-萘二氏綜合征;腦白質營養(yǎng)不良癥;路易體癡呆;無腦回;閉鎖綜合癥;Lou Gehrig氏病(也稱為運動神經元疾病或肌萎縮側索硬化);椎間盤病變;萊姆病-神經系統后遺癥;馬查多-約瑟夫??;腦肥大;巨腦;邁-羅二氏綜合征;梅尼埃??;腦膜炎;門克斯??;異染性腦白質營養(yǎng)不良癥;小頭畸型;偏頭痛;米勒菲希爾綜合征;小中風;線粒體肌病(mitochondrial myopathie);墨比烏斯綜合征;單肢肌肉萎縮;運動神經元疾??;煙霧??;粘多糖病;多發(fā)梗塞性癡呆;多灶性運動神經??;多發(fā)性硬化和其他脫髓鞘疾??;多系統萎縮伴體位性低血壓;肌營養(yǎng)不良;重癥肌無力;脫髓鞘彌漫性硬化(myelinoclastic diffuse sclerosis);嬰兒肌陣攣性腦??;肌陣攣;肌??;先天性肌強直;發(fā)作性睡??;神經纖維瘤??;神經阻滯劑惡性綜合征;艾滋病的神經性表現;狼瘡的神經后遺癥;神經性肌強直;神經元蠟樣脂褐質沉積癥;神經元移行障礙;尼曼-皮克二氏?。籓’Sullivan-McLeod綜合征;枕神經痛;隱性脊柱神經管閉合不全序列征;大田原綜合征;橄欖體腦橋小腦萎縮;斜視性眼陣攣-肌陣攣;視神經炎(opticneuriti);體位性低血壓;過度使用綜合征;感覺異常;帕金森?。幌忍煨愿奔娭?;副腫瘤??;陣發(fā)性發(fā)作;帕-羅二氏綜合征;佩-梅二氏??;周期性癱瘓;周圍神經??;疼痛性神經病和神經性疼痛;持續(xù)性植物人狀態(tài);綜合性精神發(fā)育障礙;感光性噴嚏反射;植烷酸貯積病;皮克病;神經挾捏;垂體瘤;多肌炎;腦穿通畸形;小兒麻痹癥后期綜合征;帶狀皰疹后神經痛(PHN);感染后腦脊髓炎;體位性低血壓;帕-魏二氏綜合征;原發(fā)性側索硬化;朊病毒??;進行性單側面萎縮;進行性多灶性腦白質病;進行性硬化性灰質萎縮;進行性核上麻痹;假腦瘤;拉姆齊·亨特綜合征(I型和II型);Rasmussen腦炎;反射性交感神經營養(yǎng)不良綜合征;雷夫敘姆??;重復性運動障礙;重復性應激損傷;不寧腿綜合征;逆轉錄病毒相關性脊髓?。籖ett綜合征;Reye綜合征;舞蹈??;桑德霍夫?。恢x爾德?。荒X裂;透明隔-視神經發(fā)育不良;驚嚇嬰兒綜合征;帶狀皰疹;夏伊-德雷格綜合征;干燥綜合征;睡眠呼吸暫停;索托綜合征;痙攣狀態(tài);脊柱裂;脊髓損傷;脊髓腫瘤;脊髓性肌萎縮;僵人綜合征;中風;斯特奇-韋伯二氏綜合征;亞急性硬化性全腦炎;蛛網膜下腔出血;皮層下動脈硬化性腦??;西德納姆舞蹈病;暈厥(syncope);脊髓空洞癥;遲發(fā)性運動障礙;泰-薩克斯病;顳動脈炎;脊髓栓系綜合征;湯姆森病;胸廓出口綜合征;三叉神經痛;Todd癱瘓;Tourette綜合征;短暫性腦缺血發(fā)作;傳染性海綿狀腦??;橫貫性脊髓炎(transverse myeliti);創(chuàng)傷性腦損傷;震顫;三叉神經痛;脊髓栓系綜合征;結節(jié)性硬化;血管性癡呆(多梗塞性癡呆);血管炎,包括顳動脈炎;希-林二氏病(VHL);瓦倫貝格綜合征;Werdnig-Hoffman?。籛est綜合征;急性頸部扭傷;威廉斯綜合征;Wilson??;和Zellweger綜合征。
術語“代謝病”是指涉及碳水合物、脂質、蛋白、核酸或其組合的正常代謝的改變的任何病癥。代謝病與代謝途徑中的缺乏或過量有關,導致核酸、蛋白、脂質和/或碳水合物的代謝失衡。影響代謝的因素包括和不限于,內分泌(激素)控制系統(例如,胰島素途徑、腸內分泌激素,包括GLP-1、PYY等)、神經控制系統(例如,腦中的GLP-1)等。代謝病的實例包括,但不限于,糖尿病(例如,I型糖尿病、II型糖尿病、妊娠糖尿病)、高血糖癥、超高胰島素血癥、胰島素抗性和肥胖癥。
“激酶”一類從高能供體分子(例如ATP)轉移磷酸酯基團至特異性底物(稱為磷酸化)的酶。激酶是磷酸轉移酶大家族的一部分。最大的激酶組之一為蛋白激酶,其作用于和修飾特異性蛋白的活性。激酶在細胞中廣泛用于傳遞信號和控制復雜過程。多種其他激酶作用于小分子,例如脂質、碳水化合物、氨基酸和核苷酸,既用于信號傳導又將它們引向代謝途徑。激酶常常以它們的底物來命名。在人中已經鑒定了超過500種不同的蛋白激酶。這些示例性人蛋白激酶包括,但不限于,AAK1、ABL、ACK、ACTR2、ACTR2B、AKT1、AKT2、AKT3、ALK、ALK1、ALK2、ALK4、ALK7、AMPKa1、AMPKa2、ANKRD3、ANPa、ANPb、ARAF、ARAFps、ARG、AurA、AurAps1、AurAps2、AurB、AurBps1、AurC、AXL、BARK1、BARK2、BIKE、BLK、BMPR1A、BMPR1Aps1、BMPR1Aps2、BMPR1B、BMPR2、BMX、BRAF、BRAFps、BRK、BRSK1、BRSK2、BTK、BUB1、BUBR1、CaMK1a、CaMK1b、CaMK1d、CaMK1g、CaMK2a、CaMK2b、CaMK2d、CaMK2g、CaMK4、CaMKK1、CaMKK2、caMLCK、CASK、CCK4、CCRK、CDC2、CDC7、CDK10、CDK11、CDK2、CDK3、CDK4、CDK4ps、CDK5、CDK5ps、CDK6、CDK7、CDK7ps、CDK8、CDK8ps、CDK9、CDKL1、CDKL2、CDKL3、CDKL4、CDKL5、CGDps、CHED、CHK1、CHK2、CHK2ps1、CHK2ps2、CK1a、CK1a2、CK1aps1、CK1aps2、CK1aps3、CK1d、CK1e、CK1g1、CK1g2、CK1g2ps、CK1g3、CK2a1、CK2a1–rs、CK2a2、CLIK1、CLIK1L、CLK1、CLK2、CLK2ps、CLK3、CLK3ps、CLK4、COT、CRIK、CRK7、CSK、CTK、CYGD、CYGF、DAPK1、DAPK2、DAPK3、DCAMKL1、DCAMKL2、DCAMKL3、DDR1、DDR2、DLK、DMPK1、DMPK2、DRAK1、DRAK2、DYRK1A、DYRK1B、DYRK2、DYRK3、DYRK4、EGFR、EphA1、EphA10、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphB1、EphB2、EphB3、EphB4、EphB6、Erk1、Erk2、Erk3、Erk3ps1、Erk3ps2、Erk3ps3、Erk3ps4、Erk4、Erk5、Erk7、FAK、FER、FERps、FES、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FGR、FLT1、FLT1ps、FLT3、FLT4、FMS、FRK、Fused、FYN、GAK、GCK、GCN2、GCN22、GPRK4、GPRK5、GPRK6、GPRK6ps、GPRK7、GSK3A、GSK3B、Haspin、HCK、HER2/ErbB2、HER3/ErbB3、HER4/ErbB4、HH498、HIPK1、HIPK2、HIPK3、HIPK4、HPK1、HRI、HRIps、HSER、HUNK、ICK、IGF1R、IKKa、IKKb、IKKe、ILK、INSR、IRAK1、IRAK2、IRAK3、IRAK4、IRE1、IRE2、IRR、ITK、JAK1、JAK12、JAK2、JAK22、JAK3、JAK32、JNK1、JNK2、JNK3、KDR、KHS1、KHS2、KIS、KIT、KSGCps、KSR1、KSR2、LATS1、LATS2、LCK、LIMK1、LIMK2、LIMK2ps、LKB1、LMR1、LMR2、LMR3、LOK、LRRK1、LRRK2、LTK、LYN、LZK、MAK、MAP2K1、MAP2K1ps、MAP2K2、MAP2K2ps、MAP2K3、MAP2K4、MAP2K5、MAP2K6、MAP2K7、MAP3K1、MAP3K2、MAP3K3、MAP3K4、MAP3K5、MAP3K6、MAP3K7、MAP3K8、MAPKAPK2、MAPKAPK3、MAPKAPK5、MAPKAPKps1、MARK1、MARK2、MARK3、MARK4、MARKps01、MARKps02、MARKps03、MARKps04、MARKps05、MARKps07、MARKps08、MARKps09、MARKps10、MARKps11、MARKps12、MARKps13、MARKps15、MARKps16、MARKps17、MARKps18、MARKps19、MARKps20、MARKps21、MARKps22、MARKps23、MARKps24、MARKps25、MARKps26、MARKps27、MARKps28、MARKps29、MARKps30、MAST1、MAST2、MAST3、MAST4、MASTL、MELK、MER、MET、MISR2、MLK1、MLK2、MLK3、MLK4、MLKL、MNK1、MNK1ps、MNK2、MOK、MOS、MPSK1、MPSK1ps、MRCKa、MRCKb、MRCKps、MSK1、MSK12、MSK2、MSK22、MSSK1、MST1、MST2、MST3、MST3ps、MST4、MUSK、MYO3A、MYO3B、MYT1、NDR1、NDR2、NEK1、NEK10、NEK11、NEK2、NEK2ps1、NEK2ps2、NEK2ps3、NEK3、NEK4、NEK4ps、NEK5、NEK6、NEK7、NEK8、NEK9、NIK、NIM1、NLK、NRBP1、NRBP2、NuaK1、NuaK2、Obscn、Obscn2、OSR1、p38a、p38b、p38d、p38g、p70S6K、p70S6Kb、p70S6Kps1、p70S6Kps2、PAK1、PAK2、PAK2ps、PAK3、PAK4、PAK5、PAK6、PASK、PBK、PCTAIRE1、PCTAIRE2、PCTAIRE3、PDGFRa、PDGFRb、PDK1、PEK、PFTAIRE1、PFTAIRE2、PHKg1、PHKg1ps1、PHKg1ps2、PHKg1ps3、PHKg2、PIK3R4、PIM1、PIM2、PIM3、PINK1、PITSLRE、PKACa、PKACb、PKACg、PKCa、PKCb、PKCd、PKCe、PKCg、PKCh、PKCi、PKCips、PKCt、PKCz、PKD1、PKD2、PKD3、PKG1、PKG2、PKN1、PKN2、PKN3、PKR、PLK1、PLK1ps1、PLK1ps2、PLK2、PLK3、PLK4、PRKX、PRKXps、PRKY、PRP4、PRP4ps、PRPK、PSKH1、PSKH1ps、PSKH2、PYK2、QIK、QSK、RAF1、RAF1ps、RET、RHOK、RIPK1、RIPK2、RIPK3、RNAseL、ROCK1、ROCK2、RON、ROR1、ROR2、ROS、RSK1、RSK12、RSK2、RSK22、RSK3、RSK32、RSK4、RSK42、RSKL1、RSKL2、RYK、RYKps、SAKps、SBK、SCYL1、SCYL2、SCYL2ps、SCYL3、SGK、SgK050ps、SgK069、SgK071、SgK085、SgK110、SgK196、SGK2、SgK223、SgK269、SgK288、SGK3、SgK307、SgK384ps、SgK396、SgK424、SgK493、SgK494、SgK495、SgK496、SIK、skMLCK、SLK、Slob、smMLCK、SNRK、SPEG、SPEG2、SRC、SRM、SRPK1、SRPK2、SRPK2ps、SSTK、STK33、STK33ps、STLK3、STLK5、STLK6、STLK6ps1、STLK6–rs、SuRTK106、SYK、TAK1、TAO1、TAO2、TAO3、TBCK、TBK1、TEC、TESK1、TESK2、TGFbR1、TGFbR2、TIE1、TIE2、TLK1、TLK1ps、TLK2、TLK2ps1、TLK2ps2、TNK1、Trad、Trb1、Trb2、Trb3、Trio、TRKA、TRKB、TRKC、TSSK1、TSSK2、TSSK3、TSSK4、TSSKps1、TSSKps2、TTBK1、TTBK2、TTK、TTN、TXK、TYK2、TYK22、TYRO3、TYRO3ps、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、VACAMKL、VRK1、VRK2、VRK3、VRK3ps、Wee1、Wee1B、Wee1Bps、Wee1ps1、Wee1ps2、Wnk1、Wnk2、Wnk3、Wnk4、YANK1、YANK2、YANK3、YES、YESps、YSK1、ZAK、ZAP70、ZC1/HGK、ZC2/TNIK、ZC3/MINK、ZC4/NRK。
發(fā)明的具體實施方式
最近,已經報道了化合物為溴結構域結合劑,例如,國際PCT出版物WO 2012/075383、WO 2011/054553、WO 2011/054841、WO 2011/054844、WO 2011/054845、WO 2011/054846、WO 2011/054848、WO 2011/143669和WO 2011/161031。此外,日本專利申請公布JP 2008/156311公開了苯并咪唑衍生物,其為BRD2溴結構域結合劑,并且其被發(fā)現用于治療病毒感染和抑制病毒復制。國際PCT公布WO 2009/084693公開了一系列噻吩并三唑并氮雜環(huán)庚三烯衍生物,其抑制乙?;慕M蛋白和含溴結構域蛋白之間的結合,其可用作抗癌藥物。國際PCT公布WO 2011/054843暗示了抑制溴結構域和其同源的乙?;牡鞍捉Y合的化合物,可用于治療自身免疫性和炎性疾病。然而,仍然對更多有效和安全的溴結構域結合劑存在需求。
本發(fā)明提供了式(I)化合物,其為溴結構域和/或含溴結構域蛋白的結合劑。本發(fā)明化合物可以結合在溴結構域(例如,含溴結構域蛋白的溴結構域)的口袋。不期望受任何具體理論的限制,本發(fā)明化合物可以通過模擬第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;馁嚢彼釟埢弯褰Y構域的結合口袋之間的接觸而結合在所述口袋。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物結合在溴結構域的口袋。本發(fā)明化合物還可以調節(jié)(例如,抑制)溴結構域和/或含溴結構域蛋白的活性。本發(fā)明還提供了可用于調節(jié)(例如,抑制)含溴結構域蛋白(例如,轉錄因子)的活性的藥物組合物、方法、用途和試劑盒。所述化合物、藥物組合物、方法、用途和試劑盒可用于治療和/或預防與溴結構域有關的疾病、與含溴結構域蛋白有關的疾病、與溴結構域的活性(例如,異?;钚?有關的疾病,以及與含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚?有關的疾病??捎帽景l(fā)明化合物預防和/或治療的示例性疾病包括增殖性疾病(例如,癌癥、良性腫瘤、病理性血管發(fā)生、炎性疾病和自身免疫性疾病)、自身免疫性疾病、心血管疾病、病毒感染、纖維化疾病、神經性疾病、代謝疾病、內分泌疾病和輻射中毒。所述化合物、藥物組合物、方法、用途和試劑盒還可以用于男性避孕和用于抑制和/或治療病毒感染(例如,通過抑制病毒的復制、通過殺死病毒)。
化合物
在一個方面,本發(fā)明提供了式(I)化合物:
及其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物和前藥,其中:
RA為氫、取代或未取代的?;?、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基或取代或未取代的雜芳基;
RB為氫、取代或未取代的?;⑷〈蛭慈〈耐榛?、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基或取代或未取代的雜芳基;
或RA和RB一起形成取代或未取代的碳環(huán)或取代或未取代的雜環(huán);
RC為氫、取代或未取代的C1-6烷基或氮保護基團;
RD在每種情況下獨立地為鹵素、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的雜芳基、–ORa、–N(Ra)2、–SRa、–CN、–SCN、–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa、–C(=NRa)N(Ra)2、–C(=O)Ra、–C(=O)ORa、–C(=O)N(Ra)2、–NO2、–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa、–NRaC(=O)N(Ra)2、–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2;
Ra在每種情況下獨立地為氫、取代或未取代的?;⑷〈蛭慈〈耐榛?、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的雜芳基、連接至氮原子的氮保護基團、連接至氧原子的氧保護基團或連接至硫原子的硫保護基團或兩個Ra基團一起形成取代或未取代的雜環(huán)或取代或未取代的雜芳環(huán);
m為0、1、2、3或4;
X為–O–、–S–、–N(RX1)–或–C(RX2)2–,其中RX1為氫、取代或未取代的C1-6烷基或氮保護基團和其中RX2在每種情況下獨立地為氫、鹵素或取代或未取代的C1-6烷基;
