號德耳塔（A)意為缺失。包 括上標減號的縮寫（ListeriaActAO意指actA基因突變，例如通過缺失、點突變或移碼突 變的方式，但是不限于這些突變類型。
[0057] "施用"當其適用于人、哺乳動物、哺乳動物受試者、動物、獸醫(yī)受試者、安慰劑受試 者、研宄受試者、實驗受試者、細胞、組織、器官或生物流體時，指但不限于外源配體、試劑、 安慰劑、小分子、藥物試劑、治療劑、診斷劑或組合物與受試者、細胞、組織、器官或生物流體 等的接觸。例如，"施用"可指治療、藥代動力學、診斷、研宄、安慰劑和實驗方法。細胞的治 療涵蓋試劑與細胞接觸，以及試劑與流體接觸，其中所述流體與細胞接觸。"施用"還涵蓋通 過試劑、診斷、結合組合物或通過另一種細胞對（例如）細胞的體外和體內治療。
[0058] "激動劑"當其涉及配體和受體時，包括刺激受體的分子、分子組合、復合物或試劑 的組合。例如，粒細胞-巨噬細胞菌落刺激因子（GM-CSF)的激動劑可涵蓋GM-CSF、GM-CSF 的突變蛋白質或衍生物、GM-CSF的肽模擬物、模擬GM-CSF的生物功能的小分子或刺激 GM-CSF受體的抗體。
[0059] "拮抗劑"當其涉及配體和受體時，包括抑制、抵抗、下調受體和/或使受體脫敏的 分子、分子組合或復合物。"拮抗劑"涵蓋抑制受體的固有活性的任何試劑。固有活性是 在缺乏配體/受體相互作用時明顯的活性。"拮抗劑"還涵蓋抑制或防止受體受刺激（或 調節(jié)）的活性的任何試劑。舉例而言，未暗示任何限制，GM-CSF受體的拮抗劑包括與配體 (GM-CSF)結合并防止其與受體結合的抗體，或與受體結合并防止配體與受體結合的抗體， 或其中抗體將受體鎖于非活性構象。
[0060] 如本文所使用，關于肽、多肽或蛋白質的"類似物"或"衍生物"指擁有與原始肽、多 肽或蛋白質相似或相同的功能，但是不一定包含原始肽、多肽或蛋白質的相似或相同氨基 酸序列或結構的另一種肽、多肽或蛋白質。類似物優(yōu)選滿足下列至少一項：(a)氨基酸序列 與原始氨基酸序列至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少 60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95 %或至少 99%相同的蛋白劑；(b)由在嚴格條件下與編碼原始氨基酸序列的核苷酸序列雜交的核苷 酸序列編碼的蛋白劑；和（c)由與編碼原始氨基酸序列的核苷酸序列至少30%、至少35%、 至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至 少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列編碼的蛋白劑。 [0061] "抗原呈遞細胞"（APC)是免疫系統用于將抗原呈遞到T細胞的細胞。APC包括樹 突細胞、單核細胞、巨噬細胞、邊緣區(qū)庫普弗細胞（KupfTercell)、小膠質細胞、朗格漢斯細 胞（Langerhanscell)、T細胞和B細胞。樹突細胞在至少兩個譜系中出現。第一個譜系 涵蓋前體DC1、骨髓DCl和成熟DC1。第二個譜系涵蓋⑶341〇45狀_早期祖細胞多能細胞、 0)34+0045狀 +細胞、0)34+0)45狀+004+11-31?(1 +前體〇02細胞、0)4+0011(^類漿前體002細 胞、人淋巴DC2類漿細胞源性DC2和成熟DC2。
