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CRISPR/Cas9靶向敲除人PD?1基因及其特異性gRNA的制作方法

文檔序號(hào):12167130閱讀:來源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.在CRISPR-Cas9 特異性敲除人PD-1基因中用于靶向人PD-1基因的 gRNA,所述 gRNA 在人PD-1基因上的靶序列符合 5’- N (20)-NGG3’ 或 者 5’-CCN- N (20)N-3’的序列排列規(guī)則,在人PD-1基因上的靶序列是唯一的,其特征在于:所述 gRNA 在人PD-1基因的靶向位點(diǎn)位于人PD-1基因的第2外顯子上。

2.根據(jù)權(quán)利要求 1所述的在 CRISPR-Cas9 特異性敲除人PD-1基因中用于靶向人PD-1基因的 gRNA,其特征在于:其對(duì)應(yīng)的 DNA 序列如序列表 SEQ ID NO. 1-18任意一條序列所示。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的在 CRISPR-Cas9 特異性敲除人PD-1基因中用于靶向人PD-1基因的 gRNA,其特征在于:該gRNA在腫瘤細(xì)胞治療中具有廣泛的應(yīng)用前景。

4.CRISPR-Cas9 特異性敲除人PD-1基因的方法,具體涉及如下步驟 :

4.1如權(quán)利要求 1-3 任意一項(xiàng)所述的 gRNA,在其對(duì)應(yīng) DNA 序列的 5’末端加上 CACC 得到正向寡核苷酸序列,在其互補(bǔ)鏈的 5’末端加上 AAAC 得到反向寡核苷酸序列,分別合成正向和反向寡核苷酸序列,然后將合成的序列變性、退火,得到具有 BbsI 粘性末端的雙鏈 DNA 片段 ;

4.2將步驟(1)中合成的雙鏈 DNA 片段和用 BbsI 酶切過的px458 載體進(jìn)行連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5a中,涂布于帶有氨芐青霉素抗性的LB平板上,篩選陽性菌落,提取陽性菌落質(zhì)粒進(jìn)行分析及測(cè)序,確定gRNA 表達(dá)載體構(gòu)建成功,命名為 px458- PD-1 -gRNA ;

4.3將步驟(2)構(gòu)建的px458-PD-1-gRNA 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染人T淋巴細(xì)胞,用PX458空載體(pSpCas9(BB)),同時(shí)也轉(zhuǎn)染人T淋巴細(xì)胞作為對(duì)照;

4.4將步驟(3)中轉(zhuǎn)染24小時(shí)后的細(xì)胞收集,流式分選出GFP標(biāo)記的細(xì)胞,提取DNA,PCR擴(kuò)增PD-1靶位點(diǎn)區(qū)域,T7E1酶切鑒定靶位點(diǎn)的突變效率,篩選得到敲除效率較高的靶位點(diǎn)。

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