RE為氫、鹵素、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的雜芳基、–ORa、–N(Ra)2、–SRa、–CN、–SCN、–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa、–C(=NRa)N(Ra)2、–C(=O)Ra、–C(=O)ORa、–C(=O)N(Ra)2、–NO2、–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa、–NRaC(=O)N(Ra)2、–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2;
RF為氫、取代或未取代的C1-6烷基或氮保護基團;
RG為氫、取代或未取代的烷基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的苯基或氮保護基團;
RH在每種情況下獨立地為鹵素、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的碳環(huán)基、取代或未取代的雜環(huán)基、取代或未取代的芳基、取代或未取代的雜芳基、–ORa、–N(Ra)2、–SRa、–CN、–SCN、–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa、–C(=NRa)N(Ra)2、–C(=O)Ra、–C(=O)ORa、–C(=O)N(Ra)2、–NO2、–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa、–NRaC(=O)N(Ra)2、–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2;和
n為0、1、2、3或4。
式(I)包括在酰肼部分上的取代基RA。在一些實施方案中,RA為H。在一些實施方案中,RA不為H。在一些實施方案中,RA為取代的?;?。在一些實施方案中,RA為未取代的?;T谝恍嵤┓桨钢?,RA為乙酰基。在一些實施方案中,RA為–C(=O)Ra(例如,–C(=O)(取代或未取代的烷基))。在一些實施方案中,RA為–C(=O)ORa(例如,–C(=O)O(取代或未取代的烷基)或–C(=O)OH)。在一些實施方案中,RA為–C(=O)N(Ra)2,(例如,–C(=O)NH2、–C(=O)NH(取代或未取代的烷基)或–C(=O)N(取代或未取代的烷基)2)。在一些實施方案中,RA為未取代的烷基。在一些實施方案中,RA為取代的烷基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-12烷基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-12烷基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RA為被至少一個鹵素取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RA為–CH3。在一些實施方案中,RA為取代的甲基。在一些實施方案中,RA為–CH2F、–CHF2、–CF3、全氟乙基、全氟丙基或全氟丁基。在一些實施方案中,RA為乙基。在一些實施方案中,RA為丙基。在一些實施方案中,RA為丁基。在一些實施方案中,RA為戊基。在一些實施方案中,RA為己基。在一些實施方案中,RA為Bn。在一些實施方案中,RA為未取代的烯基。在一些實施方案中,RA為取代的烯基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-12烯基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-12烯基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-6烯基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-6烯基。在一些實施方案中,RA為未取代的炔基。在一些實施方案中,RA為取代的炔基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-12炔基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-12炔基。在一些實施方案中,RA為未取代的C1-6炔基。在一些實施方案中,RA為取代的C1-6炔基。在一些實施方案中,RA為取代碳環(huán)基。在一些實施方案中,RA為未取代碳環(huán)基。在一些實施方案中,RA為飽和碳環(huán)基。在一些實施方案中,RA為不飽和碳環(huán)基。在一些實施方案中,RA為3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵。在一些實施方案中,RA為5-至14-元雙環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵。在一些實施方案中,RA為5-至20-元三環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3、4或5個雙鍵。在一些實施方案中,RA為5-至26-元四環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3、4、5或6個雙鍵。在一些實施方案中,RA為取代的雜環(huán)基。在一些實施方案中,RA為未取代的雜環(huán)基。在一些實施方案中,RA為飽和雜環(huán)基。在一些實施方案中,RA為不飽和雜環(huán)基。在一些實施方案中,RA為3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA為5-至14-元雙環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA為5-至20-元三環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3、4或5個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA為取代的芳基。在一些實施方案中,RA為未取代的芳基。在一些實施方案中,RA為6-至14-元芳基。在一些實施方案中,RA為6-至10-元芳基。在一些實施方案中,RA為取代的苯基。在一些實施方案中,RA為未取代的苯基。在一些實施方案中,RA為取代的萘基。在一些實施方案中,RA為未取代的萘基。在一些實施方案中,RA為取代的雜芳基。在一些實施方案中,RA為未取代的雜芳基。在一些實施方案中,RA為5-至6-元單環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA為8-至10-元雙環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA為表1中所述的部分。在一些實施方案中,RA為表2中所述的部分。
各RA、RB、RD、RE和RH部分可獨立地包含一個或多個取代基Ra。在一些實施方案中,Ra的所有實例均相同。在一些實施方案中,Ra的兩個實例彼此不同。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為H。在一些實施方案中,Ra在每種情況下為H。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的?;?例如,乙?;?。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的烷基(例如,取代或未取代的C1-6烷基)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為–CH3。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的烯基(例如,取代或未取代的C1-6烯基)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的炔基(例如,取代或未取代的C1-6炔基)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的碳環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵;或取代或未取代的5-至14-元雙環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的雜環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫;或取代或未取代的5-至14-元雙環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的芳基(例如,取代或未取代的,6-至10-元芳基)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的苯基。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為取代或未取代的雜芳基(例如,取代或未取代的5-至6-元單環(huán)雜芳基或取代或未取代的8-至10-元雙環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,Ra的至少一個實例為連接至氮原子的氮保護基團(例如,Bn、Boc、Cbz、Fmoc、三氟乙?;?、三苯基甲基、乙?;騎s)。在一些實施方案中,Ra為連接至氧原子的氧保護基團(例如,甲硅烷基、TBDPS、TBDMS、TIPS、TES、TMS、MOM、THP、t-Bu、Bn、烯丙基、乙?;?、特戊?;虮郊柞;?。在一些實施方案中,Ra為連接至硫原子的硫保護基團(例如,乙酰胺基甲基、t-Bu、3-硝基-2-吡啶硫基、2-吡啶-硫基或三苯基甲基)。在一些實施方案中,Ra的兩個實例一起形成取代或未取代的雜環(huán)(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)雜環(huán),其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,Ra的兩個實例一起形成取代或未取代的雜芳環(huán)(例如,取代或未取代的5-至6-元單環(huán)雜芳環(huán),其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。
式(I)包含在酰肼部分上的取代基RB。在一些實施方案中,RB為H。在一些實施方案中,RB不為H。在一些實施方案中,RB為取代的?;T谝恍嵤┓桨钢校琑B為未取代的?;?。在一些實施方案中,RB為乙?;T谝恍嵤┓桨钢?,RB為–C(=O)Ra(例如,–C(=O)(取代或未取代的烷基))。在一些實施方案中,RB為–C(=O)ORa(例如,–C(=O)O(取代或未取代的烷基)或–C(=O)OH)。在一些實施方案中,RB為–C(=O)N(Ra)2,(例如,–C(=O)NH2、–C(=O)NH(取代或未取代的烷基)或–C(=O)N(取代或未取代的烷基)2)。在一些實施方案中,RB為未取代的烷基。在一些實施方案中,RB為取代的烷基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-12烷基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-12烷基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RB為被至少一個鹵素取代的C1-6烷基。在一些實施方案中,RB為–CH3。在一些實施方案中,RB為取代的甲基。在一些實施方案中,RB為–CH2F、–CHF2、–CF3、全氟乙基、全氟丙基或全氟丁基。在一些實施方案中,RB為乙基。在一些實施方案中,RB為丙基。在一些實施方案中,RB為丁基。在一些實施方案中,RB為戊基。在一些實施方案中,RB為己基。在一些實施方案中,RB為Bn。在一些實施方案中,RB為未取代的烯基。在一些實施方案中,RB為取代的烯基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-12烯基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-12烯基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-6烯基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-6烯基。在一些實施方案中,RB為未取代的炔基。在一些實施方案中,RB為取代的炔基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-12炔基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-12炔基。在一些實施方案中,RB為未取代的C1-6炔基。在一些實施方案中,RB為取代的C1-6炔基。在一些實施方案中,RB為取代碳環(huán)基。在一些實施方案中,RB為未取代碳環(huán)基。在一些實施方案中,RB為飽和碳環(huán)基。在一些實施方案中,RB為不飽和碳環(huán)基。在一些實施方案中,RB為3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵。在一些實施方案中,RB為5-至14-元雙環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵。在一些實施方案中,RB為5-至20-元三環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3、4或5個雙鍵。在一些實施方案中,RB為5-至26-元四環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3、4、5或6個雙鍵。在一些實施方案中,RB為取代的雜環(huán)基。在一些實施方案中,RB為未取代的雜環(huán)基。在一些實施方案中,RB為飽和雜環(huán)基。在一些實施方案中,RB為不飽和雜環(huán)基。在一些實施方案中,RB為3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RB為5-至14-元雙環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RB為5-至20-元三環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3、4或5個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RB為取代的芳基。在一些實施方案中,RB為未取代的芳基。在一些實施方案中,RB為6-至14-元芳基。在一些實施方案中,RB為6-至10-元芳基。在一些實施方案中,RB為取代的苯基。在一些實施方案中,RB為未取代的苯基。在一些實施方案中,RB為取代的萘基。在一些實施方案中,RB為未取代的萘基。在一些實施方案中,RB為取代的雜芳基。在一些實施方案中,RB為未取代的雜芳基。在一些實施方案中,RB為5-至6-元單環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RB為8-至10-元雙環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RB為表1中所述的部分。在一些實施方案中,RB為表2中所述的部分。
在一些實施方案中,RA和RB均相同。在一些實施方案中,RA和RB彼此不同。在一些實施方案中,RA為H和RB不為H。在一些實施方案中,RA不為H和RB為H。在一些實施方案中,RA不為H和RB不為H。在一些實施方案中,RA和RB一起形成取代或未取代的飽和或不飽和的碳環(huán)。在一些實施方案中,RA和RB一起形成3-至8-元單環(huán)碳環(huán),其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵。在一些實施方案中,RA和RB一起形成5-至14-元雙環(huán)碳環(huán),其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3或4個雙鍵。在一些實施方案中,RA和RB一起形成5-至20-元三環(huán)碳環(huán),其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2、3、4或5個雙鍵。
在一些實施方案中,RA和RB一起形成取代或未取代的,飽和或不飽和的雜環(huán)。在一些實施方案中,RA和RB一起形成3-至8-元單環(huán)雜環(huán),其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA和RB一起形成5-至14-元雙環(huán)雜環(huán),其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA和RB一起形成5-至20-元三環(huán)雜環(huán),其在該雜環(huán)系統中任選包含1、2、3、4或5個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2、3、4或5個原子獨立地為氮、氧或硫。在一些實施方案中,RA和RB一起形成表3所示部分。