[0062] "減毒"和"減毒的"涵蓋經修飾以降低對宿主的毒性的細菌、病毒、寄生蟲、傳染 性生物、朊病毒、腫瘤細胞、傳染性生物中的基因等。宿主可為人或動物宿主，或器官、組織 或細胞。舉一個非限制性實例，細菌可被減毒以減少與宿主細胞的結合，減少從一個宿主細 胞向另一宿主細胞的傳播，減少細胞外生長，或減少在宿主細胞中的細胞內生長。通過測量 (例如）毒性標記、LD5tl、從器官中清除的速率或競爭指數（見，例如，Auerbuch等（2001) Infect.Immunity69:5953-5957)，評定減毒。通常，減毒導致LD5tl增加和/或清除速率增 加至少25% ;更通常為至少50% ;最通常為至少100% (2倍）；正常為至少5倍；更正常為 至少10倍；最正常為至少50倍；常常為至少100倍；更常為至少500倍；并且最常為至少 1000倍；一般為至少5000倍；更一般為至少10, 000倍；并且最一般為至少50, 000倍；并且 最常為至少100, 〇〇〇倍。
[0063] "減毒基因"涵蓋介導對宿主、宿主內生長或宿主內存活的毒性、病理或毒力的基 因，其中所述基因以減輕、降低或消除毒性、病理或毒力的方式突變?？赏ㄟ^比較由突變基 因介導的與由非突變（或親本）基因介導的毒力或毒性評估所述降低或消除。"突變基因" 涵蓋基因調控區(qū)、基因編碼區(qū)、基因非編碼區(qū)或其任何組合中的缺失、點突變和移碼突變。 [0064] "保守修飾變體"適用于氨基酸和核酸序列。就特定核酸序列而論，保守修飾變體 指編碼相同氨基酸序列或具有一個或多個保守性取代的氨基酸序列的核酸。保守性取代的 實例為下列其中一組中的氨基酸交換為同一組的另一種氨基酸（頒發(fā)給Lee等的美國專利 第 5, 767, 063 號；Kyte和Doolittle(1982)J.Mol.Biol. 157:105-132)。
[0065] (1)疏水性：正亮氨酸、lie、Val、Leu、Phe、Cys、Met;
[0066] (2)中性親水性：Cys、Ser、Thr;
[0067] (3)酸性：Asp、Glu;
[0068] (4)喊性：Asn、Gin、His、Lys、Arg;
[0069] (5)影響鏈取向的殘基：Gly、Pro;
[0070] (6)芳香族：Trp、Tyr、Phe;和
[0071] (7)小氨基酸：Gly、Ala、Ser〇
[0072] "有效量"涵蓋但不限于可改善、逆轉、緩和、預防或診斷醫(yī)療病狀或病癥的癥狀或 跡象的量。除非明確地或由上下文另外規(guī)定，"有效量"不限于足以改善病狀的最小量。
[0073] "胞外液"涵蓋，例如血清、血漿、血液、間質液、腦脊髓液、分泌液、淋巴液、膽汁、汗 液、糞便物和尿液。"胞外液"可包括膠體或懸浮液，例如全血或凝固的血。
[0074] 術語"片段"在多肽的上下文中包括如下的肽或多肽，其包含較大多肽的氨基酸序 列的至少5個連續(xù)氨基酸殘基、至少10個連續(xù)氨基酸殘基、至少15個連續(xù)氨基酸殘基、至 少20個連續(xù)氨基酸殘基、至少25個連續(xù)氨基酸殘基、至少40個連續(xù)氨基酸殘基、至少50 個連續(xù)氨基酸殘基、至少60個連續(xù)氨基酸殘基、至少70個連續(xù)氨基酸殘基、至少80個連續(xù) 氨基酸殘基、至少90個連續(xù)氨基酸殘基、至少100個連續(xù)氨基酸殘基、至少125個連續(xù)氨基 酸殘基、至少150個連續(xù)氨基酸殘基、至少175個連續(xù)氨基酸殘基、至少200個連續(xù)氨基酸 殘基或至少250個連續(xù)氨基酸殘基的氨基酸序列。
