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一種燕窩制品實(shí)時熒光pcr鑒定方法_3

文檔序號:9823104閱讀:來源:國知局
凈的2ml離心管中,加入等體積的三氯甲烷和異戊醇的混合液(24:1),顛倒混勻;
[0085]D.12000g離心lOmin,取上清至干凈的2ml離心管中,加入等體積異丙醇,顛倒混勻;
[0086]E.12000g離心lOmin,棄去上清液,用4°C預(yù)冷的70%乙醇500 μ L,渦旋清洗沉淀;
[0087]F.12000g離心lOmin,棄去上清液,倒置曬干后加100 μ L TE緩沖液溶解沉淀,-20 °C保存?zhèn)溆谩?br>[0088]步驟二,DNA濃度和純度的測定
[0089]提取到DNA 的 A260/A280 比值為 1.84,DNA 濃度為 154ng/ μ L,稀釋到 50ng/ μ L。
[0090]步驟三,待檢燕窩制品中金絲燕成分實(shí)時熒光PCR擴(kuò)增;
[0091]A.配置真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因引物和探針:
[0092]a.真核生物18S rRNA基因
[0093]上游引物18S-F:5’ -CCTGAGAAACGGCTACCAC-3’,濃度 10 μ mol/L ;
[0094]下游引物18S-R:5’ -CGTGTCAGGATTGGGTAAT-3’,濃度 10 μ mol/L ;
[0095]TaqMan 探針 18S-P:5’ -FAM-TGCGCGCCTGCTGCCTTCCT-TAMRA-3,,濃度 10 μ mol/L。
[0096]b.金絲燕12S rRNA基因
[0097]上游引物SWT-F:5’ -GTCGCCAGTTCACCTCCCC-3’,濃度 10 μ mol/L ;
[0098]下游引物SWT-R:5,-ATCGRTTMTAGAACAGGCTCCTCTAG-3,,濃度 10 μ mol/L ;
[0099]Taqman 探針 SWT-P: 5,-FAM-CCYACCCGCTAACAAGACAGGTCAAGGTAT-TAMRA-3,,濃度10 μmol/L。
[0100]B.在PCR反應(yīng)管中加入2XPCR Master Mix 12.5 μ L,上游引物和下游引物各0.5 μ L,Taqman探針0.5 μ L,50ng/ μ L待測待檢燕窩制品的DNA 2 μ L,補(bǔ)充雙蒸水至25 μ L,混勻;
[0101]C.將PCR反應(yīng)管放入熒光定量PCR儀,按下述反應(yīng)條件完成PCR擴(kuò)增:
[0102]95 °C 2min,I個循環(huán),預(yù)變性;
[0103]950C 15sec ;60°C 40sec,45 個循環(huán),PCR 擴(kuò)增。
[0104](4)應(yīng)用熒光定量PCR儀隨機(jī)軟件,分析擴(kuò)增結(jié)果:參見圖2和圖3,
[0105]A.陽性對照的真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值分別為15.45和16.15,滿足要求;
[0106]B.陰性對照的真核生物18S rRNA基因出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值為18.09(見圖1);金絲燕12S rRNA基因未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值彡40,滿足要求;
[0107]C.空白對照的真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因都未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值Ct值彡40,滿足要求;
[0108]D.待檢燕窩制品的真核生物18S rRNA基因?qū)崟rPCR檢測結(jié)果出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值為17.75和16.93,滿足要求;
[0109]E.待檢燕窩制品的金絲燕12S rRNA基因?qū)崟rPCR檢測結(jié)果出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值15.25和15.10,據(jù)此可判定該待檢燕窩制品檢出燕窩成分。
[0110]具體實(shí)施2
[0111]待檢燕窩制品為某品牌冰糖燕窩,購于大型超市
[0112]步驟一,DNA提??;
[0113]A.取待檢燕窩制品(冰糖燕窩)5g至50mL離心管中,12000g離心lOmin,棄去上清,加入1mL預(yù)熱的CTAB裂解緩沖液和40 μ L蛋白酶K,輕輕混勻后,65 °C水浴保溫45min ;