式(I)包含在氮原子上的取代基RC。在一些實施方案中,RC為H。在一些實施方案中,RC為取代或未取代的C1-6烷基(例如,–CH3、–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn)。在一些實施方案中,RC為氮保護基團(例如,Bn、Boc、Cbz、Fmoc、三氟乙?;⑷交谆?、乙酰基或Ts)。
式(I)可包含在苯環(huán)上的一個或多個取代基RD。在一些實施方案中,RD的所有實例均相同。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為鹵素(例如,F、Cl、Br或I)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的烷基(例如,取代或未取代的C1-6烷基)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–CH3。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的烯基(例如,取代或未取代的C1-6烯基)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的炔基(例如,取代或未取代的C1-6炔基)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的碳環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的雜環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的芳基(例如,取代或未取代的,6-至10-元芳基)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的苯基。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為取代或未取代的雜芳基(例如,取代或未取代的5-至6-元單環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–ORa(例如,–OH、–O(取代或未取代的烷基)(例如,–OMe、–OEt、–OPr、–OBu或–OBn)或–O(取代或未取代的苯基)(例如,–OPh))。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–SRa(例如,–SH、–S(取代或未取代的烷基)(例如,–SMe、–Set、–SPr、–SBu或–SBn)或–S(取代或未取代的苯基)(例如,–SPh))。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–N(Ra)2(例如,–NH2、–NH(取代或未取代的烷基)(例如,–NHMe)或–N(取代或未取代的烷基)2(例如,–NMe2))。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–CN、–SCN或–NO2。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa或–C(=NRa)N(Ra)2。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–C(=O)Ra(例如,–C(=O)(取代或未取代的烷基))。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–C(=O)ORa(例如,–C(=O)O(取代或未取代的烷基)或–C(=O)OH)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–C(=O)N(Ra)2,(例如,–C(=O)NH2、–C(=O)NH(取代或未取代的烷基)或–C(=O)N(取代或未取代的烷基)2)。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa或–NRaC(=O)N(Ra)2。在一些實施方案中,RD的至少一個實例為–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2。
在一些實施方案中,m為0。在一些實施方案中,m為1。在一些實施方案中,m為2。在一些實施方案中,m為3。在一些實施方案中,m為4。
式(I)包含二價部分X。在一些實施方案中,X為–O–。在一些實施方案中,X為–S–。在一些實施方案中,X為–N(RX1)–。在一些實施方案中,X為–NH–。在一些實施方案中,X為–N(取代或未取代的C1-6烷基)–(例如,–NMe–)。在一些實施方案中,X為–C(RX2)2–。在一些實施方案中,X為–CH(RX2)–。在一些實施方案中,X為–CH2–。在一些實施方案中,X為–CF2–。
在一些實施方案中,RX1為H。在一些實施方案中,RX1為取代或未取代的C1-6烷基(例如,–CH3、–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn)。在一些實施方案中,RX1為氮保護基團(例如,Bn、Boc、Cbz、Fmoc、三氟乙酰基、三苯基甲基、乙?;騎s)。
在一些實施方案中,RX2的兩個實例均相同。在一些實施方案中,RX2的兩個實例彼此不同。在一些實施方案中,RX2的至少一個實例為H。在一些實施方案中,RX2在每種情況下為H。在一些實施方案中,RX2的至少一個實例為鹵素(例如,F、Cl、Br或I)。在一些實施方案中,RX2的至少一個實例為取代或未取代的C1-6烷基(例如,–CH3、–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn)。
式(I)在嘧啶環(huán)上包含取代基RE。在一些實施方案中,RE為H。在一些實施方案中,RE為鹵素(例如,F、Cl、Br或I)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的烷基(例如,取代或未取代的C1-6烷基)。在一些實施方案中,RE為–CH3。在一些實施方案中,RE為–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的烯基(例如,取代或未取代的C1-6烯基)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的炔基(例如,取代或未取代的C1-6炔基)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的碳環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的雜環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的芳基(例如,取代或未取代的,6-至10-元芳基)。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的苯基。在一些實施方案中,RE為取代或未取代的雜芳基(例如,取代或未取代的5-至6-元單環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RE為–ORa(例如,–OH、–O(取代或未取代的烷基)(例如,–OMe、–OEt、–OPr、–OBu或–OBn)或–O(取代或未取代的苯基)(例如,–OPh))。在一些實施方案中,RE為–SRa(例如,–SH、–S(取代或未取代的烷基)(例如,–SMe、–Set、–SPr、–SBu或–SBn)或–S(取代或未取代的苯基)(例如,–SPh))。在一些實施方案中,RE為–N(Ra)2(例如,–NH2、–NH(取代或未取代的烷基)(例如,–NHMe)或–N(取代或未取代的烷基)2(例如,–NMe2))。在一些實施方案中,RE為–CN、–SCN或–NO2。在一些實施方案中,RE為–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa或–C(=NRa)N(Ra)2。在一些實施方案中,RE為–C(=O)Ra(例如,–C(=O)(取代或未取代的烷基))。在一些實施方案中,RE為–C(=O)ORa(例如,–C(=O)O(取代或未取代的烷基)或–C(=O)OH)。在一些實施方案中,RE為–C(=O)N(Ra)2,(例如,–C(=O)NH2、–C(=O)NH(取代或未取代的烷基)或–C(=O)N(取代或未取代的烷基)2)。在一些實施方案中,RE為–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa或–NRaC(=O)N(Ra)2。在一些實施方案中,RE為–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2。
式(I)在氮原子上包含取代基RF。在一些實施方案中,RF為H。在一些實施方案中,RF為取代或未取代的C1-6烷基(例如,–CH3、–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn)。在一些實施方案中,RF為氮保護基團(例如,Bn、Boc、Cbz、Fmoc、三氟乙?;?、三苯基甲基、乙?;騎s)。
式(I)在氮原子上包含取代基RG。在一些實施方案中,RG為H。在一些實施方案中,RG為取代或未取代的烷基。在一些實施方案中,RG為取代或未取代的C1-6烷基(例如,–CH3、–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基或全氟丁基)。在一些實施方案中,RG為取代或未取代的碳環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵)。在一些實施方案中,RG為取代或未取代的苯基。在一些實施方案中,RG為氮保護基團(例如,Bn、Boc、Cbz、Fmoc、三氟乙?;?、三苯基甲基、乙?;騎s)。
在一些實施方案中,RF為未取代的C1-6烷基(例如,–CH3)和RG為未取代的C1-6烷基(例如,–CH3)。
式(I)可在苯環(huán)上包含一個或多個取代基RH。在一些實施方案中,RH的所有實例均相同。在一些實施方案中,RH的至少兩個實例不同。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為鹵素(例如,F、Cl、Br或I)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的烷基(例如,取代或未取代的C1-6烷基)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–CH3。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–CF3、未取代的乙基、全氟乙基、未取代的丙基、全氟丙基、未取代的丁基、全氟丁基或Bn。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的烯基(例如,取代或未取代的C1-6烯基)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的炔基(例如,取代或未取代的C1-6炔基)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的碳環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)碳環(huán)基,其在該碳環(huán)系統中任選包含1、2或3個雙鍵)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的雜環(huán)基(例如,取代或未取代的3-至8-元單環(huán)雜環(huán)基,其在該雜環(huán)系統中任選包含1或2個雙鍵,其中在該雜環(huán)系統中的1、2或3個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的芳基(例如,取代或未取代的,6-至10-元芳基)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的苯基。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為取代或未取代的雜芳基(例如,取代或未取代的5-至6-元單環(huán)雜芳基,其中在該雜芳環(huán)系統中的1、2、3或4個原子獨立地為氮、氧或硫)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–ORa(例如,–OH、–O(取代或未取代的烷基)(例如,–OMe、–OEt、–OPr、–OBu或–OBn)或–O(取代或未取代的苯基)(例如,–OPh))。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–SRa(例如,–SH、–S(取代或未取代的烷基)(例如,–SMe、–Set、–SPr、–SBu或–SBn)或–S(取代或未取代的苯基)(例如,–SPh))。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–N(Ra)2(例如,–NH2、–NH(取代或未取代的烷基)(例如,–NHMe)或–N(取代或未取代的烷基)2(例如,–NMe2))。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–CN、–SCN或–NO2。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–C(=NRa)Ra、–C(=NRa)ORa或–C(=NRa)N(Ra)2。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–C(=O)Ra(例如,–C(=O)(取代或未取代的烷基))。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–C(=O)ORa(例如,–C(=O)O(取代或未取代的烷基)或–C(=O)OH)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–C(=O)N(Ra)2,(例如,–C(=O)NH2、–C(=O)NH(取代或未取代的烷基)或–C(=O)N(取代或未取代的烷基)2)。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–NRaC(=O)Ra、–NRaC(=O)ORa或–NRaC(=O)N(Ra)2。在一些實施方案中,RH的至少一個實例為–OC(=O)Ra、–OC(=O)ORa或–OC(=O)N(Ra)2。
在一些實施方案中,n為0。在一些實施方案中,n為1。在一些實施方案中,n為2。在一些實施方案中,n為3。在一些實施方案中,n為4。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,式(I)化合物為如表1所示的化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。在一些實施方案中,式(I)化合物為表2所示的化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。在一些實施方案中,式(I)化合物為表3所示的化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
表1.示例性的式(I)化合物。
在一些實施方案中,表1所示化合物為下式:或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,表1所示化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,表1所示化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
表2.示例性的式(I)化合物。
表3.示例性的式(I)化合物。
在一些實施方案中,表2或3所示的化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,表2或3所示的化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,表2或3所示的化合物為下式:
或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。
在一些實施方案中,本發(fā)明化合物為式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物為式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽。