[0075] "基因"指編碼寡肽或多肽的核酸序列。寡肽或多肽可具生物活性、抗原活性、無 生物活性或無抗原活性，等等。術語基因涵蓋（例如）編碼特定寡肽或多肽的開放閱讀框 (ORF)的總和；ORF加上編碼內含子的核酸的總和；ORF和可操作性連接的啟動子的總和； ORF和可操作性連接的啟動子與任何內含子的總和；ORF和可操作性連接的啟動子、內含子 和啟動子和其它調控元件（例如增強子）的總和。在某些實施方案中，"基因"涵蓋調芐基 因表達所需的任何順式序列。術語基因也可指編碼涵蓋抗原的肽或肽、寡肽、多肽或蛋白質 的抗原活性片段的核酸。術語基因不一定暗示編碼的肽或蛋白質具有任何生物活性，或甚 至肽或蛋白質具抗原活性。通常將編碼不可表達序列的核酸序列視為假基因。術語基因還 涵蓋編碼核糖核酸例如rRNA、tRNA或核酶的核酸序列。
[0076] 細菌例如李斯特菌的"生長"涵蓋但不限于細菌生理學功能和涉及定植、復制、蛋 白質含量增加和/或脂質含量增加的基因功能。除非明確地或由上下文另外說明，李斯特 菌的生長涵蓋細菌在宿主細胞外的生長并且也涵蓋細菌在宿主細胞內的生長。沒有暗示任 何限制，生長相關基因包括介導能量產生（例如，糖酵解、克雷布斯循環(huán)（Krebscycle)、細 胞色素）、氨基酸、糖類、脂質、礦物質、嘌呤和嘧啶的同化和/或異化作用、養(yǎng)分運輸、轉錄、 翻譯和/或復制的基因。在一些實施方案中，李斯特菌的"生長"指李斯特菌的胞內生長， 即在宿主細胞例如哺乳動物細胞內的生長。雖然可通過光學顯微鏡或菌落形成單位（CFU) 測定來測量李斯特菌的胞內生長，但是生長不受任何測量技術限制。生物化學參數例如李 斯特菌抗原的量、李斯特菌核酸序列或對李斯特菌有特異性的脂質，均可用于評估生長。在 一些實施方案中，介導生長的基因是特異性介導胞內生長的基因。在一些實施方案中，特異 性介導胞內生長的基因涵蓋但不限于基因的滅活降低了胞內生長速率，但是未顯著、大幅 或明顯降低胞外生長（例如，在肉湯中生長）速率的基因，或基因的滅活降低胞內生長速率 的程度比其降低胞外生長速率更高的基因。為提供非限制性實例，在一些實施方案中，滅 活降低胞內生長速率的程度比胞外生長更高的基因涵蓋滅活降低胞內生長至低于正?；?最大值50%，但是降低胞外生長至最大值的僅1-5%、5-10%或10-15%的情況。在某些方 面，本發(fā)明涵蓋在胞內生長中減毒，但是在胞外生長中未減毒的李斯特菌，在胞內生長中未 減毒和在胞外生長中未減毒的李斯特菌，以及在胞內生長中未減毒和在胞外生長中減毒的 李斯特菌。
[0077] 可通過光譜、光化學、生物化學、免疫化學、同位素或化學方法直接或間接檢測"經 標記"的組合物。例如，有用的標記包括 3牛、3午、355、14(：、311、 1251、穩(wěn)定同位素、表位標簽、熒光 染料、電子致密試劑、底物或酶（例如用于酶聯免疫測定或fIuorettes)(見，例如Rozinov 和Nolan(1998)Chem.Biol.5:713-728)。
[0078] "配體"指為受體的激動劑或拮抗劑的小分子、肽、多肽或膜相關或膜結合分子。 "配體"也涵蓋非激動劑或拮抗劑并且無激動劑或拮抗劑性質的結合劑。常規(guī)地，配體在第 一細胞上與膜結合時，受體