[0114]B.12000g離心5min,取上清于另一干凈的50ml離心管中,加入等體積的酸,三氯甲烷和異戊醇的混合液(25:24:1),震蕩混勻;
[0115]C.12000g離心5min,取上清至干凈的2ml離心管中,加入等體積的三氯甲烷和異戊醇的混合液(24:1),顛倒混勻;
[0116]D.12000g離心5min,取上清至干凈的2ml離心管中,加入等體積預(yù)冷異丙醇,顛倒混勻;
[0117]E.4°C下12000g離心lOmin,棄去上清液,用4°C預(yù)冷的70 %乙醇800 μ L,清洗沉淀;
[0118]F.12000g離心5min,棄去上清液,加入20 μ L RNA酶溶液,37°C溫育30min ;
[0119]G.加入600 μ L氯化鈉溶液,65°C溫浴1min ;加入600 μ L的的三氯甲烷和異戊醇的混合液(24:1),震蕩混勻;12000g離心5min,取上清至干凈的1.5ml離心管中,加入等體積預(yù)冷異丙醇,顛倒混勻;
[0120]H.4°C下12000g離心lOmin,棄去上清液,用4°C預(yù)冷的70%乙醇500 μ L,清洗沉淀;
[0121]1.12000g離心5min,小心棄去上清,用4°C預(yù)冷的70%乙醇重復(fù)洗一遍;
[0122]J.室溫下?lián)]發(fā)剩余液體;加入50 μ L的TE緩沖液溶解DNA,4°C保存?zhèn)溆谩?br>[0123]步驟二,DNA濃度和純度的測定;
[0124]提取到DNA 的 A260/A280 比值為 1.75,DNA 濃度為 63ng/ μ L,稀釋到 50ng/ μ L0
[0125]步驟三,待檢燕窩制品中金絲燕成分實(shí)時熒光PCR擴(kuò)增
[0126]Α.配置真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因引物和探針:
[0127]a.真核生物18S rRNA基因
[0128]上游引物18S-F:5’ -CCTGAGAAACGGCTACCAC-3 ’,濃度 10 ymol/L ;
[0129]下游引物18S-R:5’ -CGTGTCAGGATTGGGTAAT-3 ’,濃度 10 ymol/L ;
[0130]TaqMan 探針 18S-P:5’ -FAM-TGCGCGCCTGCTGCCTTCCT-TAMRA-3,,濃度 10 μ mol/L。
[0131]b.金絲燕12S rRNA基因
[0132]上游引物SWT-F:5’ -GTCGCCAGTTCACCTCCCC-3’,濃度 10 μ mol/L ;
[0133]下游引物SWT-R:5’ -ATCGRTTMTAGAACAGGCTCCTCTAG-3’,濃度 10 μ mol/L ;
[0134]Taqman 探針 SWT-P: 5,-FAM-CCYACCCGCTAACAAGACAGGTCAAGGTAT-TAMRA-3,,濃度10 μmol/L。
[0135]B.在PCR反應(yīng)管中加入2XPCR Master Mix 12.5 μ L,上游引物和下游引物各0.5 μ L,Taqman探針0.5 μ L,50ng/ μ L待測待檢燕窩制品的DNA 2 μ L,補(bǔ)充雙蒸水至
25μ L,混勻;
[0136]C.將PCR反應(yīng)管放入熒光定量PCR儀,按下述反應(yīng)條件完成PCR擴(kuò)增:
[0137]95 °C 2min,I個循環(huán),預(yù)變性;
[0138]950C 15sec ;60°C 40sec,45 個循環(huán),PCR 擴(kuò)增。
[0139](4)應(yīng)用熒光定量PCR儀隨機(jī)軟件,分析擴(kuò)增結(jié)果:參見圖4和圖5,
[0140]A.陽性對照的真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值分別為16.83和17.67,滿足要求;
[0141]B.陰性對照的真核生物18S rRNA基因出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值為16.74 ;金絲燕12SrRNA基因未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值多40,滿足要求;
[0142]C.空白對照的真核生物18S rRNA基因和金絲燕12S rRNA基因都未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值Ct值彡40,滿足要求;
[0143]D.待檢燕窩制品的真核生物18S rRNA基因?qū)崟rPCR檢測結(jié)果出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,Ct值為16.78和16.82,
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