已發(fā)現本發(fā)明化合物結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物結合含溴結構域蛋白。不期望受任何具體理論的限制,認為本發(fā)明化合物結合至含溴結構域蛋白的溴結構域的口袋中。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物通過模擬第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基和溴結構域的結合口袋之間的接觸結合至所述溴結構域的結合口袋中。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物結合至溴結構域的結合口袋中。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物共價結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物非-共價結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物可逆地結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物非-可逆地結合含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物抑制含溴結構域蛋白的活性(例如異常的活性、增強的活性)。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物抑制溴結構域的活性(例如異常的活性、增強的活性)。在一些實施方案中,所述溴結構域的活性為溴結構域結合乙?;馁嚢彼釟埢?例如,組蛋白N-末端尾部上的乙酰基化的賴氨酸殘基)的能力,所述殘基可為另一蛋白或肽的一部分。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物特異性結合含溴結構域蛋白(例如,以比不同的含溴結構域蛋白和/或不是含溴結構域蛋白的蛋白更強的結合親和性結合含溴結構域蛋白)。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物特異性結合含溴結構域蛋白的溴結構域(例如,以比含溴結構域蛋白的非溴結構域更強的結合親和性結合含溴結構域蛋白的溴結構域)。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物非-特異性結合含溴結構域蛋白(例如,結合含溴結構域蛋白的溴結構域)。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物減少轉錄延伸。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物破壞含溴結構域蛋白的亞細胞定位。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物減少染色質結合。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物通過減少蛋白(例如,組蛋白)結合至DNA來抑制染色質的形成。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物抑制組蛋白H4Kac肽與含溴結構域蛋白的溴結構域的結合。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物與含溴結構域蛋白的溴結構域中的進化保守的天冬酰胺形成一個或多個氫鍵。在一些實施方案中,所述天冬酰胺為BRD4(1)中的Asnl40和BRD2(2)中的Asn429。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白為BRD4或BRD2且所述天冬酰胺為BRD4(1)中的Asnl40和BRD2(2)中的Asn429。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物在細胞環(huán)境中競爭性結合染色質。因此預期本發(fā)明化合物可以用于治療與含溴結構域蛋白的活性有關的疾病(例如,增殖性疾病)。
本文所述化合物可結合含溴結構域蛋白且可抑制所述含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是溴和額外末端(BET)蛋白。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD2。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD2(1)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD2(2)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD3。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD3(1)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD3(2)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD4。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD4(1)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRD4(2)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRDT。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRDT(1)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是BRDT(2)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是TBP(TATA框結合蛋白)相關的因子蛋白(TAF)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是TAF1。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是TAF1L。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是CREB-結合蛋白(CBP)。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是E1A結合蛋白p300(EP300)。
本發(fā)明化合物與含溴結構域蛋白的結合親和力可如下測定:使用本領域已知的方法(例如,等溫滴定量熱法(ITC))確定本發(fā)明化合物和含溴結構域蛋白的加合物的解離常數(Kd)值。在一些實施方案中,該加合物包含本發(fā)明化合物和含溴結構域蛋白,其彼此結合(例如,共價或非共價結合)。在一些實施方案中,該加合物的Kd值最多約100μM、最多約30μM、最多約10μM、最多約3μM、最多約1μM、最多約300nM、最多約100nM、最多約30nM、最多約10nM、最多約3nM或最多約1nM。在一些實施方案中,該加合物的Kd值至少約1nM、至少約10nM、至少約100nM、至少約1μM、至少約10μM或至少約100μM。上述范圍的組合(例如,最多約10μM且至少約1nM)也在本發(fā)明的范圍內。其他范圍也是可能的。在一些實施方案中,該加合物的Kd值最多約10μM。在一些實施方案中,該加合物的Kd值最多約300nM。在一些實施方案中,該加合物的Kd值最多約100nM。
在一些實施方案中,本文所述含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明化合物抑制。含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明化合物的抑制可通過當本發(fā)明化合物或其藥物組合物與含溴結構域蛋白接觸時的本發(fā)明化合物的半數最大抑制濃度(IC50)值進行測定。在一些實施方案中,IC50值通過競爭性結合測試獲得。在一些實施方案中,IC50值通過本發(fā)明所述的方法獲得。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物的IC50值最多約1mM、最多約300μM、最多約100μM、最多約30μM、最多約10μM、最多約3μM、最多約1μM、最多約300nM、最多約100nM、最多約30nM、最多約10nM、最多約3nM或最多約1nM。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物的IC50值至少約1nM、至少約3nM、至少約10nM、至少約30nM、至少約100nM、至少約300nM、至少約1μM、至少約3μM、至少約10μM、至少約30μM、至少約100μM、至少約300μM或至少1mM。上述范圍的組合(例如,最多約300μM且至少約1μM)也在本發(fā)明的范圍內。其他范圍也是可能的。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物的IC50值最多約300μM。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物的IC50值最多約30μM。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物的IC50值最多約10μM。
本發(fā)明化合物可選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與不同的含溴結構域蛋白相比,本發(fā)明化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與不是含溴結構域蛋白的蛋白相比,本文所述化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與激酶(例如,本文所述的激酶)相比,本文所述化合物選擇性地抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與以下激酶相比,本發(fā)明化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性:MPS1(TTK)、ERK5(BMK1、MAPK7)、polo樣激酶(例如,polo樣激酶1、polo樣激酶2、polo樣激酶3、polo樣激酶4)、Ack1、Ack2、AbI、DCAMKL1、ABL1、AbI突變體、DCAMKL2、ARK5、BRK、MKNK2、FGFR4、TNK1、PLK1、ULK2、PLK4、PRKD1、PRKD2、PRKD3、ROS 1、RPS6KA6、TAOK1、TAOK3、TNK2、Bcr-Abl、GAK、cSrc、TPR-Met、Tie2、MET、FGFR3、Aurora、AxI、Bmx、BTK、c-kit、CHK2、Flt3、MST2、p70S6K、PDGFR、PKB、PKC、Raf、ROCK-H、Rsk1、SGK、TrkA、TrkB和/或TrkC。在一些實施方案中,與MAP激酶相比,本文所述化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與有絲分裂紡錘體激酶相比,本發(fā)明化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,與polo樣激酶相比,本發(fā)明化合物選擇性抑制含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制BET蛋白。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制BRD2。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制BRD3。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制BRD4。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制BRDT。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物選擇性抑制TAF蛋白(例如,TAF1或TAF1L)、CBP和/或EP300。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物為兩種或多種含溴結構域蛋白的非-選擇性抑制劑。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物為含溴結構域蛋白和不是含溴結構域蛋白的蛋白的非-選擇性抑制劑。
本發(fā)明化合物抑制含溴結構域蛋白的活性超越不同于含溴結構域蛋白的第二蛋白(例如,激酶)的選擇性可以通過用本發(fā)明化合物抑制第二蛋白的活性的IC50值與本發(fā)明化合物抑制含溴結構域蛋白的活性的IC50值的商值來測量。本發(fā)明化合物對于含溴結構域蛋白超越第二蛋白的選擇性還可以通過用本發(fā)明化合物和第二蛋白的加合物的Kd值與本發(fā)明化合物和含溴結構域蛋白的加合物的Kd值的商值來測量。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約1倍、至少大約3倍、至少大約5倍、至少大約10倍、至少大約30倍、至少大約100倍、至少大約300倍、至少大約1,000倍、至少大約3,000倍、至少大約10,000倍、至少大約30,000倍或至少大約100,000倍。在一些實施方案中,所述選擇性為最多大約100,000倍、最多大約10,000倍、最多大約1,000倍、最多大約100倍、最多大約10倍或最多大約1倍。上述范圍的組合(例如,至少大約2倍至最多大約10,000倍)也在本發(fā)明的范圍內。其他范圍也是可能的。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約3倍。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約10倍。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約50倍。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約100倍。在一些實施方案中,所述選擇性為至少大約1,000倍。
本領域已知含溴結構域蛋白涉及寬范圍的疾病。例如,BRD3和BRD4分別涉及BRD3NUT中線癌和BRD4NUT中線癌,BRDT涉及精子形成,和CBP涉及混合性白血病(MLL)。因此,本發(fā)明化合物可用于治療和/或預防與含溴結構域蛋白有關的疾病或作為男性避孕藥。
制備化合物的方法
本文所述化合物可使用本文所述的方法(例如,方案1中所示的方法)制備。
方案1.示例性的本文所述化合物的示例性合成
在另一方面,本發(fā)明還提供了制備本發(fā)明化合物的方法,該方法包括將式(A)的苯甲酰肼或其鹽與式(B)的醛或酮或其鹽反應,得到式(I)化合物或其鹽:
在另一方面,本發(fā)明還提供了制備本發(fā)明化合物的方法,所述方法包括:
將式(C)的苯甲酰肼或其鹽與式(B)的醛或酮或其鹽反應,得到式(D)的苯甲酰肼或其鹽;和
將式(D)的苯甲酰肼與式RC–Z的化合物在堿的存在下反應,得到式(I)化合物或其鹽,其中Z為離去基團:
藥物組合物、試劑盒和給藥
本發(fā)明提供了藥物組合物,其包含本發(fā)明化合物(例如,式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥)和任選地藥學上可接受的賦形劑。在一些實施方案中,本文所述藥物組合物包含式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽和任選地藥學上可接受的賦形劑。在一些實施方案中,本文所述藥物組合物包含式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽和藥學上可接受的賦形劑。
在一些實施方案中,本發(fā)明化合物以有效量提供于藥物組合物中。在一些實施方案中,所述有效量為治療有效量。在一些實施方案中,所述有效量為預防有效量。在一些實施方案中,所述有效量為在有此需要的受試者中有效治療和/或預防疾病(例如,本發(fā)明所述的疾病)的量。在一些實施方案中,所述有效量為在有此需要的受試者中有效治療疾病的量。在一些實施方案中,所述有效量為在有此需要的受試者中有效預防疾病的量。在一些實施方案中,所述有效量為在有此需要的受試者中有效降低出現疾病的風險的量。在一些實施方案中,所述有效量為在有此需要的受試者中有效用于男性避孕(例如,有效抑制精子形成)的量。在一些實施方案中,所述有效量為有效抑制病毒復制的量。在一些實施方案中,所述有效量為有效殺死病毒的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效抑制含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚裕缟叩幕钚?的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效抑制溴結構域的活性(例如,異?;钚裕缟叩幕钚?的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基結合的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效調節(jié)(例如,下調或抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的量。在一些實施方案中,所述有效量為有效誘導細胞凋亡的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者中有效誘導細胞凋亡的量。在一些實施方案中,所述有效量為在受試者或細胞中有效誘導G1阻滯的量。化合物的有效量可在以下范圍內變化:約0.001mg/kg至約1000mg/kg,每天或每若干天給藥一次或多次劑量(根據給藥方式)。在一些實施方案中,每劑量的有效量的變化范圍是約0.001mg/kg至約1000mg/kg、約0.01mg/kg至約750mg/kg、約0.1mg/kg至約500mg/kg、約1.0mg/kg至約250mg/kg,和約10.0mg/kg至約150mg/kg。
在一些實施方案中,所述有效量為有效抑制含溴結構域蛋白的活性、抑制溴結構域的活性、抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合、抑制轉錄延伸和/或抑制由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)、誘導或增加細胞凋亡或誘導或增強G1阻滯達以下程度的量:至少大約10%、至少大約20%、至少大約30%、至少大約40%、至少大約50%、至少大約60%、至少大約70%、至少大約80%、至少大約90%、至少大約95%或至少大約98%。在一些實施方案中,所述有效量為有效抑制含溴結構域蛋白的活性、抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合和/或抑制由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)達以下程度的量:最多大約90%、最多大約80%、最多大約70%、最多大約60%、最多大約50%、最多大約40%、最多大約30%、最多大約20%或最多大約10%。本發(fā)明所述的范圍的組合(例如,至少大約20%至最多大約50%)也在本發(fā)明的范圍內。在一些實施方案中,含溴結構域蛋白的活性、含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合和/或由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)被有效量的本發(fā)明化合物抑制達本發(fā)明所述的百分比或百分比范圍。
在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是受溴和額外末端蛋白(BET)調節(jié)的基因。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD2。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD2(1)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD2(2)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD3。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD3(1)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD3(2)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD4。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD4(1)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRD4(2)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRDT。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRDT(1)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是BRDT(2)。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是受TBP(TATA框結合蛋白)-相關因子蛋白(TAF)調節(jié)的基因。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是TAF1。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是TAF1L。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是受CREB-結合蛋白(CBP)調節(jié)的基因。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是受E1A結合蛋白p300(EP300)調節(jié)的基因。
本文所述藥物組合物可通過藥理學領域任何已知的方法制備。通常,這種制備方法包括以下步驟:將本文所述化合物(即,所述“活性成分”)與載體或賦形劑,和/或一種或多種其他助劑組合,然后,如果必須和/或需要,將該產物成型和/或包裝成所需的單-或多劑量單位。
藥物組合物可以單一單位劑量和/或多個單一單位劑量進行制備、包裝和/或散裝出售?!皢挝粍┝俊笔前A定量活性成分的藥物組合物的離散量(discrete amount)。所述活性成分的量通常等于將給藥至受試者的活性成分的劑量和/或該劑量的簡單分數,例如,該劑量的二分之一或三分之一。
在本發(fā)明藥物組合物中的活性成分、藥學上可接受的賦形劑和/或任意額外的成分的相對量將根據所治療的受試者的特性、體型和/或病癥而變化且進一步地根據該組合物的給藥途徑而變化。該組合物可包含0.1%至100%(w/w)的活性成分。
在制備所提供的藥物組合物中所用的藥學上可接受的賦形劑包括惰性稀釋劑、分散劑和/或造粒劑、表面活性劑和/或乳化劑、崩解劑、結合劑、防腐劑、緩沖劑、潤滑劑和/或油。賦形劑(例如可可脂和栓劑蠟)、著色劑、包衣劑、甜味劑、調味劑和芳香劑也可存在于該組合物中。
示例性的稀釋劑包括碳酸鈣、碳酸鈉、磷酸鈣、磷酸二鈣、硫酸鈣、磷酸氫鈣、磷酸鈉、乳糖、蔗糖、纖維素、微晶纖維素、高嶺土、甘露糖醇、山梨糖醇、肌醇、氯化鈉、干淀粉、玉米淀粉、糖粉及其混合物。
示例性的造粒劑和/或分散劑包括土豆淀粉、玉米淀粉、木薯淀粉、淀粉羥乙酸鈉、粘土、海藻酸、瓜爾膠、柑橘漿、瓊脂、膨潤土、纖維素和木制品、天然海綿、陽離子交換樹脂、碳酸鈣、硅酸鹽、碳酸鈉、交聯聚(乙烯基-吡咯烷酮)(交聚維酮)、羧甲基淀粉鈉(淀粉羥乙酸鈉)、羧甲基纖維素、交聯羧甲基纖維素鈉(交聯羧甲纖維素)、甲基纖維素、預膠化淀粉(淀粉1500)、微晶淀粉、水不溶性淀粉、羧甲基纖維素鈣、硅酸鎂鋁(Veegum)、月桂基硫酸鈉、季銨化合物及其混合物。
示例性的表面活性劑和/或乳化劑包括天然乳化劑(例如,阿拉伯膠、瓊脂、海藻酸、海藻酸鈉、黃蓍膠、chondrux、膽固醇、黃原膠、果膠、明膠、蛋黃、酪蛋白、羊毛脂、膽固醇、蠟和卵磷脂)、皂土(例如,膨潤土(硅酸鋁)和Veegum(硅酸鎂鋁))、長鏈氨基酸衍生物、高分子量醇(例如,硬脂醇、鯨蠟醇、油醇、三醋精單硬脂酸酯、乙二醇二硬脂酸、單硬脂酸甘油酯和丙二醇單硬脂酸酯、聚乙烯醇)、卡波姆(例如,羧基聚亞甲基(carboxypolymethylene)、聚丙烯酸、丙烯酸聚合物和羧基乙烯基聚合物)、角叉菜膠、纖維素衍生物(例如,羧甲基纖維素鈉、粉狀纖維素、羥甲基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基甲基纖維素、甲基纖維素)、脫水山梨糖醇脂肪酸酯(例如,聚氧乙烯脫水山梨糖醇單月桂酸酯(20)、聚氧乙烯脫水山梨糖醇(60)、聚氧乙烯脫水山梨糖醇單油酸酯(80)、脫水山梨糖醇單棕櫚酸酯(40)、脫水山梨糖醇單硬脂酸酯(60)、脫水山梨糖醇三硬脂酸酯(65)、單油酸甘油酯、脫水山梨糖醇單油酸酯(80)、聚氧乙烯酯(例如,聚氧乙烯單硬脂酸酯(45)、聚氧乙烯氫化蓖麻油、聚乙氧基化蓖麻油、聚甲醛硬脂酸酯和)、蔗糖脂肪酸酯、聚乙二醇脂肪酸酯(例如,)、聚氧乙烯醚(例如,聚氧乙烯月桂基醚(30))、聚(乙烯基-吡咯烷酮)、二乙二醇單月桂酸、三乙醇胺油酸酯、油酸鈉、油酸鉀、油酸乙酯、油酸、月桂酸乙酯,月桂基硫酸鈉、F-68、泊洛沙姆P-188、西曲溴銨、西吡氯銨、苯扎氯銨、多庫酯鈉和/或其混合物。
示例性的粘合劑包括淀粉(例如,玉米淀粉和淀粉糊)、明膠、糖(例如,蔗糖、葡萄糖、右旋糖、糊精、糖蜜、乳糖、乳糖醇、甘露糖醇等)、天然和合成樹膠(例如,阿拉伯膠、海藻酸鈉、愛爾蘭蘚提取物、潘瓦爾膠(panwarRum)、茄替膠(ghatti gum)、車前子殼粘膠(mucilage of isabgol husk)、羧甲基纖維素、甲基纖維素、乙基纖維素、羥乙基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基甲基纖維素、微晶纖維素、乙酸纖維素、聚(乙烯基-吡咯烷酮)、硅酸鎂鋁和落葉松阿拉伯半乳聚糖(larch arabogalactan))、海藻酸鹽、聚氧化乙烯、聚乙二醇、無機鈣鹽、硅酸、聚甲基丙烯酸酯、蠟、水、乙醇和/或其混合物。
示例性的防腐劑包括抗氧化劑、螯合劑、抗微生物防腐劑、抗真菌防腐劑、抗原生動物防腐劑、乙醇防腐劑、酸性防腐劑和其他防腐劑。在一些實施方案中,所述防腐劑是抗氧化劑。在其他實施方案中,所述防腐劑是螯合劑。
示例性的抗氧化劑包括α生育酚、抗壞血酸、抗壞血酸棕櫚酸酯、丁羥苯甲醚、丁羥甲苯、硫代甘油、焦亞硫酸鉀、丙酸、沒食子酸丙酯、抗壞血酸鈉、亞硫酸氫鈉、焦亞硫酸鈉和亞硫酸鈉。
示例性的螯合劑包括乙二胺四乙酸(EDTA)及其鹽和水合物(例如,乙二胺四乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉、乙二胺四乙酸三鈉、乙二胺四乙酸二鈉鈣、乙二胺四乙酸二鉀等)、檸檬酸及其鹽和水合物(例如,檸檬酸單水合物)、富馬酸及其鹽和水合物、蘋果酸及其鹽和水合物、磷酸及其鹽和水合物、和酒石酸及其鹽和水合物。示例性的抗微生物防腐劑包括苯扎氯銨、芐索氯銨、苯甲醇、溴硝丙二醇、西曲溴銨、西吡氯銨、氯己定、三氯叔丁醇、氯甲酚、氯二甲酚、甲酚、乙醇、甘油、海克替啶、咪脲、苯酚、苯氧乙醇、苯乙醇、硝酸苯汞、丙二醇和硫柳汞。
示例性的抗真菌防腐劑包括對羥苯甲酸丁酯、對羥基苯甲酸甲酯、對羥基苯甲酸乙酯、對羥基苯甲酸丙酯、苯甲酸、羥基苯甲酸、苯甲酸鉀、山梨酸鉀、苯甲酸鈉、丙酸鈉和山梨酸。
示例性的醇防腐劑包括乙醇、聚乙二醇、苯酚、酚化合物、雙酚、三氯叔丁醇、羥基苯甲酸酯和苯基乙醇。
示例性的酸性防腐劑包括維生素A、維生素C、維生素E、β胡蘿卜素、檸檬酸、乙酸、脫氫乙酸、抗壞血酸、山梨酸和植酸。
其他防腐劑包括生育酚、生育酚乙酸酯、甲磺酸去鐵胺、西曲溴銨、丁羥茴香醚(BHA)、丁羥甲苯(BHT)、乙二胺、月桂基硫酸鈉(SLS)、月桂基醚硫酸鈉(SLES)、亞硫酸氫鈉、焦亞硫酸鈉、亞硫酸鉀、焦亞硫酸鉀、Plus、對羥苯甲酸甲酯、115、II、和
示例性的緩沖劑包括檸檬酸鹽緩沖溶液、乙酸鹽緩沖溶液、磷酸鹽緩沖溶液、氯化銨、碳酸鈣、氯化鈣、檸檬酸鈣、葡乳醛酸鈣、葡庚糖酸鈣、葡糖酸鈣、D-葡糖酸、甘油磷酸鈣、乳酸鈣、丙酸、戊酮酸鈣、戊酸、磷酸氫鈣、磷酸、磷酸鈣、磷酸氫氧化鈣、乙酸鉀、氯化鉀、葡糖酸鉀、鉀混合物、磷酸氫二鉀、磷酸二氫鉀、磷酸鉀混合物、乙酸鈉、碳酸氫鈉、氯化鈉、檸檬酸鈉、乳酸鈉、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉、磷酸鈉混合物、氨丁三醇、氫氧化鎂、氫氧化鋁、海藻酸、無熱原水、等滲鹽水、林格氏溶液、乙醇及其混合物。
示例性的潤滑劑包括硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、硬脂酸、二氧化硅、滑石、麥芽、甘油山崳酸酯、氫化植物油、聚乙二醇、苯甲酸鈉、乙酸鈉、氯化鈉、亮氨酸、月桂基硫酸鎂、月桂基硫酸鈉及其混合物。
示例性的天然油包括杏仁(almond)、苦杏仁(apricot kernel)、鱷梨、巴西棕櫚樹(babassu)、佛手柑、黑加侖種子、琉璃苣、杜松、甘菊、蕓苔、香菜、臘棕櫚、蓖麻、肉桂、可可脂、椰子、魚肝油、咖啡、玉米、棉籽、鴯鹋、桉樹、月見草、魚、亞麻子、香葉醇、葫蘆、葡萄籽、榛子、牛膝草、肉豆蔻酸異丙酯、荷荷巴油、夏威夷核油(kukui nut)、雜交熏衣草(lavandin)、薰衣草(lavender)、檸檬、蓽澄茄、夏威夷果(macademia nut)、錦葵、芒果核、白芒花籽(meadowfoam seed)、貂、肉豆蔻、橄欖、橙、羅非魚(orange roughy)、棕櫚、棕櫚仁、桃仁、花生、罌粟子、南瓜子、油菜籽、米糠、迷迭香、紅花、檀香、山茶花(sasquana)、香薄荷、沙棘、芝麻、牛油樹脂、有機硅、大豆、向日葵、茶樹、薊、椿(tsubaki)、巖石草、胡桃和麥芽油。示例性的合成油包括,但不限于,硬脂酸丁酯、辛酸甘油三酯、癸酸甘油三酯、環(huán)甲基硅油、癸二酸二乙酯、二甲硅油360、肉豆蔻酸異丙酯、礦物油、辛基十二烷醇、油醇、硅油及其混合物。
用于口服和胃腸外給藥的液體劑型包括藥學上可接受的乳劑、微乳劑、溶液、混懸液、糖漿劑和酏劑。除了活性成分,所述液體劑型可包含本領域常用的惰性稀釋劑,例如,水或其他溶劑、增溶劑和乳化劑(例如乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸芐酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲酰胺、油(例如,棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄欖油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氫糠醇、聚乙二醇和脫水山梨糖醇脂肪酸酯及其混合物)。除了惰性稀釋劑,該口服組合物可包含佐劑,例如濕潤劑、乳化劑和懸浮劑、甜味劑、調味劑和芳香劑。在胃腸外給藥的一些實施方案中,將本發(fā)明的綴合物與增溶劑混合,所述增溶劑例如醇、油、改性油、二醇、聚山梨醇酯、環(huán)糊精、聚合物及其混合物。
可注射制劑,例如,無菌注射水性或油性混懸液可根據本領域已知的方法,使用適當的分散劑或濕潤劑和懸浮劑進行配制。所述無菌注射制劑可為在無毒胃腸外可接受的稀釋劑或溶劑中的無菌注射溶液、混懸液或乳液,例如,在1,3-丁二醇中的溶液。可使用的可接受媒介物和溶劑是水、U.S.P.林格氏溶液、和等滲氯化鈉溶液。此外,無菌不揮發(fā)油通常用作溶劑或懸浮介質。為了這一目的,任意刺激性小的不揮發(fā)油均可被采用,包括合成的單-或二-甘油酯。此外,脂肪油(例如油酸)可用于制備注射劑。
所述可注射制劑可通過以下進行滅菌,例如,通過細菌截留過濾器(bacterial-retaining filter)過濾或通過加入無菌固體組合物形式的滅菌劑,其在使用前可被溶解或分散于無菌水或其他無菌可注射介質中。
為了延長藥物療效,通常期望減慢皮下或肌內注射藥物的吸收。這可通過使用水溶性差的結晶或無定形物的液體懸浮液來實現。該藥物的吸收速率取決于其溶解速率,而溶解速率本身可能取決于晶體大小和結晶形式。或者,胃腸外施用的藥物形式的延遲吸收可通過將該藥物溶解或懸浮于油性媒介物中而實現。
直腸或陰道給藥的組合物通常為栓劑,其可通過將本發(fā)明的綴合物與合適的無刺激性的賦形劑或載體(例如可可脂、聚乙二醇或栓劑用蠟,其在常溫為固體,但在體溫為液體,并因此在直腸或陰道腔中融化并釋放活性成分)混合進行制備。
用于口服給藥的固體劑型包括膠囊、片劑、丸劑、粉劑和顆粒劑。在該固體劑型中,將該活性成分與至少一種惰性的藥學上可接受的賦形劑或載體(例如檸檬酸鈉或磷酸二鈣)和/或(a)填充劑或增充劑,例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇和硅酸,(b)粘合劑,例如,羧甲基纖維素、海藻酸鹽、明膠、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯膠,(c)濕潤劑,例如甘油,(d)崩解劑,例如瓊脂、碳酸鈣、土豆或木薯淀粉、海藻酸、一些硅酸鹽和碳酸鈉,(e)溶液阻滯劑,例如石蠟,(f)吸收促進劑,例如季銨化合物,(g)濕潤劑,例如,鯨蠟醇和單硬脂酸甘油酯,(h)吸收劑,例如高嶺土和膨潤土,和(i)潤滑劑,例如滑石、硬脂酸鈣、硬脂酸鎂、固體聚乙二醇、月桂基硫酸鈉及其混合物進行混合。在膠囊、片劑和丸劑的情況下,該劑型可包含緩沖劑。
相似類型的固體組合物可用作軟和硬填充明膠膠囊中的填充劑,使用例如乳糖或奶糖以及高分子量的聚乙二醇等的賦形劑。片劑、錠劑、膠囊、丸劑和顆粒劑的固體劑型可用包衣和殼(例如腸溶衣和藥理學領域熟知的其他包衣)進行制備。它們可任選地包含遮光劑且可為這樣的組合物,其任選地以延遲的方式,僅在或優(yōu)選地在腸道的特定部分釋放活性成分。可使用的包封組合物的實例包括聚合物質和蠟。相似類型的固體組合物可用作軟和硬填充明膠膠囊中的填充劑,使用例如乳糖或奶糖以及高分子量的聚乙二醇等的賦形劑。
所述活性成分可與一種或多種上述賦形劑形成微膠囊形式。片劑、錠劑、膠囊、丸劑和顆粒劑的所述固體劑型可用包衣和殼(例如腸溶包衣、控釋包衣和在藥物制劑領域熟知的其他包衣)進行制備。在該固體劑型中,可將所述活性成分與至少一種惰性稀釋劑(例如蔗糖、乳糖或淀粉)混合。這種劑型可包含,如一般實踐,除惰性稀釋劑之外的其他物質,例如,壓片潤滑劑和其他壓片助劑,例如硬脂酸鎂和微晶纖維素。在膠囊、片劑和丸劑的情況下,該劑型可包含緩沖劑。它們可任選地包含遮光劑且可為這樣的組合物,其任選地以延遲的方式,僅在或優(yōu)選地在腸道的特定部分釋放活性成分??墒褂玫陌z劑的實例包括聚合物質和蠟。
用于局部和/或透皮施用本發(fā)明化合物的劑型可包括軟膏劑、糊劑、乳膏劑、洗劑、凝膠劑、粉劑、溶液、噴霧劑、吸入劑和/或貼劑。通常,將該活性成分在無菌條件下與藥學上可接受的載體或賦形劑和/或任意所需防腐劑和/或需要的緩沖劑混合。此外,本發(fā)明可以使用透皮貼劑,其通常具有將活性成分可控地遞送至機體的附加優(yōu)勢。這種劑型可例如通過將該活性成分溶解和/或分散于適當的介質中進行制備?;蛘呋虼送?,所述速率可通過提供速率控制膜和/或將活性成分分散于聚合物基質和/或凝膠中進行控制。
用于遞送本文所述皮內藥物組合物的合適的裝置包括短針裝置。皮內組合物可用限制針進入皮膚的有效穿透長度的裝置進行給藥。或者或此外,常規(guī)注射器可用于皮內給藥的經典mantoux法。通過液體噴射注射器和/或通過刺穿角質層并產生到達真皮的射流的針將液體制劑遞送至真皮的快速注射裝置是合適的。使用壓縮氣體以加速粉末形式的化合物穿過皮膚外層到真皮的發(fā)射性粉末(Ballistic powder)/顆粒遞送裝置是合適的。
適用于局部給藥的制劑包括,但不限于,液體和/或半液體制劑,例如搽劑、洗劑、水包油和/或油包水乳劑例如乳膏劑、軟膏劑和/或糊劑,和/或溶液和/或混懸液。局部給藥的制劑可,例如,包含約1%至約10%(w/w)的活性成分,但該活性成分的濃度可高達該活性成分在該溶劑中的溶解度極限。用于局部給藥的制劑還可包含一種或多種本文所述的額外的成分。
可將本發(fā)明藥物組合物以適用于通過口腔進行肺部給藥的制劑進行制備、包裝和和/或出售。這種制劑可包括干顆粒,其包含活性成分且其具有約0.5至約7納米或約1至約6納米范圍的直徑。這種組合物以干粉劑的形式方便地進行給藥,其使用包括干粉貯存器的裝置,將推進劑流引導至所述干粉貯存器中以分散該粉末,和/或使用自推進溶劑/粉末分配容器,例如包含在密閉容器中溶于和/或懸浮于低沸點推進劑中的活性成分的裝置。這種粉劑包括顆粒,其中按重量計至少98%的顆粒具有大于0.5納米的直徑且按數量計至少95%的顆粒具有小于7納米的直徑?;蛘?,按重量計至少95%的顆粒具有大于1納米的直徑和按數量計至少90%的顆粒具有小于6納米的直徑。干粉組合物可包括固體細粉稀釋劑(例如糖)且以單位劑量形式方便地提供。
低沸點推進劑通常包括在大氣壓下具有低于65°F沸點的液體推進劑。通常,該推進劑可構成50-99.9%(w/w)的所述組合物,且所述活性成分可構成0.1至20%(w/w)的所述組合物。該推進劑可進一步包含額外的成分,例如液體非離子型和/或固體陰離子型表面活性劑和/或固體稀釋劑(其可與包含活性成分的顆粒具有同量級的顆粒大小)。
用于肺部遞送的本發(fā)明藥物組合物可提供溶液和/或混懸液液滴形式的活性成分。這種制劑可作為水性和/或稀醇溶液和/或混懸液進行制備、包裝和/或出售,任選地無菌,其包含活性成分,且可使用任意噴霧和/或霧化裝置方便地進行施用。這種制劑還可包含一種或多種額外的成分,包括,但不限于,調味劑,例如糖精鈉、揮發(fā)油、緩沖劑、表面活性劑和/或防腐劑,例如羥基苯甲酸甲酯。通過這一給藥途徑提供的液滴可具有約0.1至約200納米范圍的平均直徑。
將本文所述用于肺部遞送的制劑用于鼻內遞送本申請所述的藥物組合物。另一適用于鼻內給藥的制劑是粗粉,其包含活性成分并具有約0.2至500微米的平均粒徑。這種制劑是通過從保持在鼻孔附近的粉末容器中快速吸入鼻道內進行給藥的。
經鼻給藥的制劑可,例如,包含約至少0.1%(w/w)至至多100%(w/w)的活性成分,并可包含一種或多種本文所述的額外的成分。本申請所述的藥物組合物可以口腔給藥制劑進行制備、包裝和/或出售。這種制劑可,例如,為使用常規(guī)方法制備的片劑和/或錠劑形式,且可包含,例如,0.1至20%(w/w)的活性成分、包含口服溶解和/或降解的組合物的余量和任選地一種或多種本文所述的額外的成分?;蛘撸谇唤o藥的制劑可包括含有活性成分的粉末和/或氣溶膠化和/或霧化溶液和/或混懸液。當這種粉末狀、氣溶膠化和/或氣溶膠化制劑分散時,其可具有約0.1至約200納米范圍的平均顆粒和/或液滴尺寸,且可進一步包含一種或多種本文所述的額外的成分。
本申請所述的藥物組合物可以眼部給藥制劑進行制備、包裝和/或出售。這種制劑可,例如,為滴眼劑的形式,其包含,例如,0.1-1.0%(w/w)活性成分在水性或油性液體載體或賦形劑中的溶液和/或混懸液。這種滴劑還可包含緩沖劑、鹽和/或一種或多種本文所述的其他額外的成分。其他有用的眼部施用制劑包括包含微晶形式和/或脂質體制劑形式的活性成分的那些。滴耳劑和/或滴眼劑也旨在涵蓋在本發(fā)明公開的范圍內。
盡管對本文所提供的藥物組合物的描述主要涉及適用于給藥至人的藥物組合物,但本領域技術人員將理解,這種組合物通常適用于給藥至各種動物。修改適用于給藥至人的藥物組合物以使得該組合物適用于給藥至各種動物是熟知的,且本領域普通獸醫(yī)可設計和/或用普通的試驗實施這種修改。
本文提供的化合物通常配制成易于給藥且劑量均一的劑量單位形式。但是,將理解,本發(fā)明組合物的總的每日劑量將由醫(yī)生在合理的醫(yī)學判斷范圍內來決定。對任意具體受試者或生物體而言的具體治療有效量水平將取決于各種因素,包括所治療的疾病和該疾病的嚴重性;所采用的具體活性成分的活性;所采用的具體組合物;該受試者的年齡、體重、一般健康狀況、性別和飲食;給藥時間、給藥途徑和所采用的具體活性成分的排泄速率;治療的持續(xù)時間;與所采用的具體活性成分組合使用或同時使用的藥物;和醫(yī)學領域中熟知的類似的因素。
本文提供的化合物和組合物可通過任意途徑進行給藥,包括腸內(例如,口服)、胃腸外、靜脈內、肌內、動脈內、髓內、鞘內、皮下、心室內、透皮、皮內、直腸、陰道內、腹膜內、局部(如通過粉劑、軟膏劑、乳膏劑和/或滴劑)、經粘膜、經鼻、口腔、舌下;通過氣管內滴注、支氣管滴注和/或吸入;和/或作為口腔噴霧、鼻噴霧和/或氣霧劑。特別考慮的途徑是口服給藥、靜脈內給藥(例如,全身性靜脈內注射)、通過血液和/或淋巴供給的區(qū)域性給藥、和/或直接給藥至受影響部位。通常,最合適的給藥途徑將取決于各種因素,包括藥劑的性質(例如,在胃腸道環(huán)境中的穩(wěn)定性),和/或受試者的病癥(例如,所述受試者是否能忍受口服給藥)。在一些實施方案中,所述本申請所述的化合物或藥物組合物適合局部給藥至受試者的眼睛。
需要達到有效量的化合物的確切量因受試者而異,取決于,例如,受試者的物種、年齡和一般狀況、副作用或障礙的嚴重性、具體化合物的特性、給藥方式等。有效量可以包括在單劑量(例如,單一口服劑量)或多劑量(例如,多個口服劑量)中。在一些實施方案中,當給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞時,所述多劑量的任意兩個劑量包括不同量或實質相同量的本申請所述的化合物。在一些實施方案中,當給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞時,給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞的頻率為一天三劑、一天兩劑、一天一劑、隔天一劑、每三天一劑、每周一劑、每兩周一劑、每三周一劑或每四周一劑。在一些實施方案中,給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞的頻率為一天一劑。在一些實施方案中,給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞的頻率為一天兩劑。在一些實施方案中,給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞的頻率為一天三劑。在一些實施方案中,當給藥多劑量至受試者或應用多劑量至組織或細胞時,多劑量的第一劑和最后一劑之間的時間跨度為一天、兩天、四天、一周、兩周、三周、一個月、兩個月、三個月、四個月、六個月、九個月、一年、兩年、三年、四年、五年、七年、十年、十五年、二十年或受試者、組織或細胞的終身。在一些實施方案中,多劑量的第一劑和最后一劑之間的時間跨度為三個月、六個月或一年。在一些實施方案中,多劑量的第一劑和最后一劑之間的時間跨度為受試者、組織或細胞的終身。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的劑量(例如,單劑量或多劑量的任意劑量)獨立地包括0.1μg和1μg之間、0.001mg和0.01mg之間、0.01mg和0.1mg之間、0.1mg和1mg之間、1mg和3mg之間、3mg和10mg之間、10mg和30mg之間、30mg和100mg之間、100mg和300mg之間、300mg和1,000mg之間或1g和10g之間的本申請所述的化合物,包括端點在內。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的劑量獨立地包括1mg和3mg之間的本申請所述的化合物,包括端點在內。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的劑量獨立地包括3mg和10mg之間的本申請所述的化合物,包括端點在內。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的劑量獨立地包括10mg和30mg之間的本申請所述的化合物,包括端點在內。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的劑量獨立地包括30mg和100mg之間的本申請所述的化合物,包括端點在內。
將理解,本文所述的劑量范圍為將所提供的藥物組合物給藥至成人提供指導。給藥至例如兒童或青少年的量可由醫(yī)生或本領域技術人員確定且可比施用至成人的量稍低或相同。在一些實施方案中,本文所述劑量為施用至體重為70kg的成人的劑量。
還應理解,本發(fā)明化合物或組合物可以與一種或多種其他藥物(例如,治療和/或預防性活性藥物)組合給藥,所述其他藥物不同于所述化合物或組合物且可用作例如組合療法。與其他藥物組合給藥所述化合物或組合物可以提高它們在以下方面中的活性(例如,活性(例如,效力和/或有效性):治療有此需要的受試者中的疾病、預防有此需要的受試者中的疾病、降低有此需要的受試者發(fā)展疾病的風險、抑制病毒復制、殺死病毒、抑制受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性、抑制受試者或細胞中的溴結構域的活性、抑制受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基結合、調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸、調節(jié)(例如,抑制)受試者或細胞中的由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)、誘導細胞凋亡、誘導在受試者或細胞中的G1阻滯或可以提高生物利用度和/或安全性,降低藥物耐藥性,降低和/或改進它們的代謝,抑制它們的排泄和/或改善它們在受試者體內的分布。還應當理解,應用的治療可以對相同病癥取得所需效果,和/或可以取得不同的效果。在一些實施方案中,與包含本發(fā)明化合物或其他藥物而非二者的藥物組合物相比,包含本發(fā)明化合物和其他藥物的本發(fā)明藥物組合物顯示協同作用。
可將化合物或組合物與一種或多種額外的藥劑同時給藥、在所述一種或多種額外的藥劑之前或之后給藥,其可用作,例如,組合療法。藥劑包括治療活性劑。藥劑還包括預防活性劑。藥劑包括小的有機分子,例如藥物化合物(例如,由美國食品與藥物管理局批準,提供在美國聯邦法規(guī)匯編(CFR)中的人或獸用化合物)、肽類、蛋白、碳水化合物、單糖、寡糖、多糖、核蛋白、粘蛋白、脂蛋白、合成多肽或蛋白、連接蛋白的小分子、糖蛋白、甾類、核酸、DNA、RNA、核苷酸、核苷、寡核苷酸、反義寡核苷酸、脂質、激素、維生素和細胞。在一些實施方案中,所述額外的藥劑是用于治療和/或預防本文所述疾病的藥劑。各額外的藥劑可以該藥劑確定的劑量和/或時間表進行給藥。所述額外的藥劑也可彼此一起和/或與本申請所述的化合物或組合物一起,以單一劑量進行給藥或以不同劑量分別進行給藥。在該方案中所采用的具體組合將考慮本申請所述的化合物與額外的藥劑的相容性和/或將實現的所需的治療和/或預防效果。通常,預期所述額外的藥劑在組合使用時所采用的水平是以不超過它們單獨使用時的水平。在一些實施方案中,組合使用的水平將低于它們單獨使用時的水平。
所述額外的藥劑包括,但不限于,抗增殖劑、抗癌劑、細胞毒性劑、抗血管生成劑、抗炎劑、免疫抑制劑、抗菌劑、抗病毒劑、心血管藥物、降脂藥、抗糖尿病藥、抗過敏劑、避孕藥和疼痛緩解劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為抗增殖劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為抗癌劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為抗病毒劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為含溴結構域蛋白的結合劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為溴結構域的結合劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為含溴結構域蛋白的結合劑或抑制劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑為溴結構域的結合劑或抑制劑。在一些實施方案中,所述額外的藥劑選自外遺傳(epigenetic)或轉錄調節(jié)劑(例如,DNA甲基轉移酶抑制劑、組蛋白脫乙酰基酶抑制劑(HDAC抑制劑)、賴氨酸甲基轉移酶抑制劑)、抗有絲分裂藥物(例如,紫杉烷類和長春花生物堿)、激素受體調節(jié)劑(例如,雌激素受體調節(jié)劑和雄激素受體調節(jié)劑)、細胞信號傳導途徑抑制劑(例如,酪氨酸激酶抑制劑)、蛋白穩(wěn)定性的調節(jié)劑(例如,蛋白酶體抑制劑)、Hsp90抑制劑、糖皮質激素、全反式維甲酸,和其他促進分化的藥物。在一些實施方案中,本申請所述的化合物或藥物組合物可以與抗癌治療組合給藥,所述抗癌治療包括,但不限于,手術、輻射治療、移植(例如干細胞移植、骨髓移植)、免疫治療和化療。
本發(fā)明還包括試劑盒(例如,藥物包裝)。提供的試劑盒可包括本申請所述的藥物組合物或化合物,以及容器(例如,小瓶、安瓿、瓶、注射器和/或分配包裝,或其他合適的容器)。在一些實施方案中,提供的試劑盒還可任選包括第二容器,其包括藥物賦形劑,用于稀釋或懸浮本申請所述的藥物組合物或化合物。在一些實施方案中,本申請所述的藥物組合物或化合物提供在第一容器中,且組合第二容器以形成單位劑型。
因此,一方面,提供了試劑盒,其包括第一容器,其包含本申請所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、溶劑合物、水合物、多晶型物、共結晶物、互變異構體、立體異構體、同位素標記的衍生物或前藥,或其藥物組合物。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在有此需要的受試者中治療和/或預防本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在有此需要的受試者中治療本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在有此需要的受試者中預防本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在有此需要的受試者中降低出現本發(fā)明所述的疾病的風險。在一些實施方案中,所述試劑盒用于男性避孕。在一些實施方案中,所述試劑盒用于抑制精子形成。在一些實施方案中,所述試劑盒用于抑制病毒復制。在一些實施方案中,所述試劑盒用于殺傷病毒。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白的活性(例如,異常活性,例如升高的活性)。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中抑制溴結構域的活性(例如,異常活性,例如升高的活性)。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中調節(jié)(例如,下調或抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)。在一些實施方案中,所述試劑盒用于誘導細胞凋亡。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者中誘導細胞凋亡。在一些實施方案中,所述試劑盒用于在受試者或細胞中誘導G1阻滯。
在一些實施方案中,所述試劑盒用于篩選化合物庫,以鑒定可用于本發(fā)明的方法的化合物。
在一些實施方案中,本發(fā)明所述的試劑盒還包括使用所述試劑盒的說明書,例如在本發(fā)明的方法中使用所述試劑盒的說明書(例如,給藥本申請所述的化合物或藥物組合物至受試者的說明書)。本發(fā)明所述的試劑盒還可包括管理機構(例如美國食品和藥品管理局(FDA))所需的信息。在一些實施方案中,包括在試劑盒中的所述信息為處方信息。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在有此需要的受試者中治療和/或預防本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在有此需要的受試者中治療本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在有此需要的受試者中預防本發(fā)明所述的疾病。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在有此需要的受試者中降低出現本發(fā)明所述的疾病的風險。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于避孕男性避孕。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于抑制病毒復制。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于殺死病毒。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白的活性(例如,異常活性,例如升高的活性)。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者或細胞中抑制溴結構域的活性(例如,異常活性,例如升高的活性)。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者或細胞中調節(jié)(例如,下調或抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于誘導體外細胞凋亡。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者中誘導細胞凋亡。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于在受試者或細胞中誘導G1阻滯。在一些實施方案中,提供所述試劑盒和說明書用于篩選化合物庫,以鑒定可用于本發(fā)明的方法的化合物。本發(fā)明所述的試劑盒可包括一種或多種本發(fā)明所述的額外的藥劑作為單獨的組合物。
治療方法
本發(fā)明提供了治療寬范圍疾病的方法,例如與溴結構域有關的疾病、與溴結構域的活性(例如,異?;钚?有關的疾病、與含溴結構域蛋白有關的疾病和與含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚?有關的疾病。示例性疾病包括,但不限于,增殖性疾病、心血管疾病、病毒感染、纖維化疾病、神經性疾病、代謝疾病、內分泌疾病和輻射中毒。本發(fā)明還提供了男性避孕方法。本發(fā)明還提供了抑制精子形成的方法。本發(fā)明還提供了抑制溴結構域或含溴結構域蛋白的活性(例如,異?;钚裕缟叩幕钚?的方法、抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合的方法、調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸的方法、調節(jié)(例如,下調或抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的方法和誘導G1阻滯的方法。
基因調控根本上受控于大分子的可逆、非共價裝配。RNA聚合酶的信號轉導需要高度有序的蛋白復合物,由能夠解釋染色質的翻譯后修飾狀態(tài)的裝配因子在空間上進行調節(jié)。表觀遺傳讀取器是結構多樣的蛋白,且各表觀遺傳讀取器具有一個或多個進化上保守的效應器模塊,其識別蛋白(例如組蛋白)或DNA的共價修飾。在組蛋白尾部的賴氨酸殘基(Kac)的ε-N-乙酰化與開放的染色質結構和轉錄激活有關。乙酰基-賴氨酸的上下文特定的分子識別主要由溴結構域介導。
含溴結構域蛋白作為轉錄因子復合物(例如,TBP(TATA框結合蛋白)-相關的因子1(TAF1)、CREB-結合蛋白(CBP或CREBBP)、P300/CBP-相關的因子(PCAF)和Gcn5)和表觀遺傳記憶的決定子的成分具有重要的生物意義。存在41種人蛋白,其含有總共57種不同的溴結構域。盡管存在大的序列差異,但是所有的溴結構域共享一個保守折疊,其包括由確定底物特異性的不同環(huán)區(qū)域(ZA和BC環(huán))連接的4α螺旋(αZ、αA、αB和αC)的左側束。與肽底物的共結晶物結構顯示該乙?;?賴氨酸由中央疏水腔識別并用存在于大多數含溴結構域中的天冬酰胺殘基的氫鍵進行錨定。溴和額外末端蛋白(BET)家族(例如,BRD2、BRD3、BRD4和BRDT)共享公共域結構,其包括兩個顯示出高度序列保守性的N-端溴結構域和差異性更大的C-端募集區(qū)域。
最近的研究已經建立了一個令人信服的靶向癌癥中BRD4的理論。BRD4的功能是促進細胞周期進展,其在培養(yǎng)的癌細胞系中的敲除推動G1期阻滯。BRD4是轉錄延伸的重要介質,其用于募集正性轉錄延伸因子復合物(P-TEFb)。細胞周期蛋白依賴性激酶-9(P-TEFb的核心成分)是慢性淋巴細胞白血病中的有效靶點,且最近已被連接至c-Myc依賴性轉錄。存在于BRD4中的溴結構域募集P-TEFb至有絲分裂染色體,從而增加生長促進基因的表達。BRD4仍結合至在M/G1期表達的基因的轉錄起始位點,但其并未被發(fā)現出現在細胞周期中之后表達的基因的起始位點處。在增殖細胞中敲除BRD4已被證明導致G1期阻滯并通過降低對有絲分裂進展和存活重要的基因的表達水平進行凋亡。
重要的是,BRD4最近已被確定為在人鱗狀細胞癌的侵襲性形式中的復發(fā)t(15;19)染色體易位的成分。這種易位將BRD4的串聯N端溴結構域表達為與睪丸核蛋白(NUT)的框內嵌合體,從而在遺傳上限定該NUT中線癌(NMC)。在患者來源的NMC細胞系中的功能性研究已經證實了BRD4-NUT癌蛋白在維持這一惡性腫瘤的特征繁殖優(yōu)勢和分化阻斷中的重要作用。值得注意的是,BRD4-NUT基因表達的RNA沉默阻止增殖并促使伴有顯著細胞角蛋白表達增加的鱗狀分化。溴結構域也可下調Myc和其他轉錄因子,例如白介素7受體(IL7R)。這種觀察結果強調的是含溴結構域蛋白結合劑或抑制劑的效用和治療潛力。
在另一方面,本發(fā)明提供了在受試者中抑制所述含溴結構域蛋白的活性的方法。
在另一方面,本發(fā)明提供了在細胞中抑制所述含溴結構域蛋白的活性方法。
在另一個方面,本發(fā)明提供了在受試者或細胞中抑制含溴結構域蛋白活性的方法。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白是本文所述的含溴結構域蛋白(例如,BET蛋白,例如BRD2、BRD3、BRD4或BRDT)。在一些實施方案中,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性用本發(fā)明方法抑制。在一些實施方案中,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明方法抑制至少約1%、至少約3%、至少約10%、至少約20%、至少約30%、至少約40%、至少約50%、至少約60%、至少約70%、至少約80%、至少約90%、至少約95%或至少約98%。在一些實施方案中,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明方法抑制最多約90%、最多約80%、最多約70%、最多約60%、最多約50%、最多約40%、最多約30%、最多約20%、最多約10%、最多約3%或最多約1%。上述范圍的組合(例如,至少約10%且最多約50%)也在本發(fā)明的范圍內。其他范圍也是可能的。在一些實施方案中,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明方法選擇性地抑制。在一些實施方案中,與激酶(例如,MAP激酶、有絲分裂紡錘體激酶、polo樣激酶)的活性相比,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明方法選擇性地抑制。在其他實施方案中,在受試者或細胞中的含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明方法非選擇性地抑制。在一些實施方案中,所述細胞因子水平和/或組胺釋放經本發(fā)明方法降低。
在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白的活性為異常的含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白的活性為升高的含溴結構域蛋白的活性。在一些實施方案中,所述含溴結構域蛋白的活性被本發(fā)明的方法降低。
在一些實施方案中,所述受試者為動物。所述動物可為任一性別和可在任意發(fā)育階段。在一些實施方案中,所述受試者為雄性。在一些實施方案中,所述受試者為雌性。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的受試者為人。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的受試者為男人。在一些實施方案中,本發(fā)明所述的受試者為女人。在一些實施方案中,所述受試者為經診斷具有本發(fā)明所述的疾病的人。在一些實施方案中,所述受試者為經診斷以高于正常風險發(fā)展本發(fā)明所述的疾病的人。在一些實施方案中,所述受試者為疑似具有本發(fā)明所述的疾病的人。在一些實施方案中,所述受試者為非人動物。在一些實施方案中,所述受試者為魚。在一些實施方案中,所述受試者為哺乳動物。在一些實施方案中,所述受試者為非人哺乳動物。在一些實施方案中,所述受試者為人或非人哺乳動物。在一些實施方案中,所述受試者為家養(yǎng)動物,例如狗、貓、牛、豬、馬、羊或山羊。在一些實施方案中,所述受試者為伴侶動物,例如狗或貓。在一些實施方案中,所述受試者為家畜動物,例如牛、豬、馬、羊或山羊。在一些實施方案中,所述受試者為動物園動物。在其他實施方案中,所述受試者為研究動物,例如嚙齒類動物(例如,小鼠、大鼠)、狗、豬或非人靈長類動物。在一些實施方案中,所述動物為基因工程動物。在一些實施方案中,所述動物為轉基因動物(例如,轉基因小鼠和轉基因豬)。
在一些實施方案中,本發(fā)明所述的細胞在體外。在一些實施方案中,所述細胞為離體的。在一些實施方案中,細胞在體內。
在另一方面,本發(fā)明提供了在受試者中抑制溴結構域的活性的方法。
在另一方面,本發(fā)明提供了在細胞中抑制溴結構域的活性的方法。
在一些實施方案中,所述溴結構域的活性為異常的溴結構域的活性。在一些實施方案中,所述溴結構域的活性為升高的溴結構域的活性。在一些實施方案中,所述溴結構域的活性被本發(fā)明的方法降低。
本發(fā)明的其他方面涉及在受試者中抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合的方法。
本發(fā)明的其他方面涉及在細胞中抑制含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合的方法。
在一些實施方案中,所述第二蛋白為具有乙酰基-賴氨酸殘基的蛋白。在一些實施方案中,所述第二蛋白不為含溴結構域蛋白。在一些實施方案中,所述第二蛋白為組蛋白。在一些實施方案中,所述組蛋白選自H1、H2A、H2B、H3、H4和H5。在一些實施方案中,含溴結構域蛋白的溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合被本發(fā)明方法抑制。
在另一方面,本發(fā)明提供了調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸的方法。在一些實施方案中,所述轉錄延伸被本發(fā)明方法調節(jié)(例如,抑制)。
在另一方面,本發(fā)明提供了在受試者中調節(jié)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的方法。
在另一方面,本發(fā)明提供了在細胞中調節(jié)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的方法。
在一些實施方案中,本發(fā)明提供了在受試者或細胞中下調或抑制由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)的方法。不期望受任何具體理論的限制,本發(fā)明化合物和藥物組合物能夠干擾含溴結構域蛋白和基因的轉錄起始位點的結合。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物和藥物組合物通過溴結構域或含溴結構域蛋白干擾基因表達(例如,轉錄)過程中的乙?;?賴氨酸的識別。在一些實施方案中,本發(fā)明化合物和藥物組合物干擾基因表達(例如,轉錄)過程中的含溴結構域蛋白對乙酰化染色質的錨定(例如,含溴結構域蛋白的溴結構域對乙?;旧|的乙?;?賴氨酸的錨定)。在一些實施方案中,受試者或細胞中的由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)被本發(fā)明方法調節(jié)。在一些實施方案中,受試者或細胞中的由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)被本發(fā)明方法下調或抑制。在一些實施方案中,由含溴結構域蛋白調控的基因是癌基因。
本發(fā)明的其他方面涉及一種在有此需要的受試者中治療疾病的方法。
在一些實施方案中,所述疾病與含溴結構域蛋白有關。在一些實施方案中,所述疾病與所述含溴結構域蛋白的活性有關。在一些實施方案中,所述疾病與含溴結構域蛋白異?;钚曰蛏叩幕钚杂嘘P。
在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域(例如,含溴結構域蛋白的溴結構域)有關。在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域的活性有關。在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域的異常活性或升高的活性有關。在一些實施方案中,所述疾病與溴結構域的功能(例如,功能障礙)有關。
在一些實施方案中,本文所述疾病被轉錄活化劑驅動。在一些實施方案中,所述轉錄活化劑為Myc。在一些實施方案中,所述疾病與NUT重排有關。在一些實施方案中,所述疾病與異常Myc功能有關。在一些實施方案中,所述疾病與白介素7受體(IL7R)有關。
在一些實施方案中,所述疾病為增殖性疾病(例如,本發(fā)明所述的增殖性疾病)。在一些實施方案中,所述疾病為癌癥(例如,本發(fā)明所述的癌癥)。在一些實施方案中,所述疾病為肺癌。在一些實施方案中,所述疾病為多發(fā)性骨髓瘤。在一些實施方案中,所述疾病為神經母細胞瘤。在一些實施方案中,所述疾病為結腸癌。在一些實施方案中,所述疾病為睪丸癌。在一些實施方案中,所述疾病為卵巢癌。在一些實施方案中,所述疾病為肺癌(例如,小細胞肺癌或非小細胞肺癌)。在一些實施方案中,所述疾病為NUT中線癌(例如,BRD3NUT中線癌或BRD4NUT中線癌)。在一些實施方案中,所述疾病為混合性白血病(MLL)。在一些實施方案中,所述疾病選自伯基特淋巴瘤、乳腺癌、結腸癌、神經母細胞瘤、多形性膠質母細胞瘤、慢性淋巴細胞性白血病和鱗狀細胞癌。
在一些實施方案中,所述疾病為良性腫瘤(例如,本發(fā)明所述的良性腫瘤)。
在一些實施方案中,所述疾病為炎性疾病(例如,本發(fā)明所述的炎性疾病)。在一些實施方案中,所述疾病為涉及對細菌、病毒、真菌、寄生蟲和/或原蟲感染的炎癥應答的疾病。在一些實施方案中,所述疾病選自骨關節(jié)炎、急性痛風、多發(fā)性硬化、炎性腸疾病(例如,克羅恩病和潰瘍性結腸炎)、神經炎癥、哮喘、慢性氣道阻塞性疾病、肺炎、肌炎、濕疹、皮炎、痤瘡、蜂窩織炎、閉塞性疾病、血栓形成、脫發(fā)、腎炎、血管炎、視網膜炎、葡萄膜炎、鞏膜炎、硬化性膽管炎、垂體炎、甲狀腺炎、感染性休克、全身性炎癥反應綜合征(SIRS),中毒性休克綜合征、急性肺損傷、ARDS(成人呼吸窘迫綜合征)、急性腎衰竭、燒傷、胰腺炎(例如,急性胰腺炎)、手術后綜合征、結節(jié)病、赫克斯海默反應、腦炎、脊髓炎、髓膜炎和瘧疾。在一些實施方案中,所述疾病為急性或慢性胰腺炎。在一些實施方案中,所述疾病為燒傷。在一些實施方案中,所述疾病為炎性腸疾病。在一些實施方案中,所述疾病為神經炎癥。在一些實施方案中,所述疾病為敗血癥或敗血癥綜合征。在一些實施方案中,所述疾病為移植物抗宿主病(GVHD)。
在一些實施方案中,所述疾病為自身免疫性疾病(例如,本發(fā)明所述的自身免疫性疾病)。在一些實施方案中,所述疾病為類風濕性關節(jié)炎。在一些實施方案中,所述疾病為牛皮癬、系統性紅斑狼瘡、白癲風、大皰性皮膚病。
在一些實施方案中,所述疾病為心血管疾病。在一些實施方案中,所述疾病為動脈粥樣硬化形成或動脈粥樣硬化。在一些實施方案中,所述疾病為動脈支架阻塞、心力衰竭(例如,充血性心力衰竭)、冠狀動脈疾病、心肌炎、心包炎、心臟瓣膜疾病、狹窄、再狹窄、支架內狹窄、心絞痛、心肌梗塞、急性冠狀動脈綜合癥、冠狀動脈旁路搭橋術、心肺轉流術、內毒素血癥、缺血-再灌注損傷、腦血管缺血(中風)、腎臟再灌注損傷、栓塞(例如,肺栓塞、腎栓塞、肝栓塞、胃腸道栓塞或外周肢體栓塞)或心肌缺血。
在一些實施方案中,所述疾病為病毒感染。在一些實施方案中,所述疾病為DNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為dsDNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為ssDNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為RNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為dsRNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為a(+)ssRNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為a(-)ssRNA病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為逆轉錄(RT)病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為ssRNA-RT病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為dsDNA-RT病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為人類免疫缺陷病毒(HIV)引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為獲得性免疫缺陷綜合征(AIDS)引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為人乳頭狀瘤病毒(HPV)引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為丙型肝炎病毒(HCV)引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為皰疹病毒(例如,單純皰疹病毒(HSV))引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為埃波拉病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為重癥急性呼吸綜合征(SARS)引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為流感病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為流感病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為甲型流感病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為人流感(例如,H1N1、H2N2、H3N2、H5N1、H7N7、H1N2、H9N2、H7N2、H7N3或H10N7病毒引起的人流感)。在一些實施方案中,所述疾病為禽流感(例如,H5N1或H7N9病毒引起的禽流感)。在一些實施方案中,所述疾病為豬流感(例如,H1N1、H1N2、H2N1、H3N1、H3N2、H2N3或丙型流感病毒引起的豬流感)。在一些實施方案中,所述疾病為馬流感(例如,H7N7或H3N8病毒引起的馬流感)。在一些實施方案中,所述疾病為犬流感(例如,H3N8病毒引起的犬流感)。在一些實施方案中,所述疾病為乙型流感病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為丙型流感病毒引起的感染。在一些實施方案中,所述疾病為登革熱、登革出血熱(DHF)、登革熱休克綜合征(DSS)、甲型肝炎、乙型肝炎、丁型肝炎、戊型肝炎、己型肝炎、柯薩奇A病毒引起的感染、柯薩奇B病毒引起的感染、暴發(fā)性病毒性肝炎、病毒性心肌炎、副流感病毒引起的感染、RS病毒(RSV)引起的感染(例如,RSV細支氣管炎、RSV肺炎,尤其是RSV引起的嬰兒和兒童感染和在具有心肺障礙患者中的RSV肺炎)、麻疹病毒引起的感染、水皰性口炎病毒引起的感染、狂犬病毒引起的感染、日本腦炎、胡寧病毒引起的感染、人巨細胞病毒引起的感染、水痘病毒引起的感染、巨細胞病毒引起的感染、鼠巨細胞病毒引起的感染、長鼻動物病毒引起的感染(proboscivirus infection)、玫瑰疹病毒引起的感染、淋巴隱病毒引起的感染、瑪卡病毒引起的感染(macavirus infection)、馬皰疹病毒(percavirus)引起的感染、棒狀病毒(rhadinovirus)引起的感染、脊髓灰質炎病毒引起的感染、馬爾堡病毒引起的感染、拉沙熱病毒引起的感染、委內瑞拉馬腦炎、立谷熱病毒引起的感染、朝鮮出血熱病毒引起的感染、克里米亞-剛果出血熱病毒引起的感染、腦炎、圣路易腦炎(Saint Louise encephalitis)、基亞薩努森林病、墨累山谷腦炎、蜱傳腦炎、西尼羅河腦炎、黃熱病、腺病毒引起的感染、痘病毒引起的感染或免疫障礙患者中的病毒感染。
在一些實施方案中,所述疾病為纖維化病癥。在一些實施方案中,所述疾病選自腎纖維化、手術后狹窄、瘢痕疙瘩形成、肝硬化、膽汁性肝硬化和心纖維化。在一些實施方案中,所述疾病為硬皮病。在一些實施方案中,所述疾病為特發(fā)性肺纖維化。
在一些實施方案中,所述疾病為內分泌疾病。在一些實施方案中,所述疾病為艾迪生病。
在一些實施方案中,所述疾病為神經性疾病(例如,阿爾茨海默氏病)。
在一些實施方案中,所述疾病為代謝疾病。在一些實施方案中,所述疾病為糖尿病。在一些實施方案中,所述疾病為I型糖尿病。在一些實施方案中,所述疾病為II型糖尿病或妊娠糖尿病。在一些實施方案中,所述疾病為肥胖癥。在一些實施方案中,所述疾病為脂肪肝(NASH或其他)、惡病質、高膽固醇血癥或經載脂蛋白A1(APOA1)調節(jié)的脂質代謝的障礙。
在一些實施方案中,所述疾病為輻射中毒。在一些實施方案中,所述疾病為輻射性損傷。
在一些實施方案中,所述疾病為移植器官的急性排斥或多器官功能障礙綜合征。
在另一方面,本發(fā)明提供了在有此需要的受試者中預防本發(fā)明所述的疾病的方法。
在其他方面,本發(fā)明提供了在有此需要的受試者中降低罹患本發(fā)明所述的疾病的風險的方法。
在其他方面,本發(fā)明提供了在有此需要的男性受試者中男性避孕的方法。
在其他方面,本發(fā)明提供了在有此需要的受試者中抑制精子形成的方法。
本發(fā)明的其他方面涉及一種抑制病毒復制的方法。在一些實施方案中,所述病毒的復制被本發(fā)明方法制劑。
在一些實施方案中,本文所述病毒是體外的。在一些實施方案中,所述病毒是離體的。在一些實施方案中,所述病毒是體內的。
本發(fā)明的其他方面涉及一種殺死病毒的方法。在一些實施方案中,所述病毒被本發(fā)明方法殺死。
本發(fā)明的另一方面涉及在受試者中抑制含溴結構域蛋白和免疫球蛋白(Ig)調控元件之間相互作用的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及在細胞中抑制含溴結構域蛋白和免疫球蛋白(Ig)調控元件之間相互作用的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及在受試者中誘導細胞凋亡(例如,癌細胞的細胞凋亡)的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及誘導細胞(例如,體外細胞、癌細胞)細胞凋亡的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及在受試者中用于誘導G1阻滯的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及在細胞中用于誘導G1阻滯的方法。
在一些實施方案中,本發(fā)明方法包括給藥有此需要的受試者有效量的本申請所述的化合物或藥物組合物。在一些實施方案中,本發(fā)明方法包括給藥有此需要的受試者治療有效量的本申請所述的化合物或藥物組合物。在一些實施方案中,本發(fā)明方法包括給藥有此需要的受試者預防有效量的本申請所述的化合物或藥物組合物。在一些實施方案中,本發(fā)明方法包括使細胞接觸有效量的本申請所述的化合物或藥物組合物。在一些實施方案中,本發(fā)明方法包括使病毒接觸有效量的本申請所述的化合物或藥物組合物。
本發(fā)明的另一方面涉及在受試者中調控由含溴結構域蛋白調控的基因表達的方法。
本發(fā)明的另一方面涉及在細胞中調控由含溴結構域蛋白調控的基因表達的方法。
篩選化合物庫的方法
本發(fā)明的其他方面涉及篩選化合物及其藥學上可接受的鹽的庫的方法,以鑒定可用于本發(fā)明方法的化合物或其藥學上可接受的鹽。在一些實施方案中,所述篩選庫的方法包括獲得至少兩個不同的本申請所述的化合物;并使用所述不同的本申請所述的化合物進行至少一個測試。在一些實施方案中,至少至少一個測試可用于鑒定可用于本發(fā)明方法的化合物。
通常,所述篩選化合物庫的方法包括至少一個測試。在一些實施方案中,進行所述測試以檢測一個或多個以下特征:與治療和/或預防本發(fā)明所述的疾病有關的特征、與抑制含溴結構域蛋白的活性有關的特征、與抑制溴結構域的活性有關的特征、與抑制溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合有關的特征、與調節(jié)(例如,抑制)轉錄延伸有關的特征、或與調節(jié)(例如,抑制)由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)有關的特征、與誘導細胞凋亡有關的特征,和/或與誘導G1阻滯有關的特征。所述特征可為所需特征(例如,疾病已被治療、疾病已被預防、出現疾病的風險已被降低、病毒復制已被抑制、病毒已被殺死、含溴結構域蛋白的活性已被抑制、溴結構域的活性已被抑制、溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙?;?賴氨酸殘基的結合已被抑制、轉錄延伸已被調節(jié)(例如,已被抑制)、由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)已被調節(jié)(例如,已被抑制)、細胞凋亡已被誘導、或G1阻滯已被誘導)。所述特征可為不期望的特征(例如,疾病尚未被治療、疾病尚未被預防、出現疾病的風險尚未降低、病毒復制尚未被抑制、病毒尚未被殺死、含溴結構域蛋白的活性尚未被抑制、溴結構域的活性尚未被抑制、溴結構域和第二蛋白(例如,組蛋白)的乙酰基-賴氨酸殘基的結合尚未被抑制、轉錄延伸尚未被調節(jié)(例如,尚未被抑制)、由含溴結構域蛋白調控的基因的表達(例如,轉錄)尚未被調節(jié)(例如,尚未被抑制)、細胞凋亡尚未被誘導、或G1阻滯尚未被誘導)。所述測試可為免疫測試,例如雙抗體夾心測試、競爭結合測試、一步直接測試、兩步測試或蛋白印跡測試。進行至少一個測試的步驟可以自動或手動進行。在一些實施方案中,所述測試包括(a)使化合物庫與含溴結構域蛋白接觸;和(b)檢測化合物庫和含溴結構域蛋白的結合。在一些實施方案中,所述測試包括檢測化合物庫和含溴結構域蛋白的特異性結合。在一些實施方案中,所述測試包括檢測化合物庫和含溴結構域蛋白的溴結構域的特異性結合。在一些實施方案中,所檢測的化合物庫和所述含溴結構域蛋白的特異性結合可用于鑒定可用于本發(fā)明方法的化合物。在一些實施方案中,檢測結合的步驟包括使用差示掃描熒光測定法(DSF)、等溫滴定量熱法(ITC)和/或光激化學發(fā)光免疫分析(amplified luminescence proximity homogeneous assay,ALPHA)。進行至少一個測試的步驟可以在細胞中(例如,癌癥細胞中)在體外、離體或體內進行。在一些實施方案中,進行至少一個測試的步驟在細胞中(例如,癌癥細胞中)在體外進行。在一些實施方案中,所述測試包括(a)使化合物庫接觸細胞;和(b)檢測細胞增殖的降低、細胞死亡的增加和/或細胞分化的增加。在一些實施方案中,所述細胞死亡為凋亡性細胞死亡。在一些實施方案中,所述細胞分化通過檢測細胞角蛋白表達的增加來鑒定。在一些實施方案中,進行至少一個測試的步驟還包括檢測轉錄延伸的減少。
使用
在另一個方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明化合物,其用于本發(fā)明的方法。
在其他方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明藥物組合物,其用于本發(fā)明的方法。
在其他方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明化合物在本發(fā)明的方法中的用途。
在其他方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明藥物組合物在本發(fā)明的方法中的用途。
實施例
為了更充分地理解本發(fā)明,闡述了以下實施例。在本申請中所述的合成和生物實施例是為了舉例說明本文提供的化合物、藥物組合物和方法,而不應被解釋為以任何方式限制它們的范圍。
實施例1.化合物的制備
本發(fā)明化合物可以從容易獲得的起始原料開始使用以下通用方法和操作或本領域已知的方法制備。將理解,當給出典型或優(yōu)選的操作條件(即,反應溫度、時間、反應物摩爾比、溶劑、壓力等)時,其他操作條件也可以使用,除非另外指出。最優(yōu)反應條件可隨著所用的具體反應物或溶劑而改變,而且該條件可以由本領域技術人員通過常規(guī)優(yōu)化操作確定。
在示例性的合成中,表1-3中的化合物使用方案2中所示的步驟合成。
方案2.示例性的本文所述化合物的示例性的合成
在方案2中,XPHOS為2-二環(huán)己基膦-2′,4′,6′-三異丙基聯苯。
等效物和范圍
在權利要求中,例如“一個”、“該”和“所述”可能是指一個或一個以上,除非上下文中有相反的指示或其他明確指示。對于在一或多個組成員之間包含“或”的權利要求或說明書,如果所述組的一個、一個以上或全部成員均存在、采用或與給定產物或過程在其他方面相關,則被認為是令人滿意的,除非上下文中有相反的指示或其他明確指示。本發(fā)明包括實施方案,其中該組中僅有一個成員存在、采用或與給定產物或過程在其他方面相關。本發(fā)明包括實施方案,其中該組中一個以上或全部成員存在、采用或與給定產物或過程在其他方面相關。
此外,本發(fā)明包括所有的變化、組合和排列,其中一個或多個所列權利要求中的一個或多個限制、要素、字句和描述性術語被引入到另一權利要求中。例如,從屬于另一權利要求的任意權利要求可被修改以包括從屬于同一基礎權利要求的任意其他權利要求中可見的一種或多種限定。當要素以列表呈現,例如,以馬庫什組形式,該要素的各子集也均被公開,且任意要素可從該組中除去。應理解,在一般情況下,當本發(fā)明或本申請所述的各方面被指定包括具體要素和/或特征時,本申請所述的一些實施方案或本申請所述的各方面由這種要素和/或特征組成,或基本上由這種要素和/或特征組成。出于簡明的目的,那些實施方案在本文中并沒有用文字具體提及。還應注意,術語“包括”和“包含”旨在是開放性的且允許包括其他要素或步驟。當給出范圍時,包括端點。此外,除非另外提及或在上下文和本領域技術人員的理解中有其他明確指示,用范圍表達的值可采用在本申請所述的不同實施方案中所陳述的范圍內的任意具體值或子范圍,至該范圍的下限單位的十分之一,除非上下文中另有明確說明。
本申請是指各種出版的專利、公開的專利申請、期刊和其他出版物,將其全部引入本文作為參考。如果在所引用的任意參考文獻和本申請之間存在沖突,應以本說明書為準。此外,落入現有技術中的本發(fā)明的任意具體實施方案可從任一項或多項權利要求中明確排除。因為這種實施方案被認為是本領域技術人員已知的,即使該排除在本文中未明確提及,它們也可被排除。本申請所述的任意具體實施方案可出于任意原因從任意權利要求中排除,無論是否涉及現有技術的存在。
本領域技術人員將理解或能夠通過使用不超出常規(guī)的實驗確定出許多與本文所述具體實施方案相當的內容。本文所述的具體實施方案的范圍不旨在被上述說明書所限定,而是在所附權利要求中提及。那些本領域技術人員將理解,在不背離本發(fā)明的精神或范圍內可對本說明書進行各種變化和修飾,如權利要求所限定的那樣。